POLR1C

POLR1C (англ. RNA polymerase I subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 250.

POLR1C
Ідентифікатори
Символи	POLR1C, RPA39, RPA40, RPA5, RPAC1, TCS3, AC40, RPC40, HLD11, polymerase (RNA) I subunit C, RNA polymerase I subunit C, RNA polymerase I and III subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 610060 MGI: 103288 HomoloGene: 3586 GeneCards: POLR1C
Пов'язані генетичні захворювання
hypomyelinating leukodystrophy 11, Синдром Тричера Коллінза, 4H leukodystrophy
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein dimerization activity • RNA polymerase III activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase I activity Клітинна компонента • гіалоплазма • нуклеоплазма • RNA polymerase III complex • клітинне ядро • RNA polymerase I complex Біологічний процес • transcription by RNA polymerase I • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter • positive regulation of type I interferon production Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9533	20016
Ensembl	ENSG00000171453	ENSMUSG00000067148
UniProt	O15160	P52432
RefSeq (мРНК)	NM_004875 NM_203290 NM_001318876 NM_001363658	NM_009085
RefSeq (білок)	NP_001305805 NP_976035 NP_001350587	NP_033111
Локус (UCSC)	Хр. 6: 43.51 – 43.56 Mb	Хр. 17: 46.55 – 46.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAASQAVEEM		RSRVVLGEFG		VRNVHTTDFP		GNYSGYDDAW		DQDRFEKNFR
VDVVHMDENS		LEFDMVGIDA		AIANAFRRIL		LAEVPTMAVE		KVLVYNNTSI
VQDEILAHRL		GLIPIHADPR		LFEYRNQGDE		EGTEIDTLQF		RLQVRCTRNP
HAAKDSSDPN		ELYVNHKVYT		RHMTWIPLGN		QADLFPEGTI		RPVHDDILIA
QLRPGQEIDL		LMHCVKGIGK		DHAKFSPVAT		ASYRLLPDIT		LLEPVEGEAA
EELSRCFSPG		VIEVQEVQGK		KVARVANPRL		DTFSREIFRN		EKLKKVVRLA
RVRDHYIFSV		ESTGVLPPDV		LVSEAIKVLM		GKCRRFLDEL		DAVQMD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Dammann R., Pfeifer G.P. (1998). Cloning and characterization of the human RNA polymerase I subunit hRPA40. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 153—157. PMID 9540830 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00206-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з POLR1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6