Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

NXF1 англ Nuclear RNA export factor 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 11

NXF1

NXF1

NXF1 (англ. Nuclear RNA export factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 70 182.

NXF1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NXF1, MEX67, TAP, nuclear RNA export factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 602647 MGI: 1858330 HomoloGene: 38176 GeneCards: NXF1
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10482
53319
Ensembl
ENSG00000162231
ENSMUSG00000010097
UniProt
Q9UBU9
Q99JX7
RefSeq (мРНК)
NM_006362
NM_001081491
NM_001276704
NM_016813
RefSeq (білок)
NP_001074960
NP_006353
NP_001263633
NP_058093
Локус (UCSC) Хр. 11: 62.79 – 62.81 Mb Хр. 19: 8.73 – 8.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGIRSS
RLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDR
APPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPI
EFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTI
LNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRR
SCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIVQKAPNLKILNLSG
NELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLR
LDGHELPPPIAFDVEAPTTLPPCKGSYFGTENLKSLVLHFLQQYYAIYDS
GDRQGLLDAYHDGACCSLSIPFIPQNPARSSLAEYFKDSRNVKKLKDPTL
RFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDVNSFVVDISAQTSTLLCFSVNGVFK
EVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASSEEIQRAFAM
PAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNNWDYTRSA
QAFTHLKAKGEIPEVAFMK

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Braun I.C., Rohrbach E., Schmitt C., Izaurralde E. (1999). TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus. EMBO J. 18: 1953—1965. PMID 10202158 DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
  • Kang Y., Cullen B.R. (1999). The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA-binding and nucleocytoplasmic transport sequences. Genes Dev. 13: 1126—1139. PMID 10323864 DOI:10.1101/gad.13.9.1126
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Braun I.C., Herold A., Rode M., Conti E., Izaurralde E. (2001). Overexpression of TAP/p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export. J. Biol. Chem. 276: 20536—20543. PMID 11259411 DOI:10.1074/jbc.M100400200
  • Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex. EMBO J. 20: 6424—6433. PMID 11707413 DOI:10.1093/emboj/20.22.6424
  • Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex. Science. 293: 1832—1836. PMID 11546873 DOI:10.1126/science.1062829

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8071 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

NXF1 angl Nuclear RNA export factor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 619 aminokislot a molekulyarna masa 70 182 NXF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4WYK 1FO1 1FT8 1GO5 1JKG 1JN5 1KOH 1KOO 1OAI 2Z5K 2Z5M 3RW6 3RW7IdentifikatoriSimvoliNXF1 MEX67 TAP nuclear RNA export factor 1Zovnishni ID OMIM 602647 MGI 1858330 HomoloGene 38176 GeneCards NXF1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding mRNA binding GO 0005487 structural constituent of nuclear pore nucleic acid binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma nuclear speck transcription export complex yaderna pora vnutrishnoklitinnij nuclear inclusion body klitinne yadro nukleoplazma nuclear envelopeBiologichnij proces mRNA transport mRNA export from nucleus poly A mRNA export from nucleus GO 0022415 viral process RNA export from nucleus GO 0015915 transport protein transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10482 53319Ensembl ENSG00000162231 ENSMUSG00000010097UniProt Q9UBU9 Q99JX7RefSeq mRNK NM 006362 NM 001081491NM 001276704 NM 016813RefSeq bilok NP 001074960 NP 006353NP 001263633 NP 058093Lokus UCSC Hr 11 62 79 62 81 MbHr 19 8 73 8 75 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MADEGKSYSEHDDERVNFPQRKKKGRGPFRWKYGEGNRRSGRGGSGIRSSRLEEDDGDVAMSDAQDGPRVRYNPYTTRPNRRGDTWHDRDRIHVTVRRDRAPPERGGAGTSQDGTSKNWFKITIPYGRKYDKAWLLSMIQSKCSVPFTPIEFHYENTRAQFFVEDASTASALKAVNYKILDRENRRISIIINSSAPPHTILNELKPEQVEQLKLIMSKRYDGSQQALDLKGLRSDPDLVAQNIDVVLNRRSCMAATLRIIEENIPELLSLNLSNNRLYRLDDMSSIVQKAPNLKILNLSGNELKSERELDKIKGLKLEELWLDGNSLCDTFRDQSTYISAIRERFPKLLRLDGHELPPPIAFDVEAPTTLPPCKGSYFGTENLKSLVLHFLQQYYAIYDSGDRQGLLDAYHDGACCSLSIPFIPQNPARSSLAEYFKDSRNVKKLKDPTLRFRLLKHTRLNVVAFLNELPKTQHDVNSFVVDISAQTSTLLCFSVNGVFKEVDGKSRDSLRAFTRTFIAVPASNSGLCIVNDELFVRNASSEEIQRAFAMPAPTPSSSPVPTLSPEQQEMLQAFSTQSGMNLEWSQKCLQDNNWDYTRSAQAFTHLKAKGEIPEVAFMKA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus transport transport mRNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaBraun I C Rohrbach E Schmitt C Izaurralde E 1999 TAP binds to the constitutive transport element CTE through a novel RNA binding motif that is sufficient to promote CTE dependent RNA export from the nucleus EMBO J 18 1953 1965 PMID 10202158 DOI 10 1093 emboj 18 7 1953 Kang Y Cullen B R 1999 The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA binding and nucleocytoplasmic transport sequences Genes Dev 13 1126 1139 PMID 10323864 DOI 10 1101 gad 13 9 1126 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Braun I C Herold A Rode M Conti E Izaurralde E 2001 Overexpression of TAP p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export J Biol Chem 276 20536 20543 PMID 11259411 DOI 10 1074 jbc M100400200 Kataoka N Diem M D Kim V N Yong J Dreyfuss G 2001 Magoh a human homolog of Drosophila mago nashi protein is a component of the splicing dependent exon exon junction complex EMBO J 20 6424 6433 PMID 11707413 DOI 10 1093 emboj 20 22 6424 Kim V N Kataoka N Dreyfuss G 2001 Role of the nonsense mediated decay factor hUpf3 in the splicing dependent exon exon junction complex Science 293 1832 1836 PMID 11546873 DOI 10 1126 science 1062829PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8071 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 11Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ