CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456.
CDH1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 68.74 – 68.84 Mb | Хр. 8: 107.33 – 107.4 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGPWSRSLSA | LLLLLQVSSW | LCQEPEPCHP | GFDAESYTFT | VPRRHLERGR | ||||
VLGRVNFEDC | TGRQRTAYFS | LDTRFKVGTD | GVITVKRPLR | FHNPQIHFLV | ||||
YAWDSTYRKF | STKVTLNTVG | HHHRPPPHQA | SVSGIQAELL | TFPNSSPGLR | ||||
RQKRDWVIPP | ISCPENEKGP | FPKNLVQIKS | NKDKEGKVFY | SITGQGADTP | ||||
PVGVFIIERE | TGWLKVTEPL | DRERIATYTL | FSHAVSSNGN | AVEDPMEILI | ||||
TVTDQNDNKP | EFTQEVFKGS | VMEGALPGTS | VMEVTATDAD | DDVNTYNAAI | ||||
AYTILSQDPE | LPDKNMFTIN | RNTGVISVVT | TGLDRESFPT | YTLVVQAADL | ||||
QGEGLSTTAT | AVITVTDTND | NPPIFNPTTY | KGQVPENEAN | VVITTLKVTD | ||||
ADAPNTPAWE | AVYTILNDDG | GQFVVTTNPV | NNDGILKTAK | GLDFEAKQQY | ||||
ILHVAVTNVV | PFEVSLTTST | ATVTVDVLDV | NEAPIFVPPE | KRVEVSEDFG | ||||
VGQEITSYTA | QEPDTFMEQK | ITYRIWRDTA | NWLEINPDTG | AISTRAELDR | ||||
EDFEHVKNST | YTALIIATDN | GSPVATGTGT | LLLILSDVND | NAPIPEPRTI | ||||
FFCERNPKPQ | VINIIDADLP | PNTSPFTAEL | THGASANWTI | QYNDPTQESI | ||||
ILKPKMALEV | GDYKINLKLM | DNQNKDQVTT | LEVSVCDCEG | AAGVCRKAQP | ||||
VEAGLQIPAI | LGILGGILAL | LILILLLLLF | LRRRAVVKEP | LLPPEDDTRD | ||||
NVYYYDEEGG | GEEDQDFDLS | QLHRGLDARP | EVTRNDVAPT | LMSVPRYLPR | ||||
PANPDEIGNF | IDENLKAADT | DPTAPPYDSL | LVFDYEGSGS | EAASLSSLNS | ||||
SESDKDQDYD | YLNEWGNRFK | KLADMYGGGE | DD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA. Mol. Biol. Rep. 17: 123—128. PMID 8459805 DOI:10.1007/BF00996219
- Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754—1761. PMID 8185635 DOI:10.1006/bbrc.1994.1656
- Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284—1290. PMID 8093045 DOI:10.1006/bbrc.1994.2321
- Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin. Differentiation. 38: 67—71. PMID 3263290 DOI:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
- Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246—4250. PMID 2349235 DOI:10.1073/pnas.87.11.4246
- Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion. FEBS Lett. 355: 195—200. PMID 7982500 DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CDH1 angl Cadherin 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 882 aminokislot a molekulyarna masa 97 456 CDH1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1O6S 2O72 2OMT 2OMU 2OMV 2OMX 2OMY 2OMZ 3FF7 3FF8 3L6X 3L6Y 4ZT1 4ZTEIdentifikatoriSimvoliCDH1 Arc 1 CD324 CDHE ECAD LCAM UVO cadherin 1 BCDS1 E cadherin uvomorulinZovnishni ID OMIM 192090 MGI 88354 HomoloGene 20917 GeneCards CDH1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyakolorektalnij rak Blepharo cheilo odontic syndrome hereditary diffuse gastric cancer Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ankyrin binding gamma catenin binding beta catenin binding GTPase activating protein binding zv yazuvannya z ionom metalu cell adhesion molecule binding cadherin binding identical protein binding cytoskeletal protein binding protein homodimerization activityKlitinna komponenta apical junction complex trans Golgi network extracellular region perinuclear region of cytoplasm cortical actin cytoskeleton kompleks Goldzhi lamellipodium cytoplasmic side of plasma membrane endosoma lateral plasma membrane catenin complex actin cytoskeleton flotillin complex membrana ekzosoma integral component of membrane mizhklitinni kontakti citoplazma klitinna membrana cell surface postsynapse glutamatergic synapseBiologichnij proces negative regulation of cell cell adhesion GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated cellular response to lithium ion adgeziya klitin extracellular matrix organization cellular response to indole 3 methanol extracellular matrix disassembly synapse assembly pituitary gland development response to toxic substance response to organic substance neuron projection development adherens junction organization homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules entry of bacterium into host cell protein localization to plasma membrane cell cell adhesion GO 0000767 cell morphogenesis cell cell junction assembly regulyaciya ekspresiyi geniv calcium dependent cell cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules negative regulation of cell migration positive regulation of protein import into nucleus cell cell adhesion mediated by cadherin regulation of protein catabolic process at postsynapse modulating synaptic transmissionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez999 12550Ensembl ENSG00000039068 ENSMUSG00000000303UniProt P12830 P09803RefSeq mRNK NM 004360 NM 001317184 NM 001317185 NM 001317186NM 009864RefSeq bilok NP 001304113 NP 001304114 NP 001304115 NP 004351NP 033994Lokus UCSC Hr 16 68 74 68 84 MbHr 8 107 33 107 4 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGR VLGRVNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLV YAWDSTYRKFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLR RQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTP PVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILI TVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADL QGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTD ADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQY ILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFG VGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDR EDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESI ILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQP VEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRD NVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPR PANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNS SESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah aparati goldzhi endosomah LiteraturaBussemakers M J G Mees S G M van Bokhoven A Debruyne F M J Schalken J A 1993 Molecular cloning and characterization of the human E cadherin cDNA Mol Biol Rep 17 123 128 PMID 8459805 DOI 10 1007 BF00996219 Rimm D L Morrow J S 1994 Molecular cloning of human E cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily Biochem Biophys Res Commun 200 1754 1761 PMID 8185635 DOI 10 1006 bbrc 1994 1656 Bussemakers M J G Giroldi L A van Bokhoven A Schalken J A 1994 Transcriptional regulation of the human E cadherin gene in human prostate cancer cell lines characterization of the human E cadherin gene promoter Biochem Biophys Res Commun 203 1284 1290 PMID 8093045 DOI 10 1006 bbrc 1994 2321 Mansouri A Spurr N Goodfellow P N Kemler R 1988 Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin Differentiation 38 67 71 PMID 3263290 DOI 10 1111 j 1432 0436 1988 tb00593 x Ozawa M Ringwald M Kemler R 1990 Uvomorulin catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule Proc Natl Acad Sci U S A 87 4246 4250 PMID 2349235 DOI 10 1073 pnas 87 11 4246 Butz S Kemler R 1994 Distinct cadherin catenin complexes in Ca 2 dependent cell cell adhesion FEBS Lett 355 195 200 PMID 7982500 DOI 10 1016 0014 5793 94 01205 9PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CDH1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 zhovtnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 21 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi