NEIL1 (англ. Nei like DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 684.
NEIL1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NEIL1, FPG1, NEI1, hFPG1, nei like DNA glycosylase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCards: NEIL1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 15: 75.35 – 75.36 Mb | Хр. 9: 57.05 – 57.06 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPEGPELHLA | SQFVNEACRA | LVFGGCVEKS | SVSRNPEVPF | ESSAYRISAS | ||||
ARGKELRLIL | SPLPGAQPQQ | EPLALVFRFG | MSGSFQLVPR | EELPRHAHLR | ||||
FYTAPPGPRL | ALCFVDIRRF | GRWDLGGKWQ | PGRGPCVLQE | YQQFRENVLR | ||||
NLADKAFDRP | ICEALLDQRF | FNGIGNYLRA | EILYRLKIPP | FEKARSVLEA | ||||
LQQHRPSPEL | TLSQKIRTKL | QNPDLLELCH | SVPKEVVQLG | GKGYGSESGE | ||||
EDFAAFRAWL | RCYGMPGMSS | LQDRHGRTIW | FQGDPGPLAP | KGRKSRKKKS | ||||
KATQLSPEDR | VEDALPPSKA | PSRTRRAKRD | LPKRTATQRP | EGTSLQQDPE | ||||
APTVPKKGRR | KGRQAASGHC | RPRKVKADIP | SLEPEGTSAS |
Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, . Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bandaru V., Sunkara S., Wallace S.S., Bond J.P. (2002). A novel human DNA glycosylase that removes oxidative DNA damage and is homologous to Escherichia coli endonuclease VIII. DNA Repair. 1: 517—529. PMID 12509226 DOI:10.1016/S1568-7864(02)00036-8
- Dou H., Mitra S., Hazra T.K. (2003). Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2. J. Biol. Chem. 278: 49679—49684. PMID 14522990 DOI:10.1074/jbc.M308658200
- Hildrestrand G.A., Rolseth V., Bjoras M., Luna L. (2007). Human NEIL1 localizes with the centrosomes and condensed chromosomes during mitosis. DNA Repair. 6: 1425—1433. PMID 17556049 DOI:10.1016/j.dnarep.2007.04.008
- Yeo J., Goodman R.A., Schirle N.T., David S.S., Beal P.A. (2010). RNA editing changes the lesion specificity for the DNA repair enzyme NEIL1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 20715—20719. PMID 21068368 DOI:10.1073/pnas.1009231107
- Doublie S., Bandaru V., Bond J.P., Wallace S.S. (2004). The crystal structure of human endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) reveals a zincless finger motif required for glycosylase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10284—10289. PMID 15232006 DOI:10.1073/pnas.0402051101
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18448 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NEIL1 angl Nei like DNA glycosylase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 15 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 390 aminokislot a molekulyarna masa 43 684 NEIL1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1TDH 4NRV 5ITY 5ITQ 5ITU 5ITX 5ITR 5ITTIdentifikatoriSimvoliNEIL1 FPG1 NEI1 hFPG1 nei like DNA glycosylase 1Zovnishni ID OMIM 608844 MGI 1920024 HomoloGene 11616 GeneCards NEIL1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding zinc ion binding hydrolase activity hydrolyzing N glycosyl compounds hydrolase activity acting on glycosyl bonds damaged DNA binding protein C terminus binding katalitichna aktivnist lyase activity nucleic acid binding hydrolase activity DNA N glycosylase activity DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activity class I DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activityKlitinna komponenta citoplazma hromosoma centr organizaciyi mikrotrubochok citoskelet klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces nucleotide excision repair GO 0001306 response to oxidative stress cellular response to DNA damage stimulus depyrimidination negative regulation of nuclease activity obmin rechovin GO 0100026 Reparaciya DNK base excision repairDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez79661 72774Ensembl ENSG00000140398 ENSMUSG00000032298UniProt Q96FI4 Q8K4Q6RefSeq mRNK NM 001256552 NM 024608 NM 001352519 NM 001352520NM 028347 NM 001357409RefSeq bilok NP 001243481 NP 078884 NP 001339448 NP 001339449NP 082623 NP 001344338Lokus UCSC Hr 15 75 35 75 36 MbHr 9 57 05 57 06 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MPEGPELHLASQFVNEACRALVFGGCVEKSSVSRNPEVPFESSAYRISASARGKELRLILSPLPGAQPQQEPLALVFRFGMSGSFQLVPREELPRHAHLRFYTAPPGPRLALCFVDIRRFGRWDLGGKWQPGRGPCVLQEYQQFRENVLRNLADKAFDRPICEALLDQRFFNGIGNYLRAEILYRLKIPPFEKARSVLEALQQHRPSPELTLSQKIRTKLQNPDLLELCHSVPKEVVQLGGKGYGSESGEEDFAAFRAWLRCYGMPGMSSLQDRHGRTIWFQGDPGPLAPKGRKSRKKKSKATQLSPEDRVEDALPPSKAPSRTRRAKRDLPKRTATQRPEGTSLQQDPEAPTVPKKGRRKGRQAASGHCRPRKVKADIPSLEPEGTSASA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do liaz gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK reparaciya DNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti yadri hromosomah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bandaru V Sunkara S Wallace S S Bond J P 2002 A novel human DNA glycosylase that removes oxidative DNA damage and is homologous to Escherichia coli endonuclease VIII DNA Repair 1 517 529 PMID 12509226 DOI 10 1016 S1568 7864 02 00036 8 Dou H Mitra S Hazra T K 2003 Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2 J Biol Chem 278 49679 49684 PMID 14522990 DOI 10 1074 jbc M308658200 Hildrestrand G A Rolseth V Bjoras M Luna L 2007 Human NEIL1 localizes with the centrosomes and condensed chromosomes during mitosis DNA Repair 6 1425 1433 PMID 17556049 DOI 10 1016 j dnarep 2007 04 008 Yeo J Goodman R A Schirle N T David S S Beal P A 2010 RNA editing changes the lesion specificity for the DNA repair enzyme NEIL1 Proc Natl Acad Sci U S A 107 20715 20719 PMID 21068368 DOI 10 1073 pnas 1009231107 Doublie S Bandaru V Bond J P Wallace S S 2004 The crystal structure of human endonuclease VIII like 1 NEIL1 reveals a zincless finger motif required for glycosylase activity Proc Natl Acad Sci U S A 101 10284 10289 PMID 15232006 DOI 10 1073 pnas 0402051101PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 18448 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 listopada 2016 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 15Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi