PRIM2

PRIM2 (англ. Primase (DNA) subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 806.

PRIM2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L9Q, 3Q36, 4BPU, 4BPW, 4BPX, 4RR2, 5F0Q, 5EXR, 5F0S
Ідентифікатори
Символи	PRIM2, PRIM2A, p58, primase (DNA) subunit 2, DNA primase subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 176636 MGI: 97758 HomoloGene: 731 GeneCards: PRIM2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a, цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • transferase activity • DNA binding • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • iron-sulfur cluster binding • nucleotidyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • single-stranded DNA binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA primase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • alpha DNA polymerase:primase complex Біологічний процес • реплікація ДНК • DNA replication, synthesis of RNA primer • DNA biosynthetic process • telomere maintenance via semi-conservative replication • G1/S transition of mitotic cell cycle • DNA replication initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5558	19076
Ensembl	ENSG00000146143	ENSMUSG00000026134
UniProt	P49643	P33610
RefSeq (мРНК)	NM_000947 NM_001282487 NM_001282488	NM_008922
RefSeq (білок)	NP_000938 NP_001269416 NP_001269417	NP_032948
Локус (UCSC)	Хр. 6: 57.31 – 57.65 Mb	Хр. 1: 33.49 – 33.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEFSGRKWRK		LRLAGDQRNA		SYPHCLQFYL		QPPSENISLI		EFENLAIDRV
KLLKSVENLG		VSYVKGTEQY		QSKLESELRK		LKFSYRENLE		DEYEPRRRDH
ISHFILRLAY		CQSEELRRWF		IQQEMDLLRF		RFSILPKDKI		QDFLKDSQLQ
FEAISDEEKT		LREQEIVASS		PSLSGLKLGF		ESIYKIPFAD		ALDLFRGRKV
YLEDGFAYVP		LKDIVAIILN		EFRAKLSKAL		ALTARSLPAV		QSDERLQPLL
NHLSHSYTGQ		DYSTQGNVGK		ISLDQIDLLS		TKSFPPCMRQ		LHKALRENHH
LRHGGRMQYG		LFLKGIGLTL		EQALQFWKQE		FIKGKMDPDK		FDKGYSYNIR
HSFGKEGKRT		DYTPFSCLKI		ILSNPPSQGD		YHGCPFRHSD		PELLKQKLQS
YKISPGGISQ		ILDLVKGTHY		QVACQKYFEM		IHNVDDCGFS		LNHPNQFFCE
SQRILNGGKD		IKKEPIQPET		PQPKPSVQKT		KDASSALASL		NSSLEMDMEG
LEDYFSEDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9370 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6