NIN (англ. Ninein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 243 249.
NIN | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NIN, SCKL7, ninein | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608684 MGI: 105108 HomoloGene: 40632 GeneCards: NIN | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Seckel syndrome 7 | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 14: 50.72 – 50.83 Mb | Хр. 12: 70.06 – 70.16 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDEVEQDQHE | ARLKELFDSF | DTTGTGSLGQ | EELTDLCHML | SLEEVAPVLQ | ||||
QTLLQDNLLG | RVHFDQFKEA | LILILSRTLS | NEEHFQEPDC | SLEAQPKYVR | ||||
GGKRYGRRSL | PEFQESVEEF | PEVTVIEPLD | EEARPSHIPA | GDCSEHWKTQ | ||||
RSEEYEAEGQ | LRFWNPDDLN | ASQSGSSPPQ | DWIEEKLQEV | CEDLGITRDG | ||||
HLNRKKLVSI | CEQYGLQNVD | GEMLEEVFHN | LDPDGTMSVE | DFFYGLFKNG | ||||
KSLTPSASTP | YRQLKRHLSM | QSFDESGRRT | TTSSAMTSTI | GFRVFSCLDD | ||||
GMGHASVERI | LDTWQEEGIE | NSQEILKALD | FSLDGNINLT | ELTLALENEL | ||||
LVTKNSIHQA | ALASFKAEIR | HLLERVDQVV | REKEKLRSDL | DKAEKLKSLM | ||||
ASEVDDHHAA | IERRNEYNLR | KLDEEYKERI | AALKNELRKE | REQILQQAGK | ||||
QRLELEQEIE | KAKTEENYIR | DRLALSLKEN | SRLENELLEN | AEKLAEYENL | ||||
TNKLQRNLEN | VLAEKFGDLD | PSSAEFFLQE | ERLTQMRNEY | ERQCRVLQDQ | ||||
VDELQSELEE | YRAQGRVLRL | PLKNSPSEEV | EANSGGIEPE | HGLGSEECNP | ||||
LNMSIEAELV | IEQMKEQHHR | DICCLRLELE | DKVRHYEKQL | DETVVSCKKA | ||||
QENMKQRHEN | ETHTLEKQIS | DLKNEIAELQ | GQAAVLKEAH | HEATCRHEEE | ||||
KKQLQVKLEE | EKTHLQEKLR | LQHEMELKAR | LTQAQASFER | EREGLQSSAW | ||||
TEEKVRGLTQ | ELEQFHQEQL | TSLVEKHTLE | KEELRKELLE | KHQRELQEGR | ||||
EKMETECNRR | TSQIEAQFQS | DCQKVTERCE | SALQSLEGRY | RQELKDLQEQ | ||||
QREEKSQWEF | EKDELTQECA | EAQELLKETL | KREKTTSLVL | TQEREMLEKT | ||||
YKEHLNSMVV | ERQQLLQDLE | DLRNVSETQQ | SLLSDQILEL | KSSHKRELRE | ||||
REEVLCQAGA | SEQLASQRLE | RLEMEHDQER | QEMMSKLLAM | ENIHKATCET | ||||
ADRERAEMST | EISRLQSKIK | EMQQATSPLS | MLQSGCQVIG | EEEVEGDGAL | ||||
SLLQQGEQLL | EENGDVLLSL | QRAHEQAVKE | NVKMATEISR | LQQRLQKLEP | ||||
GLVMSSCLDE | PATEFFGNTA | EQTEQFLQQN | RTKQVEGVTR | RHVLSDLEDD | ||||
EVRDLGSTGT | SSVQRQEVKI | EESEASVEGF | SELENSEETR | TESWELKNQI | ||||
SQLQEQLMML | CADCDRASEK | KQDLLFDVSV | LKKKLKMLER | IPEASPKYKL | ||||
LYEDVSREND | CLQEELRMME | TRYDEALENN | KELTAEVFRL | QDELKKMEEV | ||||
TETFLSLEKS | YDEVKIENEG | LNVLVLRLQG | KIEKLQESVV | QRCDCCLWEA | ||||
SLENLEIEPD | GNILQLNQTL | EECVPRVRSV | HHVIEECKQE | NQYLEGNTQL | ||||
LEKVKAHEIA | WLHGTIQTHQ | ERPRVQNQVI | LEENTTLLGF | QDKHFQHQAT | ||||
IAELELEKTK | LQELTRKLKE | RVTILVKQKD | VLSHGEKEEE | LKAMMHDLQI | ||||
TCSEMQQKVE | LLRYESEKLQ | QENSILRNEI | TTLNEEDSIS | NLKLGTLNGS | ||||
QEEMWQKTET | VKQENAAVQK | MVENLKKQIS | ELKIKNQQLD | LENTELSQKN | ||||
SQNQEKLQEL | NQRLTEMLCQ | KEKEPGNSAL | EEREQEKFNL | KEELERCKVQ | ||||
SSTLVSSLEA | ELSEVKIQTH | IVQQENHLLK | DELEKMKQLH | RCPDLSDFQQ | ||||
KISSVLSYNE | KLLKEKEALS | EELNSCVDKL | AKSSLLEHRI | ATMKQEQKSW | ||||
EHQSASLKSQ | LVASQEKVQN | LEDTVQNVNL | QMSRMKSDLR | VTQQEKEALK | ||||
QEVMSLHKQL | QNAGGKSWAP | EIATHPSGLH | NQQKRLSWDK | LDHLMNEEQQ | ||||
LLWQENERLQ | TMVQNTKAEL | THSREKVRQL | ESNLLPKHQK | HLNPSGTMNP | ||||
TEQEKLSLKR | ECDQFQKEQS | PANRKVSQMN | SLEQELETIH | LENEGLKKKQ | ||||
VKLDEQLMEM | QHLRSTATPS | PSPHAWDLQL | LQQQACPMVP | REQFLQLQRQ | ||||
LLQAERINQH | LQEELENRTS | ETNTPQGNQE | QLVTVMEERM | IEVEQKLKLV | ||||
KRLLQEKVNQ | LKEQVSLPGH | LCSPTSHSSF | NSSFTSLYCH |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Hong Y.-R., Chen C.-H., Chuo M.-H., Liou S.-Y., Howng S.-L. (2000). Genomic organization and molecular characterization of the human ninein gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 989—995. PMID 11162463 DOI:10.1006/bbrc.2000.4050
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dammermann A., Merdes A. (2002). Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM-1. J. Cell Biol. 159: 255—266. PMID 12403812 DOI:10.1083/jcb.200204023
- Fritzler M.J., Zhang M., Stinton L.M., Rattner J.B. (2003). Spectrum of centrosome autoantibodies in childhood varicella and post-varicella acute cerebellar ataxia. BMC Pediatr. 3: 11—11. PMID 14503922 DOI:10.1186/1471-2431-3-11
- Kodani A., Salome Sirerol-Piquer M., Seol A., Garcia-Verdugo J.M., Reiter J.F. (2013). Kif3a interacts with Dynactin subunit p150 Glued to organize centriole subdistal appendages. EMBO J. 32: 597—607. PMID 23386061 DOI:10.1038/emboj.2013.3
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NIN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Ninein переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14906 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NIN angl Ninein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 14 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 090 aminokislot a molekulyarna masa 243 249 NINIdentifikatoriSimvoliNIN SCKL7 nineinZovnishni ID OMIM 608684 MGI 105108 HomoloGene 40632 GeneCards NINPov yazani genetichni zahvoryuvannyaSeckel syndrome 7 Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding calcium ion binding GTP binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding kinase bindingKlitinna komponenta citoplazma centr organizaciyi mikrotrubochok spindle pole yaderce pericentriolar material mikrotrubochka citoskelet mitotic spindle pole microtubule minus end centrosoma ciliary transition fiber klitinne yadro Centriol mitotic spindle centriolar subdistal appendage klitinna membrana akson dendrit nejrobiologiya axonal growth cone apical part of cellBiologichnij proces centrosome localization centrosome templated microtubule nucleation microtubule anchoring at centrosome GO 0034613 protein localization centriole centriole cohesion corpus callosum morphogenesis corticospinal tract morphogenesis positive regulation of microtubule polymerization collateral sprouting positive regulation of axonogenesisDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez51199 18080Ensembl ENSG00000100503 ENSMUSG00000021068UniProt Q8N4C6 Q61043RefSeq mRNK NM 016350 NM 020921 NM 182944 NM 182945 NM 182946NM 001081453 NM 001286079 NM 001286080 NM 008697RefSeq bilok NP 057434 NP 065972 NP 891989 NP 891991NP 001074922 NP 001273008 NP 001273009 NP 032723 NP 001390761Lokus UCSC Hr 14 50 72 50 83 MbHr 12 70 06 70 16 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQ QTLLQDNLLGRVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVR GGKRYGRRSLPEFQESVEEFPEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQ RSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDG HLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVEDFFYGLFKNG KSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENEL LVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLM ASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGK QRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKENSRLENELLENAEKLAEYENL TNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEYERQCRVLQDQ VDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKA QENMKQRHENETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEE KKQLQVKLEEEKTHLQEKLRLQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAW TEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGR EKMETECNRRTSQIEAQFQSDCQKVTERCESALQSLEGRYRQELKDLQEQ QREEKSQWEFEKDELTQECAEAQELLKETLKREKTTSLVLTQEREMLEKT YKEHLNSMVVERQQLLQDLEDLRNVSETQQSLLSDQILELKSSHKRELRE REEVLCQAGASEQLASQRLERLEMEHDQERQEMMSKLLAMENIHKATCET ADRERAEMSTEISRLQSKIKEMQQATSPLSMLQSGCQVIGEEEVEGDGAL SLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHEQAVKENVKMATEISRLQQRLQKLEP GLVMSSCLDEPATEFFGNTAEQTEQFLQQNRTKQVEGVTRRHVLSDLEDD EVRDLGSTGTSSVQRQEVKIEESEASVEGFSELENSEETRTESWELKNQI SQLQEQLMMLCADCDRASEKKQDLLFDVSVLKKKLKMLERIPEASPKYKL LYEDVSRENDCLQEELRMMETRYDEALENNKELTAEVFRLQDELKKMEEV TETFLSLEKSYDEVKIENEGLNVLVLRLQGKIEKLQESVVQRCDCCLWEA SLENLEIEPDGNILQLNQTLEECVPRVRSVHHVIEECKQENQYLEGNTQL LEKVKAHEIAWLHGTIQTHQERPRVQNQVILEENTTLLGFQDKHFQHQAT IAELELEKTKLQELTRKLKERVTILVKQKDVLSHGEKEEELKAMMHDLQI TCSEMQQKVELLRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGS QEEMWQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKN SQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQ SSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQ KISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSW EHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQEKEALK QEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQ LLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNP TEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQ VKLDEQLMEMQHLRSTATPSPSPHAWDLQLLQQQACPMVPREQFLQLQRQ LLQAERINQHLQEELENRTSETNTPQGNQEQLVTVMEERMIEVEQKLKLV KRLLQEKVNQLKEQVSLPGHLCSPTSHSSFNSSFTSLYCH A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z nukleotidami GTF Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti LiteraturaHong Y R Chen C H Chuo M H Liou S Y Howng S L 2000 Genomic organization and molecular characterization of the human ninein gene Biochem Biophys Res Commun 279 989 995 PMID 11162463 DOI 10 1006 bbrc 2000 4050 Nagase T Kikuno R Nakayama M Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVIII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 273 281 PMID 10997877 DOI 10 1093 dnares 7 4 271 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Dammermann A Merdes A 2002 Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM 1 J Cell Biol 159 255 266 PMID 12403812 DOI 10 1083 jcb 200204023 Fritzler M J Zhang M Stinton L M Rattner J B 2003 Spectrum of centrosome autoantibodies in childhood varicella and post varicella acute cerebellar ataxia BMC Pediatr 3 11 11 PMID 14503922 DOI 10 1186 1471 2431 3 11 Kodani A Salome Sirerol Piquer M Seol A Garcia Verdugo J M Reiter J F 2013 Kif3a interacts with Dynactin subunit p150 Glued to organize centriole subdistal appendages EMBO J 32 597 607 PMID 23386061 DOI 10 1038 emboj 2013 3PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z NIN pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Ninein pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 14906 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 20 lipnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 14 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi