PRKRA (англ. Protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 404.
PRKRA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PRKRA, DYT16, PACT, RAX, HSD14, protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603424 MGI: 1344375 HomoloGene: 2738 GeneCards: PRKRA | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
dystonia 16 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 178.43 – 178.45 Mb | Хр. 2: 76.46 – 76.48 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSQSRHRAEA | PPLEREDSGT | FSLGKMITAK | PGKTPIQVLH | EYGMKTKNIP | ||||
VYECERSDVQ | IHVPTFTFRV | TVGDITCTGE | GTSKKLAKHR | AAEAAINILK | ||||
ANASICFAVP | DPLMPDPSKQ | PKNQLNPIGS | LQELAIHHGW | RLPEYTLSQE | ||||
GGPAHKREYT | TICRLESFME | TGKGASKKQA | KRNAAEKFLA | KFSNISPENH | ||||
ISLTNVVGHS | LGCTWHSLRN | SPGEKINLLK | RSLLSIPNTD | YIQLLSEIAK | ||||
EQGFNITYLD | IDELSANGQY | QCLAELSTSP | ITVCHGSGIS | CGNAQSDAAH | ||||
NALQYLKIIA | ERK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Patel R.C., Sen G.C. (1998). PACT, a protein activator of the interferon-induced protein kinase, PKR. EMBO J. 17: 4379—4390. PMID 9687506 DOI:10.1093/emboj/17.15.4379
- Ito T., Yang M., May W.S. (1999). RAX, a cellular activator for double-stranded RNA-dependent protein kinase during stress signaling. J. Biol. Chem. 274: 15427—15432. PMID 10336432 DOI:10.1074/jbc.274.22.15427
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Peters G.A., Hartmann R., Qin J., Sen G.C. (2001). Modular structure of PACT: distinct domains for binding and activating PKR. Mol. Cell. Biol. 21: 1908—1920. PMID 11238927 DOI:10.1128/MCB.21.6.1908-1920.2001
- Peters G.A., Li S., Sen G.C. (2006). Phosphorylation of specific serine residues in the PKR activation domain of PACT is essential for its ability to mediate apoptosis. J. Biol. Chem. 281: 35129—35136. PMID 16982605 DOI:10.1074/jbc.M607714200
- Kok K.H., Ng M.-H., Ching Y.-P., Jin D.-Y. (2007). Human TRBP and PACT directly interact with each other and associate with dicer to facilitate the production of small interfering RNA. J. Biol. Chem. 282: 17649—17657. PMID 17452327 DOI:10.1074/jbc.M611768200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PRKRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9438 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url () - UniProt, O75569 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PRKRA angl Protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 313 aminokislot a molekulyarna masa 34 404 5 PRKRANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2DIXIdentifikatoriSimvoliPRKRA DYT16 PACT RAX HSD14 protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2Zovnishni ID OMIM 603424 MGI 1344375 HomoloGene 2738 GeneCards PRKRAPov yazani genetichni zahvoryuvannyadystonia 16 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding enzyme binding double stranded RNA binding GO 0010577 enzyme activator activity RNA binding pre miRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma membrana vnutrishnoklitinnij nukleoplazma perinuclear region of cytoplasm gialoplazma RISC loading complexBiologichnij proces skeletal system morphogenesis response to virus outer ear morphogenesis pre miRNA processing protein phosphorylation GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid middle ear morphogenesis cellular response to oxidative stress positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway negative regulation of cell population proliferation production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA GO 0048554 positive regulation of catalytic activity protein stabilization GO 0061715 miRNA metabolic process GO 0070919 production of siRNA involved in RNA interference Sajlensing geniv GO 0022415 viral process ear developmentDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8575 23992Ensembl ENSG00000180228 ENSMUSG00000002731UniProt O75569 Q9WTX2RefSeq mRNK NM 001139517 NM 001139518 NM 001316362 NM 003690NM 011871RefSeq bilok NP 001132989 NP 001132990 NP 001303291 NP 003681NP 036001Lokus UCSC Hr 2 178 43 178 45 MbHr 2 76 46 76 48 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSQSRHRAEAPPLEREDSGTFSLGKMITAKPGKTPIQVLHEYGMKTKNIP VYECERSDVQIHVPTFTFRVTVGDITCTGEGTSKKLAKHRAAEAAINILK ANASICFAVPDPLMPDPSKQPKNQLNPIGSLQELAIHHGWRLPEYTLSQE GGPAHKREYTTICRLESFMETGKGASKKQAKRNAAEKFLAKFSNISPENH ISLTNVVGHSLGCTWHSLRNSPGEKINLLKRSLLSIPNTDYIQLLSEIAK EQGFNITYLDIDELSANGQYQCLAELSTSPITVCHGSGISCGNAQSDAAH NALQYLKIIAERK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak RNK zalezhne zaglushennya geniv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi Literaturared Patel R C Sen G C 1998 PACT a protein activator of the interferon induced protein kinase PKR EMBO J 17 4379 4390 PMID 9687506 DOI 10 1093 emboj 17 15 4379 Ito T Yang M May W S 1999 RAX a cellular activator for double stranded RNA dependent protein kinase during stress signaling J Biol Chem 274 15427 15432 PMID 10336432 DOI 10 1074 jbc 274 22 15427 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Peters G A Hartmann R Qin J Sen G C 2001 Modular structure of PACT distinct domains for binding and activating PKR Mol Cell Biol 21 1908 1920 PMID 11238927 DOI 10 1128 MCB 21 6 1908 1920 2001 Peters G A Li S Sen G C 2006 Phosphorylation of specific serine residues in the PKR activation domain of PACT is essential for its ability to mediate apoptosis J Biol Chem 281 35129 35136 PMID 16982605 DOI 10 1074 jbc M607714200 Kok K H Ng M H Ching Y P Jin D Y 2007 Human TRBP and PACT directly interact with each other and associate with dicer to facilitate the production of small interfering RNA J Biol Chem 282 17649 17657 PMID 17452327 DOI 10 1074 jbc M611768200Primitkired Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z PRKRA pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9438 angl Procitovano 28 serpnya 2017 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z parametrom url status ale bez parametra archive url posilannya UniProt O75569 angl Arhiv originalu za 6 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhred Hromosoma 2 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Otrimano z https uk wikipedia org w index php title PRKRA amp oldid 43445429