HDAC7 (англ. Histone deacetylase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 952 амінокислот, а молекулярна маса — 102 927.
HDAC7 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, histone deacetylase 7 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: HDAC7 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ожиріння | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
belinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 47.78 – 47.83 Mb | Хр. 15: 97.69 – 97.74 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDLRVGQRPP | VEPPPEPTLL | ALQRPQRLHH | HLFLAGLQQQ | RSVEPMRLSM | ||||
DTPMPELQVG | PQEQELRQLL | HKDKSKRSAV | ASSVVKQKLA | EVILKKQQAA | ||||
LERTVHPNSP | GIPYRTLEPL | ETEGATRSML | SSFLPPVPSL | PSDPPEHFPL | ||||
RKTVSEPNLK | LRYKPKKSLE | RRKNPLLRKE | SAPPSLRRRP | AETLGDSSPS | ||||
SSSTPASGCS | SPNDSEHGPN | PILGSEALLG | QRLRLQETSV | APFALPTVSL | ||||
LPAITLGLPA | PARADSDRRT | HPTLGPRGPI | LGSPHTPLFL | PHGLEPEAGG | ||||
TLPSRLQPIL | LLDPSGSHAP | LLTVPGLGPL | PFHFAQSLMT | TERLSGSGLH | ||||
WPLSRTRSEP | LPPSATAPPP | PGPMQPRLEQ | LKTHVQVIKR | SAKPSEKPRL | ||||
RQIPSAEDLE | TDGGGPGQVV | DDGLEHRELG | HGQPEARGPA | PLQQHPQVLL | ||||
WEQQRLAGRL | PRGSTGDTVL | LPLAQGGHRP | LSRAQSSPAA | PASLSAPEPA | ||||
SQARVLSSSE | TPARTLPFTT | GLIYDSVMLK | HQCSCGDNSR | HPEHAGRIQS | ||||
IWSRLQERGL | RSQCECLRGR | KASLEELQSV | HSERHVLLYG | TNPLSRLKLD | ||||
NGKLAGLLAQ | RMFVMLPCGG | VGVDTDTIWN | ELHSSNAARW | AAGSVTDLAF | ||||
KVASRELKNG | FAVVRPPGHH | ADHSTAMGFC | FFNSVAIACR | QLQQQSKASK | ||||
ILIVDWDVHH | GNGTQQTFYQ | DPSVLYISLH | RHDDGNFFPG | SGAVDEVGAG | ||||
SGEGFNVNVA | WAGGLDPPMG | DPEYLAAFRI | VVMPIAREFS | PDLVLVSAGF | ||||
DAAEGHPAPL | GGYHVSAKCF | GYMTQQLMNL | AGGAVVLALE | GGHDLTAICD | ||||
ASEACVAALL | GNRVDPLSEE | GWKQKPNLNA | IRSLEAVIRV | HSKYWGCMQR | ||||
LASCPDSWVP | RVPGADKEEV | EAVTALASLS | VGILAEDRPS | EQLVEEEEPM | ||||
NL |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee H.-J., Chun M., Kandror K.V. (2001). Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling. J. Biol. Chem. 276: 16597—16600. PMID 11262386 DOI:10.1074/jbc.C000909200
- Bryant H., Farrell P.J. (2002). Signal transduction and transcription factor modification during reactivation of Epstein-Barr virus from latency. J. Virol. 76: 10290—10298. PMID 12239305 DOI:10.1128/JVI.76.20.10290-10298.2002
- Xiao H., Chung J., Kao H.-Y., Yang Y.-C. (2003). Tip60 is a co-repressor for STAT3. J. Biol. Chem. 278: 11197—11204. PMID 12551922 DOI:10.1074/jbc.M210816200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з HDAC7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
HDAC7 angl Histone deacetylase 7 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 952 aminokislot a molekulyarna masa 102 927 HDAC7Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB3C0Y 3C0Z 3C10 3ZNR 3ZNSIdentifikatoriSimvoliHDAC7 HD7A HDAC7A HD7 histone deacetylase 7Zovnishni ID OMIM 606542 MGI 1891835 HomoloGene 9124 GeneCards HDAC7Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaozhirinnyaReaguye na spolukubelinostat givinostat panobinostat quisinostat romidepsin trichostatin AOntologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001106 transcription corepressor activity protein kinase binding 14 3 3 protein binding hydrolase activity protein kinase C binding chromatin binding histone deacetylase activity NAD dependent histone deacetylase activity H3 K14 specific GO 0001948 GO 0016582 protein binding SUMO transferase activityKlitinna komponenta nukleoplazma citoplazma klitinne yadro histone deacetylase complex gialoplazmaBiologichnij proces transcription DNA templated negative regulation of NIK NF kappaB signaling positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis cell cell junction assembly vaskulogenez GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II histone H3 deacetylation negative regulation of osteoblast differentiation negative regulation of interleukin 2 production GO 0009373 regulation of transcription DNA templated histone deacetylation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization protein sumoylationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez51564 56233Ensembl ENSG00000061273 ENSMUSG00000022475UniProt Q8WUI4 Q8C2B3RefSeq mRNK NM 001098416 NM 001308090 NM 015401 NM 016596 NM 001368046NM 001204275 NM 001204276 NM 001204277 NM 001204278 NM 001204279NM 001204280 NM 001204281 NM 019572 NM 001378971RefSeq bilok NP 001091886 NP 001295019 NP 056216 NP 001354975NP 001191204 NP 001191205 NP 001191206 NP 001191207 NP 001191208NP 001191209 NP 001191210 NP 062518 NP 001365900Lokus UCSC Hr 12 47 78 47 83 MbHr 15 97 69 97 74 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRLSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALERTVHPNSPGIPYRTLEPLETEGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKLRYKPKKSLERRKNPLLRKESAPPSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPNDSEHGPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPAPARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGSGLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPPPGPMQPRLEQLKTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDDGLEHRELGHGQPEARGPAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGILAEDRPSEQLVEEEEPMNLA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv gidrolaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lee H J Chun M Kandror K V 2001 Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling J Biol Chem 276 16597 16600 PMID 11262386 DOI 10 1074 jbc C000909200 Bryant H Farrell P J 2002 Signal transduction and transcription factor modification during reactivation of Epstein Barr virus from latency J Virol 76 10290 10298 PMID 12239305 DOI 10 1128 JVI 76 20 10290 10298 2002 Xiao H Chung J Kao H Y Yang Y C 2003 Tip60 is a co repressor for STAT3 J Biol Chem 278 11197 11204 PMID 12551922 DOI 10 1074 jbc M210816200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z HDAC7 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Histone deacetylase 7 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 17 zhovtnya 2015 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 travnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi