COMP (англ. Cartilage oligomeric matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 82 860.
COMP | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | COMP, EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5, cartilage oligomeric matrix protein, TSP5, CTS2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600310 MGI: 88469 HomoloGene: 74 GeneCards: COMP | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
pseudoachondroplasia | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.78 – 18.79 Mb | Хр. 8: 70.83 – 70.83 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVPDTACVLL | LTLAALGASG | QGQSPLGSDL | GPQMLRELQE | TNAALQDVRE | ||||
LLRQQVREIT | FLKNTVMECD | ACGMQQSVRT | GLPSVRPLLH | CAPGFCFPGV | ||||
ACIQTESGAR | CGPCPAGFTG | NGSHCTDVNE | CNAHPCFPRV | RCINTSPGFR | ||||
CEACPPGYSG | PTHQGVGLAF | AKANKQVCTD | INECETGQHN | CVPNSVCINT | ||||
RGSFQCGPCQ | PGFVGDQASG | CQRRAQRFCP | DGSPSECHEH | ADCVLERDGS | ||||
RSCVCAVGWA | GNGILCGRDT | DLDGFPDEKL | RCPERQCRKD | NCVTVPNSGQ | ||||
EDVDRDGIGD | ACDPDADGDG | VPNEKDNCPL | VRNPDQRNTD | EDKWGDACDN | ||||
CRSQKNDDQK | DTDQDGRGDA | CDDDIDGDRI | RNQADNCPRV | PNSDQKDSDG | ||||
DGIGDACDNC | PQKSNPDQAD | VDHDFVGDAC | DSDQDQDGDG | HQDSRDNCPT | ||||
VPNSAQEDSD | HDGQGDACDD | DDDNDGVPDS | RDNCRLVPNP | GQEDADRDGV | ||||
GDVCQDDFDA | DKVVDKIDVC | PENAEVTLTD | FRAFQTVVLD | PEGDAQIDPN | ||||
WVVLNQGREI | VQTMNSDPGL | AVGYTAFNGV | DFEGTFHVNT | VTDDDYAGFI | ||||
FGYQDSSSFY | VVMWKQMEQT | YWQANPFRAV | AEPGIQLKAV | KSSTGPGEQL | ||||
RNALWHTGDT | ESQVRLLWKD | PRNVGWKDKK | SYRWFLQHRP | QVGYIRVRFY | ||||
EGPELVADSN | VVLDTTMRGG | RLGVFCFSQE | NIIWANLRYR | CNDTIPEDYE | ||||
THQLRQA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen H., Deere M., Hecht J.T., Lawler J. (2000). Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium-binding protein, and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes. J. Biol. Chem. 275: 26538—26544. PMID 10852928 DOI:10.1074/jbc.M909780199
- Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200
- Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
- Koelling S., Clauditz T.S., Kaste M., Miosge N. (2006). Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis. Arthritis Res. Ther. 8: R56—R56. PMID 16542502 DOI:10.1186/ar1922
- Gagarina V., Carlberg A.L., Pereira-Mouries L., Hall D.J. (2008). Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins. J. Biol. Chem. 283: 648—659. PMID 17993464 DOI:10.1074/jbc.M704035200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з COMP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
COMP angl Cartilage oligomeric matrix protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 757 aminokislot a molekulyarna masa 82 860 COMPNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3FBYIdentifikatoriSimvoliCOMP EDM1 EPD1 MED PSACH THBS5 cartilage oligomeric matrix protein TSP5 CTS2Zovnishni ID OMIM 600310 MGI 88469 HomoloGene 74 GeneCards COMPPov yazani genetichni zahvoryuvannyapseudoachondroplasia Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protease binding calcium ion binding heparan sulfate proteoglycan binding heparin binding extracellular matrix structural constituent GO 0001948 GO 0016582 protein binding collagen binding integrin binding BMP binding proteoglycan bindingKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya ekzosoma mizhklitinnij prostir extracellular region GO 0009327 protein containing complex collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces animal organ morphogenesis growth plate cartilage development skeletal system development adgeziya klitin extracellular matrix organization negative regulation of apoptotic process limb development GO 0097285 apoptoz osifikaciya chondrocyte development endochondral bone growth response to unfolded protein zsidannya krovi protein secretion multicellular organism aging regulyaciya ekspresiyi geniv vascular associated smooth muscle contraction protein processing collagen fibril organization bone mineralization regulation of bone mineralization BMP signaling pathway multicellular organism growth chondrocyte proliferation tendon development skin development artery morphogenesis musculoskeletal movement neuromuscular process cartilage development bone morphogenesis platelet aggregation vascular associated smooth muscle cell development bone growth negative regulation of hemostasis positive regulation of chondrocyte proliferationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1311 12845Ensembl ENSG00000105664 ENSMUSG00000031849UniProt P49747 Q9R0G6RefSeq mRNK NM 000095NM 016685RefSeq bilok NP 000086NP 057894Lokus UCSC Hr 19 18 78 18 79 MbHr 8 70 83 70 83 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MVPDTACVLLLTLAALGASGQGQSPLGSDLGPQMLRELQETNAALQDVRE LLRQQVREITFLKNTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGV ACIQTESGARCGPCPAGFTGNGSHCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFR CEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINT RGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHEHADCVLERDGS RSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVTVPNSGQ EDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDN CRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDG DGIGDACDNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPT VPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGV GDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPN WVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFI FGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQL RNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFY EGPELVADSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYE THQLRQA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak apoptoz klitinna adgeziya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu z molekuloyu geparinu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Chen H Deere M Hecht J T Lawler J 2000 Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium binding protein and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes J Biol Chem 275 26538 26544 PMID 10852928 DOI 10 1074 jbc M909780199 Mann H H Oezbek S Engel J Paulsson M Wagener R 2004 Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias J Biol Chem 279 25294 25298 PMID 15075323 DOI 10 1074 jbc M403778200 Chen F H Thomas A O Hecht J T Goldring M B Lawler J 2005 Cartilage oligomeric matrix protein thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins J Biol Chem 280 32655 32661 PMID 16051604 DOI 10 1074 jbc M504778200 Koelling S Clauditz T S Kaste M Miosge N 2006 Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis Arthritis Res Ther 8 R56 R56 PMID 16542502 DOI 10 1186 ar1922 Gagarina V Carlberg A L Pereira Mouries L Hall D J 2008 Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins J Biol Chem 283 648 659 PMID 17993464 DOI 10 1074 jbc M704035200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z COMP pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi