Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Гістондеацетилаза 5 англ Histone deacetylase 5 білок який кодується геном HDAC5 розташованим у людей на короткому плечі

HDAC5

HDAC5

Гістондеацетилаза-5 (англ. Histone deacetylase 5) — білок, який кодується геном HDAC5, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 122 амінокислот, а молекулярна маса — 121 978.

HDAC5
Ідентифікатори
Символи HDAC5, HD5, NY-CO-9, histone deacetylase 5
Зовнішні ІД OMIM: 605315 MGI: 1333784 HomoloGene: 3995 GeneCards: HDAC5
Реагує на сполуку
belinostat, givinostat, pracinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, золінза
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10014
15184
Ensembl
ENSG00000108840
ENSMUSG00000008855
UniProt
Q9UQL6
Q9Z2V6
RefSeq (мРНК)
NM_001015053
NM_005474
NM_139205
NM_001382393
RefSeq (білок)
NP_001015053
NP_005465
NP_001369322
н/д
Локус (UCSC) Хр. 17: 44.08 – 44.12 Mb Хр. 11: 102.19 – 102.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGG
GGSPSPVELRGALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQK
QHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQ
RQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTP
GGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPGPYDSRD
DFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEI
TGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHR
ALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAE
RQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLL
LEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSP
LPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPE
ETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEED
CIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLAT
VPHQALGRTQSSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGN
THVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTL
LYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSA
VRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI
TAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNF
FPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAH
EFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVL
ALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKV
IEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQ
AAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Grozinger C.M., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1999). Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4868—4873. PMID 10220385 DOI:10.1073/pnas.96.9.4868
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • McKinsey T.A., Zhang C.-L., Lu J., Olson E.N. (2000). Signal-dependent nuclear export of a histone deacetylase regulates muscle differentiation. Nature. 408: 106—111. PMID 11081517 DOI:10.1038/35040593
  • McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2000). Activation of the myocyte enhancer factor-2 transcription factor by calcium/calmodulin-dependent protein kinase-stimulated binding of 14-3-3 to histone deacetylase 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 14400—14405. PMID 11114197 DOI:10.1073/pnas.260501497
  • McKinsey T.A., Zhang C.-L., Olson E.N. (2001). Identification of a signal-responsive nuclear export sequence in class II histone deacetylases. Mol. Cell. Biol. 21: 6312—6321. PMID 11509672 DOI:10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001
  • Hook S.S., Orian A., Cowley S.M., Eisenman R.N. (2002). Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger (PAZ domain) and copurifies with deubiquitinating enzymes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 13425—13430. PMID 12354939 DOI:10.1073/pnas.172511699

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Gistondeacetilaza 5 angl Histone deacetylase 5 bilok yakij koduyetsya genom HDAC5 roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 122 aminokislot a molekulyarna masa 121 978 HDAC5IdentifikatoriSimvoliHDAC5 HD5 NY CO 9 histone deacetylase 5Zovnishni ID OMIM 605315 MGI 1333784 HomoloGene 3995 GeneCards HDAC5Reaguye na spolukubelinostat givinostat pracinostat quisinostat romidepsin trichostatin A zolinza Ontologiya genaMolekulyarna funkciya NAD dependent histone deacetylase activity H3 K14 specific protein deacetylase activity histone deacetylase binding chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding hydrolase activity protein kinase C binding histone deacetylase activity transcription factor binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta kompleks Goldzhi histone deacetylase complex citoplazma klitinne yadro nukleoplazma gialoplazma nuclear speck GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces histone H3 deacetylation remodelyuvannya hromatinu regulation of myotube differentiation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated Epigenetichne uspadkuvannya positive regulation of DNA binding transcription factor activity regulation of histone H3 K9 acetylation response to activity transcription DNA templated protein deacetylation negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis B cell activation neuron differentiation negative regulation of myotube differentiation cellular response to insulin stimulus B cell differentiation inflammatory response regulation of protein binding GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated cellular response to lipopolysaccharide GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II response to cocaine GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II histone deacetylation GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10014 15184Ensembl ENSG00000108840 ENSMUSG00000008855UniProt Q9UQL6 Q9Z2V6RefSeq mRNK NM 001015053 NM 005474 NM 139205 NM 001382393NM 001077696 NM 001284248 NM 001284249 NM 001284250 NM 010412NM 001361596RefSeq bilok NP 001015053 NP 005465 NP 001369322n dLokus UCSC Hr 17 44 08 44 12 MbHr 11 102 19 102 23 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGG GGSPSPVELRGALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQK QHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQ RQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTP GGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPGPYDSRD DFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEI TGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHR ALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAE RQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLL LEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSP LPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPE ETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEED CIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLAT VPHQALGRTQSSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGN THVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTL LYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSA VRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI TAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNF FPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAH EFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVL ALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKV IEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQ AAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv gidrolaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaGrozinger C M Hassig C A Schreiber S L 1999 Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p Proc Natl Acad Sci U S A 96 4868 4873 PMID 10220385 DOI 10 1073 pnas 96 9 4868 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 McKinsey T A Zhang C L Lu J Olson E N 2000 Signal dependent nuclear export of a histone deacetylase regulates muscle differentiation Nature 408 106 111 PMID 11081517 DOI 10 1038 35040593 McKinsey T A Zhang C L Olson E N 2000 Activation of the myocyte enhancer factor 2 transcription factor by calcium calmodulin dependent protein kinase stimulated binding of 14 3 3 to histone deacetylase 5 Proc Natl Acad Sci U S A 97 14400 14405 PMID 11114197 DOI 10 1073 pnas 260501497 McKinsey T A Zhang C L Olson E N 2001 Identification of a signal responsive nuclear export sequence in class II histone deacetylases Mol Cell Biol 21 6312 6321 PMID 11509672 DOI 10 1128 MCB 21 18 6312 6321 2001 Hook S S Orian A Cowley S M Eisenman R N 2002 Histone deacetylase 6 binds polyubiquitin through its zinc finger PAZ domain and copurifies with deubiquitinating enzymes Proc Natl Acad Sci U S A 99 13425 13430 PMID 12354939 DOI 10 1073 pnas 172511699PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Histone deacetylase 5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 25 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ