DNA2 (англ. DNA replication helicase/nuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 120 415.
DNA2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DNA2, DNA2L, hDNA replication helicase/nuclease 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601810 MGI: 2443732 HomoloGene: 6124 GeneCards: DNA2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
mitochondrial DNA deletion syndrome with progressive myopathy, Seckel syndrome 8 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 68.41 – 68.47 Mb | Хр. 10: 62.78 – 62.81 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEQLNELELL | MEKSFWEEAE | LPAELFQKKV | VASFPRTVLS | TGMDNRYLVL | ||||
AVNTVQNKEG | NCEKRLVITA | SQSLENKELC | ILRNDWCSVP | VEPGDIIHLE | ||||
GDCTSDTWII | DKDFGYLILY | PDMLISGTSI | ASSIRCMRRA | VLSETFRSSD | ||||
PATRQMLIGT | VLHEVFQKAI | NNSFAPEKLQ | ELAFQTIQEI | RHLKEMYRLN | ||||
LSQDEIKQEV | EDYLPSFCKW | AGDFMHKNTS | TDFPQMQLSL | PSDNSKDNST | ||||
CNIEVVKPMD | IEESIWSPRF | GLKGKIDVTV | GVKIHRGYKT | KYKIMPLELK | ||||
TGKESNSIEH | RSQVVLYTLL | SQERRADPEA | GLLLYLKTGQ | MYPVPANHLD | ||||
KRELLKLRNQ | MAFSLFHRIS | KSATRQKTQL | ASLPQIIEEE | KTCKYCSQIG | ||||
NCALYSRAVE | QQMDCSSVPI | VMLPKIEEET | QHLKQTHLEY | FSLWCLMLTL | ||||
ESQSKDNKKN | HQNIWLMPAS | EMEKSGSCIG | NLIRMEHVKI | VCDGQYLHNF | ||||
QCKHGAIPVT | NLMAGDRVIV | SGEERSLFAL | SRGYVKEINM | TTVTCLLDRN | ||||
LSVLPESTLF | RLDQEEKNCD | IDTPLGNLSK | LMENTFVSKK | LRDLIIDFRE | ||||
PQFISYLSSV | LPHDAKDTVA | CILKGLNKPQ | RQAMKKVLLS | KDYTLIVGMP | ||||
GTGKTTTICT | LVRILYACGF | SVLLTSYTHS | AVDNILLKLA | KFKIGFLRLG | ||||
QIQKVHPAIQ | QFTEQEICRS | KSIKSLALLE | ELYNSQLIVA | TTCMGINHPI | ||||
FSRKIFDFCI | VDEASQISQP | ICLGPLFFSR | RFVLVGDHQQ | LPPLVLNREA | ||||
RALGMSESLF | KRLEQNKSAV | VQLTVQYRMN | SKIMSLSNKL | TYEGKLECGS | ||||
DKVANAVINL | RHFKDVKLEL | EFYADYSDNP | WLMGVFEPNN | PVCFLNTDKV | ||||
PAPEQVEKGG | VSNVTEAKLI | VFLTSIFVKA | GCSPSDIGII | APYRQQLKII | ||||
NDLLARSIGM | VEVNTVDKYQ | GRDKSIVLVS | FVRSNKDGTV | GELLKDWRRL | ||||
NVAITRAKHK | LILLGCVPSL | NCYPPLEKLL | NHLNSEKLII | DLPSREHESL | ||||
CHILGDFQRE |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у ядрі, мітохондрії.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Masuda-Sasa T., Imamura O., Campbell J.L. (2006). Biochemical analysis of human Dna2. Nucleic Acids Res. 34: 1865—1875. PMID 16595800 DOI:10.1093/nar/gkl070
- Balakrishnan L., Stewart J., Polaczek P., Campbell J.L., Bambara R.A. (2010). Acetylation of Dna2 endonuclease/helicase and flap endonuclease 1 by p300 promotes DNA stability by creating long flap intermediates. J. Biol. Chem. 285: 4398—4404. PMID 20019387 DOI:10.1074/jbc.M109.086397
- Gloor J.W., Balakrishnan L., Campbell J.L., Bambara R.A. (2012). Biochemical analyses indicate that binding and cleavage specificities define the ordered processing of human Okazaki fragments by Dna2 and FEN1. Nucleic Acids Res. 40: 6774—6786. PMID 22570407 DOI:10.1093/nar/gks388
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з DNA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2939 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
DNA2 angl DNA replication helicase nuclease 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 060 aminokislot a molekulyarna masa 120 415 DNA2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB5EAYIdentifikatoriSimvoliDNA2 DNA2L hDNA replication helicase nuclease 2Zovnishni ID OMIM 601810 MGI 2443732 HomoloGene 6124 GeneCards DNA2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyamitochondrial DNA deletion syndrome with progressive myopathy Seckel syndrome 8 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding 4 iron 4 sulfur cluster binding nucleotide binding GO 0008026 helicase activity iron sulfur cluster binding zv yazuvannya z ionom metalu 5 flap endonuclease activity GO 0004003 DNA helicase activity ATPase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist GO 0043141 5 3 DNA helicase activity nuclease activity endonuclease activity site specific endodeoxyribonuclease activity specific for altered base hydrolase activity ATP binding GO 0043142 single stranded DNA helicase activity RNA bindingKlitinna komponenta nukleoplazma gamma DNA polymerase complex mitochondrial nucleoid klitinne yadro mitohondriya citoplazmaBiologichnij proces mitotic telomere maintenance via semi conservative replication mitochondrial DNA repair nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis DNA double strand break processing mitochondrial DNA replication cellular response to DNA damage stimulus DNA replication checkpoint signaling positive regulation of DNA replication obmin rechovin base excision repair DNA replication removal of RNA primer replikaciya DNK telomere maintenance DNA duplex unwinding GO 0100026 Reparaciya DNK G quadruplex DNA unwinding t circle formation telomere maintenance via semi conservative replication DNA replication Okazaki fragment processing replication fork reversal regulation of signal transduction by p53 class mediatorDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1763 327762Ensembl ENSG00000138346 ENSMUSG00000036875UniProt P51530 Q6ZQJ5RefSeq mRNK NM 001080449NM 177372RefSeq bilok NP 001073918NP 796346Lokus UCSC Hr 10 68 41 68 47 MbHr 10 62 78 62 81 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEQLNELELLMEKSFWEEAELPAELFQKKVVASFPRTVLSTGMDNRYLVL AVNTVQNKEGNCEKRLVITASQSLENKELCILRNDWCSVPVEPGDIIHLE GDCTSDTWIIDKDFGYLILYPDMLISGTSIASSIRCMRRAVLSETFRSSD PATRQMLIGTVLHEVFQKAINNSFAPEKLQELAFQTIQEIRHLKEMYRLN LSQDEIKQEVEDYLPSFCKWAGDFMHKNTSTDFPQMQLSLPSDNSKDNST CNIEVVKPMDIEESIWSPRFGLKGKIDVTVGVKIHRGYKTKYKIMPLELK TGKESNSIEHRSQVVLYTLLSQERRADPEAGLLLYLKTGQMYPVPANHLD KRELLKLRNQMAFSLFHRISKSATRQKTQLASLPQIIEEEKTCKYCSQIG NCALYSRAVEQQMDCSSVPIVMLPKIEEETQHLKQTHLEYFSLWCLMLTL ESQSKDNKKNHQNIWLMPASEMEKSGSCIGNLIRMEHVKIVCDGQYLHNF QCKHGAIPVTNLMAGDRVIVSGEERSLFALSRGYVKEINMTTVTCLLDRN LSVLPESTLFRLDQEEKNCDIDTPLGNLSKLMENTFVSKKLRDLIIDFRE PQFISYLSSVLPHDAKDTVACILKGLNKPQRQAMKKVLLSKDYTLIVGMP GTGKTTTICTLVRILYACGFSVLLTSYTHSAVDNILLKLAKFKIGFLRLG QIQKVHPAIQQFTEQEICRSKSIKSLALLEELYNSQLIVATTCMGINHPI FSRKIFDFCIVDEASQISQPICLGPLFFSRRFVLVGDHQQLPPLVLNREA RALGMSESLFKRLEQNKSAVVQLTVQYRMNSKIMSLSNKLTYEGKLECGS DKVANAVINLRHFKDVKLELEFYADYSDNPWLMGVFEPNNPVCFLNTDKV PAPEQVEKGGVSNVTEAKLIVFLTSIFVKAGCSPSDIGIIAPYRQQLKII NDLLARSIGMVEVNTVDKYQGRDKSIVLVSFVRSNKDGTVGELLKDWRRL NVAITRAKHKLILLGCVPSLNCYPPLEKLLNHLNSEKLIIDLPSREHESL CHILGDFQRE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz nukleaz endonukleaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK reparaciya DNK replikaciya DNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom zaliza DNK grupoyu 4Fe 4S zalizo sirchanoyu grupoyu Lokalizovanij u yadri mitohondriyi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Masuda Sasa T Imamura O Campbell J L 2006 Biochemical analysis of human Dna2 Nucleic Acids Res 34 1865 1875 PMID 16595800 DOI 10 1093 nar gkl070 Balakrishnan L Stewart J Polaczek P Campbell J L Bambara R A 2010 Acetylation of Dna2 endonuclease helicase and flap endonuclease 1 by p300 promotes DNA stability by creating long flap intermediates J Biol Chem 285 4398 4404 PMID 20019387 DOI 10 1074 jbc M109 086397 Gloor J W Balakrishnan L Campbell J L Bambara R A 2012 Biochemical analyses indicate that binding and cleavage specificities define the ordered processing of human Okazaki fragments by Dna2 and FEN1 Nucleic Acids Res 40 6774 6786 PMID 22570407 DOI 10 1093 nar gks388PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z DNA2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2939 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 29 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi