FANCM (англ. Fanconi anemia complementation group M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 048 амінокислот, а молекулярна маса — 232 191.
FANCM | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | FANCM, FAAP250, KIAA1596, Fanconi anemia complementation group M, FA complementation group M, POF15, SPGF28 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609644 MGI: 2442306 HomoloGene: 35378 GeneCards: FANCM | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 14: 45.14 – 45.2 Mb | Хр. 12: 65.12 – 65.18 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSGRQRTLFQ | TWGSSISRSS | GTPGCSSGTE | RPQSPGSSKA | PLPAAAEAQL | ||||
ESDDDVLLVA | AYEAERQLCL | ENGGFCTSAG | ALWIYPTNCP | VRDYQLHISR | ||||
AALFCNTLVC | LPTGLGKTFI | AAVVMYNFYR | WFPSGKVVFM | APTKPLVTQQ | ||||
IEACYQVMGI | PQSHMAEMTG | STQASTRKEI | WCSKRVLFLT | PQVMVNDLSR | ||||
GACPAAEIKC | LVIDEAHKAL | GNYAYCQVVR | ELVKYTNHFR | ILALSATPGS | ||||
DIKAVQQVIT | NLLIGQIELR | SEDSPDILTY | SHERKVEKLI | VPLGEELAAI | ||||
QKTYIQILES | FARSLIQRNV | LMRRDIPNLT | KYQIILARDQ | FRKNPSPNIV | ||||
GIQQGIIEGE | FAICISLYHG | YELLQQMGMR | SLYFFLCGIM | DGTKGMTRSK | ||||
NELGRNEDFM | KLYNHLECMF | ARTRSTSANG | ISAIQQGDKN | KKFVYSHPKL | ||||
KKLEEVVIEH | FKSWNAENTT | EKKRDETRVM | IFSSFRDSVQ | EIAEMLSQHQ | ||||
PIIRVMTFVG | HASGKSTKGF | TQKEQLEVVK | QFRDGGYNTL | VSTCVGEEGL | ||||
DIGEVDLIIC | FDSQKSPIRL | VQRMGRTGRK | RQGRIVIILS | EGREERIYNQ | ||||
SQSNKRSIYK | AISSNRQVLH | FYQRSPRMVP | DGINPKLHKM | FITHGVYEPE | ||||
KPSRNLQRKS | SIFSYRDGMR | QSSLKKDWFL | SEEEFKLWNR | LYRLRDSDEI | ||||
KEITLPQVQF | SSLQNEENKP | AQESTTGIHQ | LSLSEWRLWQ | DHPLPTHQVD | ||||
HSDRCRHFIG | LMQMIEGMRH | EEGECSYELE | VESYLQMEDV | TSTFIAPRNE | ||||
SNNLASDTFI | THKKSSFIKN | INQGSSSSVI | ESDEECAEIV | KQTHIKPTKI | ||||
VSLKKKVSKE | IKKDQLKKEN | NHGIIDSVDN | DRNSTVENIF | QEDLPNDKRT | ||||
SDTDEIAATC | TINENVIKEP | CVLLTECQFT | NKSTSSLAGN | VLDSGYNSFN | ||||
DEKSVSSNLF | LPFEEELYIV | RTDDQFYNCH | SLTKEVLANV | ERFLSYSPPP | ||||
LSGLSDLEYE | IAKGTALENL | LFLPCAEHLR | SDKCTCLLSH | SAVNSQQNLE | ||||
LNSLKCINYP | SEKSCLYDIP | NDNISDEPSL | CDCDVHKHNQ | NENLVPNNRV | ||||
QIHRSPAQNL | VGENNHDVDN | SDLPVLSTDQ | DESLLLFEDV | NTEFDDVSLS | ||||
PLNSKSESLP | VSDKTAISET | PLVSQFLISD | ELLLDNNSEL | QDQITRDANS | ||||
FKSRDQRGVQ | EEKVKNHEDI | FDCSRDLFSV | TFDLGFCSPD | SDDEILEHTS | ||||
DSNRPLDDLY | GRYLEIKEIS | DANYVSNQAL | IPRDHSKNFT | SGTVIIPSNE | ||||
DMQNPNYVHL | PLSAAKNEEL | LSPGYSQFSL | PVQKKVMSTP | LSKSNTLNSF | ||||
SKIRKEILKT | PDSSKEKVNL | QRFKEALNST | FDYSEFSLEK | SKSSGPMYLH | ||||
KSCHSVEDGQ | LLTSNESEDD | EIFRRKVKRA | KGNVLNSPED | QKNSEVDSPL | ||||
HAVKKRRFPI | NRSELSSSDE | SENFPKPCSQ | LEDFKVCNGN | ARRGIKVPKR | ||||
QSHLKHVARK | FLDDEAELSE | EDAEYVSSDE | NDESENEQDS | SLLDFLNDET | ||||
QLSQAINDSE | MRAIYMKSLR | SPMMNNKYKM | IHKTHKNINI | FSQIPEQDET | ||||
YLEDSFCVDE | EESCKGQSSE | EEVCVDFNLI | TDDCFANSKK | YKTRRAVMLK | ||||
EMMEQNCAHS | KKKLSRIILP | DDSSEEENNV | NDKRESNIAV | NPSTVKKNKQ | ||||
QDHCLNSVPS | GSSAQSKVRS | TPRVNPLAKQ | SKQTSLNLKD | TISEVSDFKP | ||||
QNHNEVQSTT | PPFTTVDSQK | DCRKFPVPQK | DGSALEDSST | SGASCSKSRP | ||||
HLAGTHTSLR | LPQEGKGTCI | LVGGHEITSG | LEVISSLRAI | HGLQVEVCPL | ||||
NGCDYIVSNR | MVVERRSQSE | MLNSVNKNKF | IEQIQHLQSM | FERICVIVEK | ||||
DREKTGDTSR | MFRRTKSYDS | LLTTLIGAGI | RILFSSCQEE | TADLLKELSL | ||||
VEQRKNVGIH | VPTVVNSNKS | EALQFYLSIP | NISYITALNM | CHQFSSVKRM | ||||
ANSSLQEISM | YAQVTHQKAE | EIYRYIHYVF | DIQMLPNDLN | QDRLKSDI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 червня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
FANCM angl Fanconi anemia complementation group M bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 14 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 048 aminokislot a molekulyarna masa 232 191 FANCMNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4BXO 4DAY 4DRB 4E45 4M6WIdentifikatoriSimvoliFANCM FAAP250 KIAA1596 Fanconi anemia complementation group M FA complementation group M POF15 SPGF28Zovnishni ID OMIM 609644 MGI 2442306 HomoloGene 35378 GeneCards FANCMOntologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding nuclease activity nucleotide binding chromatin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ATP binding hydrolase activity GO 0008026 helicase activity GO 0043140 3 5 DNA helicase activityKlitinna komponenta FANCM MHF complex Fanconi anaemia nuclear complex klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces resolution of meiotic recombination intermediates interstrand cross link repair replication fork processing nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis cellular response to DNA damage stimulus GO 0100026 Reparaciya DNK DNA duplex unwinding positive regulation of protein monoubiquitinationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57697 104806Ensembl ENSG00000187790 ENSMUSG00000055884UniProt Q8IYD8 Q8BGE5RefSeq mRNK NM 001308133 NM 001308134 NM 020937NM 178912 NM 001364447RefSeq bilok NP 001295062 NP 001295063 NP 065988NP 849243 NP 001351376Lokus UCSC Hr 14 45 14 45 2 MbHr 12 65 12 65 18 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSGRQRTLFQTWGSSISRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQL ESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFCTSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISR AALFCNTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPSGKVVFMAPTKPLVTQQ IEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTRKEIWCSKRVLFLTPQVMVNDLSR GACPAAEIKCLVIDEAHKALGNYAYCQVVRELVKYTNHFRILALSATPGS DIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHERKVEKLIVPLGEELAAI QKTYIQILESFARSLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIV GIQQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSK NELGRNEDFMKLYNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKL KKLEEVVIEHFKSWNAENTTEKKRDETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQ PIIRVMTFVGHASGKSTKGFTQKEQLEVVKQFRDGGYNTLVSTCVGEEGL DIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGRTGRKRQGRIVIILSEGREERIYNQ SQSNKRSIYKAISSNRQVLHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPE KPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDWFLSEEEFKLWNRLYRLRDSDEI KEITLPQVQFSSLQNEENKPAQESTTGIHQLSLSEWRLWQDHPLPTHQVD HSDRCRHFIGLMQMIEGMRHEEGECSYELEVESYLQMEDVTSTFIAPRNE SNNLASDTFITHKKSSFIKNINQGSSSSVIESDEECAEIVKQTHIKPTKI VSLKKKVSKEIKKDQLKKENNHGIIDSVDNDRNSTVENIFQEDLPNDKRT SDTDEIAATCTINENVIKEPCVLLTECQFTNKSTSSLAGNVLDSGYNSFN DEKSVSSNLFLPFEEELYIVRTDDQFYNCHSLTKEVLANVERFLSYSPPP LSGLSDLEYEIAKGTALENLLFLPCAEHLRSDKCTCLLSHSAVNSQQNLE LNSLKCINYPSEKSCLYDIPNDNISDEPSLCDCDVHKHNQNENLVPNNRV QIHRSPAQNLVGENNHDVDNSDLPVLSTDQDESLLLFEDVNTEFDDVSLS PLNSKSESLPVSDKTAISETPLVSQFLISDELLLDNNSELQDQITRDANS FKSRDQRGVQEEKVKNHEDIFDCSRDLFSVTFDLGFCSPDSDDEILEHTS DSNRPLDDLYGRYLEIKEISDANYVSNQALIPRDHSKNFTSGTVIIPSNE DMQNPNYVHLPLSAAKNEELLSPGYSQFSLPVQKKVMSTPLSKSNTLNSF SKIRKEILKTPDSSKEKVNLQRFKEALNSTFDYSEFSLEKSKSSGPMYLH KSCHSVEDGQLLTSNESEDDEIFRRKVKRAKGNVLNSPEDQKNSEVDSPL HAVKKRRFPINRSELSSSDESENFPKPCSQLEDFKVCNGNARRGIKVPKR QSHLKHVARKFLDDEAELSEEDAEYVSSDENDESENEQDSSLLDFLNDET QLSQAINDSEMRAIYMKSLRSPMMNNKYKMIHKTHKNINIFSQIPEQDET YLEDSFCVDEEESCKGQSSEEEVCVDFNLITDDCFANSKKYKTRRAVMLK EMMEQNCAHSKKKLSRIILPDDSSEEENNVNDKRESNIAVNPSTVKKNKQ QDHCLNSVPSGSSAQSKVRSTPRVNPLAKQSKQTSLNLKDTISEVSDFKP QNHNEVQSTTPPFTTVDSQKDCRKFPVPQKDGSALEDSSTSGASCSKSRP HLAGTHTSLRLPQEGKGTCILVGGHEITSGLEVISSLRAIHGLQVEVCPL NGCDYIVSNRMVVERRSQSEMLNSVNKNKFIEQIQHLQSMFERICVIVEK DREKTGDTSRMFRRTKSYDSLLTTLIGAGIRILFSSCQEETADLLKELSL VEQRKNVGIHVPTVVNSNKSEALQFYLSIPNISYITALNMCHQFSSVKRM ANSSLQEISMYAQVTHQKAEEIYRYIHYVFDIQMLPNDLNQDRLKSDI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK reparaciya DNK alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Nagase T Kikuno R Nakayama M Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVIII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 273 281 PMID 10997877 DOI 10 1093 dnares 7 4 271PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 chervnya 2017 Procitovano 20 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 20 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 14 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi