EBF1 (англ. Early B-cell factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 64 464.
EBF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EBF1, COE1, EBF, O/E-1, OLF1, early B-cell factor 1, early B cell factor 1, EBF transcription factor 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
рак молочної залози, ожиріння | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 158.7 – 159.1 Mb | Хр. 11: 44.62 – 45.01 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MFGIQESIQR | SGSSMKEEPL | GSGMNAVRTW | MQGAGVLDAN | TAAQSGVGLA | ||||
RAHFEKQPPS | NLRKSNFFHF | VLALYDRQGQ | PVEIERTAFV | GFVEKEKEAN | ||||
SEKTNNGIHY | RLQLLYSNGI | RTEQDFYVRL | IDSMTKQAIV | YEGQDKNPEM | ||||
CRVLLTHEIM | CSRCCDKKSC | GNRNETPSDP | VIIDRFFLKF | FLKCNQNCLK | ||||
NAGNPRDMRR | FQVVVSTTVN | VDGHVLAVSD | NMFVHNNSKH | GRRARRLDPS | ||||
EGTPSYLEHA | TPCIKAISPS | EGWTTGGATV | IIIGDNFFDG | LQVIFGTMLV | ||||
WSELITPHAI | RVQTPPRHIP | GVVEVTLSYK | SKQFCKGTPG | RFIYTALNEP | ||||
TIDYGFQRLQ | KVIPRHPGDP | ERLPKEVILK | RAADLVEALY | GMPHNNQEII | ||||
LKRAADIAEA | LYSVPRNHNQ | LPALANTSVH | AGMMGVNSFS | GQLAVNVSEA | ||||
SQATNQGFTR | NSSSVSPHGY | VPSTTPQQTN | YNSVTTSMNG | YGSAAMSNLG | ||||
GSPTFLNGSA | ANSPYAIVPS | SPTMASSTSL | PSNCSSSSGI | FSFSPANMVS | ||||
AVKQKSAFAP | VVRPQTSPPP | TCTSTNGNSL | QAISGMIVPP | M |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, . Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Gisler R., Jacobsen S.E., Sigvardsson M. (2000). Cloning of human early B-cell factor and identification of target genes suggest a conserved role in B-cell development in man and mouse. Blood. 96: 1457—1464. PMID 10942392
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з EBF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3126 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EBF1 angl Early B cell factor 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 591 aminokislot a molekulyarna masa 64 464 EBF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB3LYR 3MQIIdentifikatoriSimvoliEBF1 COE1 EBF O E 1 OLF1 early B cell factor 1 early B cell factor 1 EBF transcription factor 1Zovnishni ID OMIM 164343 MGI 95275 HomoloGene 7297 GeneCards EBF1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarak molochnoyi zalozi ozhirinnyaOntologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity protein dimerization activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific C2H2 zinc finger domain binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta klitinne yadroBiologichnij proces multicellular organism development GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1879 13591Ensembl ENSG00000164330 ENSMUSG00000057098UniProt Q9UH73 Q07802RefSeq mRNK NM 001290360 NM 024007 NM 182708 NM 001324101 NM 001324103NM 001324106 NM 001324107 NM 001324108 NM 001324109 NM 001324111 NM 001364155 NM 001364156 NM 001364157 NM 001364158 NM 001364159NM 001290709 NM 001290710 NM 001290711 NM 007897RefSeq bilok NP 001277289 NP 001311030 NP 001311032 NP 001311035 NP 001311036NP 001311037 NP 001311038 NP 001311040 NP 076870 NP 874367 NP 001351084 NP 001351085 NP 001351086 NP 001351087 NP 001351088NP 001277638 NP 001277639 NP 001277640 NP 031923 NP 001349498NP 001349500 NP 001349503 NP 001349504 NP 001349505 NP 001349506 NP 001349507 NP 001349508Lokus UCSC Hr 5 158 7 159 1 MbHr 11 44 62 45 01 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPSNLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGIRTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDPVIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKHGRRARRLDPSEGTPSYLEHATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVIFGTMLVWSELITPHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGTPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQKVIPRHPGDPERLPKEVILKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQLPALANTSVHAGMMGVNSFSGQLAVNVSEASQATNQGFTRNSSSVSPHGYVPSTTPQQTNYNSVTTSMNGYGSAAMSNLGGSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSSGIFSFSPANMVSAVKQKSAFAPVVRPQTSPPPTCTSTNGNSLQAISGMIVPPMA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PMID 25114211 DOI 10 1073 pnas 1413825111 Gisler R Jacobsen S E Sigvardsson M 2000 Cloning of human early B cell factor and identification of target genes suggest a conserved role in B cell development in man and mouse Blood 96 1457 1464 PMID 10942392PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z EBF1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 3126 angl Procitovano 31 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 bereznya 2018 Procitovano 31 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 5Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij