PHF8 (англ. PHD finger protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 117 864.
PHF8 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PHF8, JHDM1F, MRXSSD, ZNF422, PHD finger protein 8, KDM7B | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 300560 MGI: 2444341 HomoloGene: 49405 GeneCards: PHF8 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
біполярний афективний розлад, шизофренія, syndromic X-linked intellectual disability Siderius type | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
daminozide | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 53.94 – 54.05 Mb | Хр. X: 150.3 – 150.42 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNRSRAIVQR | GRVLPPPAPL | DTTNLAGRRT | LQGRAKMASV | PVYCLCRLPY | ||||
DVTRFMIECD | MCQDWFHGSC | VGVEEEKAAD | IDLYHCPNCE | VLHGPSIMKK | ||||
RRGSSKGHDT | HKGKPVKTGS | PTFVRELRSR | TFDSSDEVIL | KPTGNQLTVE | ||||
FLEENSFSVP | ILVLKKDGLG | MTLPSPSFTV | RDVEHYVGSD | KEIDVIDVTR | ||||
QADCKMKLGD | FVKYYYSGKR | EKVLNVISLE | FSDTRLSNLV | ETPKIVRKLS | ||||
WVENLWPEEC | VFERPNVQKY | CLMSVRDSYT | DFHIDFGGTS | VWYHVLKGEK | ||||
IFYLIRPTNA | NLTLFECWSS | SSNQNEMFFG | DQVDKCYKCS | VKQGQTLFIP | ||||
TGWIHAVLTP | VDCLAFGGNF | LHSLNIEMQL | KAYEIEKRLS | TADLFRFPNF | ||||
ETICWYVGKH | ILDIFRGLRE | NRRHPASYLV | HGGKALNLAF | RAWTRKEALP | ||||
DHEDEIPETV | RTVQLIKDLA | REIRLVEDIF | QQNVGKTSNI | FGLQRIFPAG | ||||
SIPLTRPAHS | TSVSMSRLSL | PSKNGSKKKG | LKPKELFKKA | ERKGKESSAL | ||||
GPAGQLSYNL | MDTYSHQALK | TGSFQKAKFN | ITGACLNDSD | DDSPDLDLDG | ||||
NESPLALLMS | NGSTKRVKSL | SKSRRTKIAK | KVDKARLMAE | QVMEDEFDLD | ||||
SDDELQIDER | LGKEKATLII | RPKFPRKLPR | AKPCSDPNRV | REPGEVEFDI | ||||
EEDYTTDEDM | VEGVEGKLGN | GSGAGGILDL | LKASRQVGGP | DYAALTEAPA | ||||
SPSTQEAIQG | MLCMANLQSS | SSSPATSSLQ | AWWTGGQDRS | SGSSSSGLGT | ||||
VSNSPASQRT | PGKRPIKRPA | YWRTESEEEE | ENASLDEQDS | LGACFKDAEY | ||||
IYPSLESDDD | DPALKSRPKK | KKNSDDAPWS | PKARVTPTLP | KQDRPVREGT | ||||
RVASIETGLA | AAAAKLAQQE | LQKAQKKKYI | KKKPLLKEVE | QPRPQDSNLS | ||||
LTVPAPTVAA | TPQLVTSSSP | LPPPEPKQEA | LSGSLADHEY | TARPNAFGMA | ||||
QANRSTTPMA | PGVFLTQRRP | SVGSQSNQAG | QGKRPKKGLA | TAKQRLGRIL | ||||
KIHRNGKLLL |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, активаторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Feng W., Yonezawa M., Ye J., Jenuwein T., Grummt I. (2010). PHF8 activates transcription of rRNA genes through H3K4me3 binding and H3K9me1/2 demethylation. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 445—450. PMID 20208542 DOI:10.1038/nsmb.1778
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PHF8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з PHD finger protein 8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20672 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PHF8 angl PHD finger protein 8 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 060 aminokislot a molekulyarna masa 117 864 PHF8Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4DO0 3K3O 2WWU 3K3N 3KV4 s2WWU 3K3N 3K3O 3KV4 4DO0IdentifikatoriSimvoliPHF8 JHDM1F MRXSSD ZNF422 PHD finger protein 8 KDM7BZovnishni ID OMIM 300560 MGI 2444341 HomoloGene 49405 GeneCards PHF8Pov yazani genetichni zahvoryuvannyabipolyarnij afektivnij rozlad shizofreniya syndromic X linked intellectual disability Siderius type Reaguye na spolukudaminozide Ontologiya genaMolekulyarna funkciya 2 oxoglutarate dependent dioxygenase activity iron ion binding histone H3 methyl lysine 9 demethylase activity histone H4 methyl lysine 20 demethylase activity chromatin binding dioxygenase activity zv yazuvannya z ionom metalu methylated histone binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding histone H3 methyl lysine 36 demethylase activity oxidoreductase activity histone H3 tri di methyl lysine 27 demethylase activity histone demethylase activity zinc ion bindingKlitinna komponenta yaderna membrana nukleoplazma yaderce klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated histone H3 K27 demethylation histone H3 K9 demethylation histone H4 K20 demethylation transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated brain development negative regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly histone H3 K36 demethylation klitinnij cikl positive regulation of transcription by RNA polymerase I G1 S transition of mitotic cell cycle GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23133 320595Ensembl ENSG00000172943 ENSMUSG00000041229UniProt Q9UPP1 Q80TJ7RefSeq mRNK NM 001184896 NM 001184897 NM 001184898 NM 015107NM 001113354 NM 177201RefSeq bilok NP 001171825 NP 001171826 NP 001171827 NP 055922NP 001106825 NP 796175Lokus UCSC Hr X 53 94 54 05 MbHr X 150 3 150 42 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNRSRAIVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPY DVTRFMIECDMCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKK RRGSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVE FLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTR QADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLS WVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEK IFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIP TGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNF ETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALP DHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGKTSNIFGLQRIFPAG SIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKGKESSAL GPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDG NESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLD SDDELQIDERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDI EEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPA SPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGT VSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEY IYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGT RVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLS LTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMA QANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRIL KIHRNGKLLL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi klitinnij cikl alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom zaliza Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Feng W Yonezawa M Ye J Jenuwein T Grummt I 2010 PHF8 activates transcription of rRNA genes through H3K4me3 binding and H3K9me1 2 demethylation Nat Struct Mol Biol 17 445 450 PMID 20208542 DOI 10 1038 nsmb 1778PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PHF8 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z PHD finger protein 8 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 20672 angl Procitovano 13 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 13 veresnya 2017 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi