NELFCD (англ. Negative elongation factor complex member C/D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 66 247.
NELFCD | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NELFCD, NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, negative elongation factor complex member C/D | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605297 MGI: 1926424 HomoloGene: 9496 GeneCards: NELFCD | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 58.98 – 59 Mb | Хр. 2: 174.26 – 174.27 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAGAVPGAIM | DEDYYGSAAE | WGDEADGGQQ | EDDSGEGEDD | AEVQQECLHK | ||||
FSTRDYIMEP | SIFNTLKRYF | QAGGSPENVI | QLLSENYTAV | AQTVNLLAEW | ||||
LIQTGVEPVQ | VQETVENHLK | SLLIKHFDPR | KADSIFTEEG | ETPAWLEQMI | ||||
AHTTWRDLFY | KLAEAHPDCL | MLNFTVKLIS | DAGYQGEITS | VSTACQQLEV | ||||
FSRVLRTSLA | TILDGGEENL | EKNLPEFAKM | VCHGEHTYLF | AQAMMSVLAQ | ||||
EEQGGSAVRR | IAQEVQRFAQ | EKGHDASQIT | LALGTAASYP | RACQALGAML | ||||
SKGALNPADI | TVLFKMFTSM | DPPPVELIRV | PAFLDLFMQS | LFKPGARINQ | ||||
DHKHKYIHIL | AYAASVVETW | KKNKRVSINK | DELKSTSKAV | ETVHNLCCNE | ||||
NKGASELVAE | LSTLYQCIRF | PVVAMGVLKW | VDWTVSEPRY | FQLQTDHTPV | ||||
HLALLDEIST | CHQLLHPQVL | QLLVKLFETE | HSQLDVMEQL | ELKKTLLDRM | ||||
VHLLSRGYVL | PVVSYIRKCL | EKLDTDISLI | RYFVTEVLDV | IAPPYTSDFV | ||||
QLFLPILEND | SIAGTIKTEG | EHDPVTEFIA | HCKSNFIMVN |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Bonthron D.T., Hayward B.E., Moran V., Strain L. (2000). Characterization of TH1 and CTSZ, two non-imprinted genes downstream of GNAS1 in chromosome 20q13. Hum. Genet. 107: 165—175. PMID 11030415 DOI:10.1007/s004390000344
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yin X.L., Chen S., Gu J.X. (2002). Identification of TH1 as an interaction partner of A-Raf kinase. Mol. Cell. Biochem. 231: 69—74. PMID 11952167 DOI:10.1023/A:1014437024129
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15934 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NELFCD angl Negative elongation factor complex member C D bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 590 aminokislot a molekulyarna masa 66 247 NELFCDNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB5L3XIdentifikatoriSimvoliNELFCD NELF C NELF D TH1 TH1L HSPC130 negative elongation factor complex member C DZovnishni ID OMIM 605297 MGI 1926424 HomoloGene 9496 GeneCards NELFCDOntologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA bindingKlitinna komponenta membrana NELF complex klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces transcription elongation from RNA polymerase II promoter positive regulation of viral transcription GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoterDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez51497 57314Ensembl ENSG00000101158 ENSMUSG00000016253UniProt Q8IXH7 Q922L6RefSeq mRNK NM 016397 NM 198976NM 020580RefSeq bilok NP 945327NP 065605Lokus UCSC Hr 20 58 98 59 MbHr 2 174 26 174 27 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAGAVPGAIMDEDYYGSAAEWGDEADGGQQEDDSGEGEDDAEVQQECLHK FSTRDYIMEPSIFNTLKRYFQAGGSPENVIQLLSENYTAVAQTVNLLAEW LIQTGVEPVQVQETVENHLKSLLIKHFDPRKADSIFTEEGETPAWLEQMI AHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEV FSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQ EEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAML SKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQ DHKHKYIHILAYAASVVETWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNE NKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPV HLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRM VHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFV QLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do represoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaBonthron D T Hayward B E Moran V Strain L 2000 Characterization of TH1 and CTSZ two non imprinted genes downstream of GNAS1 in chromosome 20q13 Hum Genet 107 165 175 PMID 11030415 DOI 10 1007 s004390000344 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Yin X L Chen S Gu J X 2002 Identification of TH1 as an interaction partner of A Raf kinase Mol Cell Biochem 231 69 74 PMID 11952167 DOI 10 1023 A 1014437024129PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 15934 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 20 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi