HDAC9 (англ. Histone deacetylase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 111 297.
HDAC9 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ожиріння, інсульт, неспецифічний виразковий коліт, цереброваскулярні хвороби | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
belinostat, entinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 18.09 – 19 Mb | Хр. 12: 34.1 – 34.97 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MHSMISSVDV | KSEVPVGLEP | ISPLDLRTDL | RMMMPVVDPV | VREKQLQQEL | ||||
LLIQQQQQIQ | KQLLIAEFQK | QHENLTRQHQ | AQLQEHIKEL | LAIKQQQELL | ||||
EKEQKLEQQR | QEQEVERHRR | EQQLPPLRGK | DRGRERAVAS | TEVKQKLQEF | ||||
LLSKSATKDT | PTNGKNHSVS | RHPKLWYTAA | HHTSLDQSSP | PLSGTSPSYK | ||||
YTLPGAQDAK | DDFPLRKTAS | EPNLKVRSRL | KQKVAERRSS | PLLRRKDGNV | ||||
VTSFKKRMFE | VTESSVSSSS | PGSGPSSPNN | GPTGSVTENE | TSVLPPTPHA | ||||
EQMVSQQRIL | IHEDSMNLLS | LYTSPSLPNI | TLGLPAVPSQ | LNASNSLKEK | ||||
QKCETQTLRQ | GVPLPGQYGG | SIPASSSHPH | VTLEGKPPNS | SHQALLQHLL | ||||
LKEQMRQQKL | LVAGGVPLHP | QSPLATKERI | SPGIRGTHKL | PRHRPLNRTQ | ||||
SAPLPQSTLA | QLVIQQQHQQ | FLEKQKQYQQ | QIHMNKLLSK | SIEQLKQPGS | ||||
HLEEAEEELQ | GDQAMQEDRA | PSSGNSTRSD | SSACVDDTLG | QVGAVKVKEE | ||||
PVDSDEDAQI | QEMESGEQAA | FMQQPFLEPT | HTRALSVRQA | PLAAVGMDGL | ||||
EKHRLVSRTH | SSPAASVLPH | PAMDRPLQPG | SATGIAYDPL | MLKHQCVCGN | ||||
STTHPEHAGR | IQSIWSRLQE | TGLLNKCERI | QGRKASLEEI | QLVHSEHHSL | ||||
LYGTNPLDGQ | KLDPRILLGD | DSQKFFSSLP | CGGLGVDSDT | IWNELHSSGA | ||||
ARMAVGCVIE | LASKVASGEL | KNGFAVVRPP | GHHAEESTAM | GFCFFNSVAI | ||||
TAKYLRDQLN | ISKILIVDLD | VHHGNGTQQA | FYADPSILYI | SLHRYDEGNF | ||||
FPGSGAPNEV | GTGLGEGYNI | NIAWTGGLDP | PMGDVEYLEA | FRTIVKPVAK | ||||
EFDPDMVLVS | AGFDALEGHT | PPLGGYKVTA | KCFGHLTKQL | MTLADGRVVL | ||||
ALEGGHDLTA | ICDASEACVN | ALLGNELEPL | AEDILHQSPN | MNAVISLQKI | ||||
IEIQSMSLKF | S |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Zhou X., Marks P.A., Rifkind R.A., Richon V.M. (2001). Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10572—10577. PMID 11535832 DOI:10.1073/pnas.191375098
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056—1061. PMID 10655483 DOI:10.1073/pnas.97.3.1056
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з HDAC9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
HDAC9 angl Histone deacetylase 9 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 011 aminokislot a molekulyarna masa 111 297 HDAC9Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1TQEIdentifikatoriSimvoliHDAC9 HD7 HD7b HD9 HDAC HDAC7 HDAC7B HDAC9B HDAC9FL HDRP MITR histone deacetylase 9Zovnishni ID OMIM 606543 MGI 1931221 HomoloGene 128578 GeneCards HDAC9Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaozhirinnya insult nespecifichnij virazkovij kolit cerebrovaskulyarni hvorobi Reaguye na spolukubelinostat entinostat givinostat panobinostat quisinostat romidepsin trichostatin A zolinza Ontologiya genaMolekulyarna funkciya NAD dependent histone deacetylase activity H3 K14 specific GO 0001106 transcription corepressor activity histone deacetylase activity protein deacetylase activity transcription factor binding histone deacetylase binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding hydrolase activity protein kinase C binding histone deacetylase activity H4 K16 specific Klitinna komponenta citoplazma histone deacetylase complex transcription regulator complex nukleoplazma klitinne yadro histone methyltransferase complexBiologichnij proces histone H3 deacetylation peptidyl lysine deacetylation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis response to amphetamine GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of striated muscle cell differentiation transcription DNA templated B cell activation heart development histone H4 deacetylation neuron differentiation cellular response to insulin stimulus regulation of skeletal muscle fiber development B cell differentiation inflammatory response GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization histone deacetylation cholesterol homeostasis negative regulation of lipoprotein lipase activity histone H4 K16 deacetylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9734 79221Ensembl ENSG00000048052 ENSMUSG00000004698UniProt Q9UKV0 Q99N13RefSeq mRNK NM 001204144 NM 001204145 NM 001204146 NM 001204147 NM 001204148NM 014707 NM 058176 NM 058177 NM 178423 NM 178425 NM 001321868 NM 001321869 NM 001321870 NM 001321871 NM 001321872 NM 001321873 NM 001321874 NM 001321875 NM 001321876 NM 001321877 NM 001321878 NM 001321879 NM 001321884 NM 001321885 NM 001321886 NM 001321887 NM 001321888 NM 001321889 NM 001321890 NM 001321891 NM 001321893 NM 001321894 NM 001321895 NM 001321896 NM 001321897 NM 001321898 NM 001321899 NM 001321900 NM 001321901 NM 001321902NM 001271386 NM 024124RefSeq bilok NP 001191073 NP 001191074 NP 001191075 NP 001191076 NP 001191077NP 001308797 NP 001308798 NP 001308799 NP 001308800 NP 001308801 NP 001308802 NP 001308803 NP 001308804 NP 001308805 NP 001308806 NP 001308807 NP 001308808 NP 001308813 NP 001308814 NP 001308815 NP 001308816 NP 001308817 NP 001308818 NP 001308819 NP 001308820 NP 001308822 NP 001308823 NP 001308824 NP 001308825 NP 001308826 NP 001308827 NP 001308828 NP 001308829 NP 001308830 NP 001308831 NP 055522 NP 478056 NP 848510 NP 848512NP 001258315 NP 077038Lokus UCSC Hr 7 18 09 19 MbHr 12 34 1 34 97 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQEL LLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKELLAIKQQQELL EKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEF LLSKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYK YTLPGAQDAKDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNV VTSFKKRMFEVTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHA EQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEK QKCETQTLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLL LKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNRTQ SAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGS HLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEE PVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGL EKHRLVSRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGN STTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSL LYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGA ARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI TAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNF FPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAK EFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVL ALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKI IEIQSMSLKFS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv gidrolaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u yadri LiteraturaZhou X Marks P A Rifkind R A Richon V M 2001 Cloning and characterization of a histone deacetylase HDAC9 Proc Natl Acad Sci U S A 98 10572 10577 PMID 11535832 DOI 10 1073 pnas 191375098 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Zhou X Richon V M Rifkind R A Marks P A 2000 Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5 Proc Natl Acad Sci U S A 97 1056 1061 PMID 10655483 DOI 10 1073 pnas 97 3 1056PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z HDAC9 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Histone deacetylase 9 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 17 zhovtnya 2015 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 zhovtnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi