LGR5 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 907 амінокислот, а молекулярна маса — 99 998.
LGR5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LGR5, FEX, GPR49, GPR67, GRP49, HG38, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606667 MGI: 1341817 HomoloGene: 20807 GeneCards: LGR5 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 71.44 – 71.59 Mb | Хр. 10: 115.29 – 115.42 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDTSRLGVLL | SLPVLLQLAT | GGSSPRSGVL | LRGCPTHCHC | EPDGRMLLRV | ||||
DCSDLGLSEL | PSNLSVFTSY | LDLSMNNISQ | LLPNPLPSLR | FLEELRLAGN | ||||
ALTYIPKGAF | TGLYSLKVLM | LQNNQLRHVP | TEALQNLRSL | QSLRLDANHI | ||||
SYVPPSCFSG | LHSLRHLWLD | DNALTEIPVQ | AFRSLSALQA | MTLALNKIHH | ||||
IPDYAFGNLS | SLVVLHLHNN | RIHSLGKKCF | DGLHSLETLD | LNYNNLDEFP | ||||
TAIRTLSNLK | ELGFHSNNIR | SIPEKAFVGN | PSLITIHFYD | NPIQFVGRSA | ||||
FQHLPELRTL | TLNGASQITE | FPDLTGTANL | ESLTLTGAQI | SSLPQTVCNQ | ||||
LPNLQVLDLS | YNLLEDLPSF | SVCQKLQKID | LRHNEIYEIK | VDTFQQLLSL | ||||
RSLNLAWNKI | AIIHPNAFST | LPSLIKLDLS | SNLLSSFPIT | GLHGLTHLKL | ||||
TGNHALQSLI | SSENFPELKV | IEMPYAYQCC | AFGVCENAYK | ISNQWNKGDN | ||||
SSMDDLHKKD | AGMFQAQDER | DLEDFLLDFE | EDLKALHSVQ | CSPSPGPFKP | ||||
CEHLLDGWLI | RIGVWTIAVL | ALTCNALVTS | TVFRSPLYIS | PIKLLIGVIA | ||||
AVNMLTGVSS | AVLAGVDAFT | FGSFARHGAW | WENGVGCHVI | GFLSIFASES | ||||
SVFLLTLAAL | ERGFSVKYSA | KFETKAPFSS | LKVIILLCAL | LALTMAAVPL | ||||
LGGSKYGASP | LCLPLPFGEP | STMGYMVALI | LLNSLCFLMM | TIAYTKLYCN | ||||
LDKGDLENIW | DCSMVKHIAL | LLFTNCILNC | PVAFLSFSSL | INLTFISPEV | ||||
IKFILLVVVP | LPACLNPLLY | ILFNPHFKED | LVSLRKQTYV | WTRSKHPSLM | ||||
SINSDDVEKQ | SCDSTQALVT | FTSSSITYDL | PPSSVPSPAY | PVTESCHLSS | ||||
VAFVPCL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, . Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.
Література
- Hsu S.Y., Liang S.-G., Hsueh A.J.W. (1998). Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine-rich repeats and a G protein-coupled, seven-transmembrane region. Mol. Endocrinol. 12: 1830—1845. PMID 9849958 DOI:10.1210/mend.12.12.0211
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Becker L., Huang Q., Mashimo H. (2008). Immunostaining of Lgr5, an intestinal stem cell marker, in normal and premalignant human gastrointestinal tissue. ScientificWorldJournal. 8: 1168—1176. PMID 19030762 DOI:10.1100/tsw.2008.148
- Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108
- Snyder J.C., Rochelle L.K., Lyerly H.K., Caron M.G., Barak L.S. (2013). Constitutive Internalization of the Leucine-rich G Protein-coupled Receptor-5 (LGR5) to the Trans-Golgi Network. J. Biol. Chem. 288: 10286—10297. PMID 23439653 DOI:10.1074/jbc.M112.447540
- Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4504 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
LGR5 angl Leucine rich repeat containing G protein coupled receptor 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 907 aminokislot a molekulyarna masa 99 998 LGR5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB4BSR 4BSS 4BST 4BSU 4KNG 4UFR 4UFSIdentifikatoriSimvoliLGR5 FEX GPR49 GPR67 GRP49 HG38 leucine rich repeat containing G protein coupled receptor 5 leucine rich repeat containing G protein coupled receptor 5Zovnishni ID OMIM 606667 MGI 1341817 HomoloGene 20807 GeneCards LGR5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding G protein coupled receptor activity transmembrane signaling receptor activity signal transducer activity protein hormone receptor activity G protein coupled peptide receptor activityKlitinna komponenta integral component of membrane klitinna membrana kompleks Goldzhi integral component of plasma membrane trans Golgi network membrane membranaBiologichnij proces positive regulation of canonical Wnt signaling pathway hair follicle development inner ear development G protein coupled receptor signaling pathway epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis regulation of cell population proliferation oocyte differentiation GO 0072468 signalna transdukciya adenylate cyclase activating G protein coupled receptor signaling pathway activation of adenylate cyclase activity hormone mediated signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8549 14160Ensembl ENSG00000139292 ENSMUSG00000020140UniProt O75473 Q9Z1P4RefSeq mRNK NM 001277226 NM 001277227 NM 003667NM 010195RefSeq bilok NP 001264155 NP 001264156 NP 003658NP 034325Lokus UCSC Hr 12 71 44 71 59 MbHr 10 115 29 115 42 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCLA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv g bilokspryazhenih receptoriv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani aparati goldzhi LiteraturaHsu S Y Liang S G Hsueh A J W 1998 Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine rich repeats and a G protein coupled seven transmembrane region Mol Endocrinol 12 1830 1845 PMID 9849958 DOI 10 1210 mend 12 12 0211 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Becker L Huang Q Mashimo H 2008 Immunostaining of Lgr5 an intestinal stem cell marker in normal and premalignant human gastrointestinal tissue ScientificWorldJournal 8 1168 1176 PMID 19030762 DOI 10 1100 tsw 2008 148 Carmon K S Gong X Lin Q Thomas A Liu Q 2011 R spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt beta catenin signaling Proc Natl Acad Sci U S A 108 11452 11457 PMID 21693646 DOI 10 1073 pnas 1106083108 Snyder J C Rochelle L K Lyerly H K Caron M G Barak L S 2013 Constitutive Internalization of the Leucine rich G Protein coupled Receptor 5 LGR5 to the Trans Golgi Network J Biol Chem 288 10286 10297 PMID 23439653 DOI 10 1074 jbc M112 447540 Chen P H Chen X Lin Z Fang D He X 2013 The structural basis of R spondin recognition by LGR5 and RNF43 Genes Dev 27 1345 1350 PMID 23756651 DOI 10 1101 gad 219915 113PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4504 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi