Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

PABPN1 англ Poly A binding protein nuclear 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому пл

PABPN1

PABPN1

PABPN1 (англ. Poly(A) binding protein nuclear 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 32 749.

PABPN1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PABPN1, OPMD, PAB2, PABII, PABP-2, PABP2, poly(A) binding protein nuclear 1
Зовнішні ІД OMIM: 602279 MGI: 1859158 HomoloGene: 3412 GeneCards: PABPN1
Пов'язані генетичні захворювання
oculopharyngeal muscular dystrophy
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8106
54196
Ensembl
ENSG00000100836
ENSMUSG00000022194
UniProt
Q86U42
Q8CCS6
RefSeq (мРНК)
NM_004643
NM_001360551
NM_001360552
NM_019402
RefSeq (білок)
NP_004634
NP_001347480
NP_001347481
NP_062275
Локус (UCSC) Хр. 14: 23.32 – 23.33 Mb Хр. 14: 55.13 – 55.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAAAAAAAAGAAGGRGSGPGRRRHLVPGAGGEAGEGAPGGAGDYGNGL
ESEELEPEELLLEPEPEPEPEEEPPRPRAPPGAPGPGPGSGAPGSQEEEE
EPGLVEGDPGDGAIEDPELEAIKARVREMEEEAEKLKELQNEVEKQMNMS
PPPGNAGPVIMSIEEKMEADARSIYVGNVDYGATAEELEAHFHGCGSVNR
VTILCDKFSGHPKGFAYIEFSDKESVRTSLALDESLFRGRQIKVIPKRTN
RPGISTTDRGFPRARYRARTTNYNSSRSRFYSGFNSRPRGRVYRGRARAT
SWYSPY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chen Z., Li Y., Krug R.M. (1999). Influenza A virus NS1 protein targets poly(A)-binding protein II of the cellular 3'-end processing machinery. EMBO J. 18: 2273—2283. PMID 10205180 DOI:10.1093/emboj/18.8.2273
  • Calado A., Kutay U., Kuehn U., Wahle E., Carmo-Fonseca M. (2000). Deciphering the cellular pathway for transport of poly(A)-binding protein II. RNA. 6: 245—256. PMID 10688363 DOI:10.1017/S1355838200991908
  • Fan X., Dion P., Laganiere J., Brais B., Rouleau G.A. (2001). Oligomerization of polyalanine expanded PABPN1 facilitates nuclear protein aggregation that is associated with cell death. Hum. Mol. Genet. 10: 2341—2351. PMID 11689481 DOI:10.1093/hmg/10.21.2341
  • Sugaya K., Matsubara S., Miyamoto K., Kawata A., Hayashi H. (2003). An aggregate-prone conformational epitope in trinucleotide repeat diseases. NeuroReport. 14: 2331—2335. PMID 14663186 DOI:10.1097/00001756-200312190-00009
  • Dettwiler S., Aringhieri C., Cardinale S., Keller W., Barabino S.M. (2004). Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization. J. Biol. Chem. 279: 35788—35797. PMID 15169763 DOI:10.1074/jbc.M403927200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з PABPN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

PABPN1 angl Poly A binding protein nuclear 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 14 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 306 aminokislot a molekulyarna masa 32 749 PABPN1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB3B4D 3B4M 3UCGIdentifikatoriSimvoliPABPN1 OPMD PAB2 PABII PABP 2 PABP2 poly A binding protein nuclear 1Zovnishni ID OMIM 602279 MGI 1859158 HomoloGene 3412 GeneCards PABPN1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaoculopharyngeal muscular dystrophyOntologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding RNA binding RNA polymerase bindingKlitinna komponenta citoplazma nukleoplazma nuclear inclusion body klitinne yadro nuclear speck RibonukleoproteyiniBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome termination of RNA polymerase II transcription GO 0033168 GO 0036404 GO 1902360 RNA processing m yazove skorochennya mRNA processing poly A mRNA export from nucleus modification by virus of host mRNA processing mRNA 3 end processing MAPK cascade cellular response to lipopolysaccharide positive regulation of polynucleotide adenylyltransferase activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8106 54196Ensembl ENSG00000100836 ENSMUSG00000022194UniProt Q86U42 Q8CCS6RefSeq mRNK NM 004643 NM 001360551 NM 001360552NM 019402RefSeq bilok NP 004634 NP 001347480 NP 001347481NP 062275Lokus UCSC Hr 14 23 32 23 33 MbHr 14 55 13 55 14 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MAAAAAAAAAAGAAGGRGSGPGRRRHLVPGAGGEAGEGAPGGAGDYGNGLESEELEPEELLLEPEPEPEPEEEPPRPRAPPGAPGPGPGSGAPGSQEEEEEPGLVEGDPGDGAIEDPELEAIKARVREMEEEAEKLKELQNEVEKQMNMSPPPGNAGPVIMSIEEKMEADARSIYVGNVDYGATAEELEAHFHGCGSVNRVTILCDKFSGHPKGFAYIEFSDKESVRTSLALDESLFRGRQIKVIPKRTNRPGISTTDRGFPRARYRARTTNYNSSRSRFYSGFNSRPRGRVYRGRARATSWYSPYA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Chen Z Li Y Krug R M 1999 Influenza A virus NS1 protein targets poly A binding protein II of the cellular 3 end processing machinery EMBO J 18 2273 2283 PMID 10205180 DOI 10 1093 emboj 18 8 2273 Calado A Kutay U Kuehn U Wahle E Carmo Fonseca M 2000 Deciphering the cellular pathway for transport of poly A binding protein II RNA 6 245 256 PMID 10688363 DOI 10 1017 S1355838200991908 Fan X Dion P Laganiere J Brais B Rouleau G A 2001 Oligomerization of polyalanine expanded PABPN1 facilitates nuclear protein aggregation that is associated with cell death Hum Mol Genet 10 2341 2351 PMID 11689481 DOI 10 1093 hmg 10 21 2341 Sugaya K Matsubara S Miyamoto K Kawata A Hayashi H 2003 An aggregate prone conformational epitope in trinucleotide repeat diseases NeuroReport 14 2331 2335 PMID 14663186 DOI 10 1097 00001756 200312190 00009 Dettwiler S Aringhieri C Cardinale S Keller W Barabino S M 2004 Distinct sequence motifs within the 68 kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding protein protein interactions and subcellular localization J Biol Chem 279 35788 35797 PMID 15169763 DOI 10 1074 jbc M403927200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PABPN1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 22 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 20 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 14Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij

Дата публікації:
Топ