Alcanivorax borkumensis | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Біологічна класифікація | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
Alcanivorax borkumensis Yakimov et al. 1998 | ||||||||||||||
Посилання | ||||||||||||||
|
Alcanivorax borkumensis — грам-негативна, паличкоподібна бактерія роду Alcanivorax. Є типовим видом цього роду. Вперше була виділена в акваторії Північного моря і описана Якимовим та співавторами в 1998 році. Здатна використовувати вуглеводні як єдине джерело вугляцю. Бере участь в біоочищенні морських екосистем від нафтових забруднень.
Біологічні властивості
Морфологія
A. borkumensis — нерухомі, неспоротворні грам-негативні паличкоподібні бактерії розміром 2-3 × 0,4-0,7 мікрон. Не утворюють капсул, на мають джгутиків, клітини чутливі до осмотичного шоку. Зерна, які можна побачити в клітинах на електронно-мікроскопічних знімках, є гранулами поліфосфату. Клітини стають коротшими (1-1,5 мікрон) у присутності н-алканів в живильному середовищі.
Культуральні властивості
A. borkumensis — хемоорганогетеротроф, аероб. Оптимальна температура для росту 20-30 °C. Галофіл, оптимальна концентрація хлориду натрію в середовищі 3-10 %, максимальна 12,5 %, ріст в осмотично еквівалентному середовищу у відсутності іонов натрію неможливий. Оксидазо-позитивний, синтезує каталазу, відновлює нітрат до нітриту. Використовує вуглеводні (наприклад, н-гексадекан) як єдине джерело вуглецю, не здатний використовувати вуглеводи (глюкозу, лактозу, фруктозу, цукрозу і т. д.) як джерело вуглецю. Здатний утилізувати форміат, ацетат, пропіонат, метилпіруват і α-кетоглутарат. Продукує позаклітинні глюколіпіди, що володіють поверхнево-активними властивостями.
Геном
Геном A. borkumensis штаму SK2 представлений кільцевою дволанцюжковою молекулою ДНК розміром 3120143 пар основ і містить 2806 генів, з яких 2755 кодують білки, вміст ГЦ становить 54 %. Особливостями геному A. borkumensis є сильна спрощеність, нечисленність мобільних генетичних елементів і генів, що відповідають за продукцію енергії, проте велике число генів, що відповідають за деградацію вуглеводнів, утворення детергентів, що полегшують емульгування вуглеводнів в морській воді, утворення біоплівок на поверхні крапель нафти — все це пов'язано зі специфічним пристосуванням до біодеградації вуглеводнів. При рості на піруваті і гексадекані відмічають зміну рівня експресії 97 мембранних і цитоплазматичних білків, що імовірно відносяться до 46 оперонів. Також для A. borkumensis характерний альтернативний шлях біосинтезу жирів.
Значення
A. borkumensis є домінуючим мікроорганізмом нафтових забруднень у присутності доступних джерел фосфору і азоту, здійснюючи біодеградацію вуклеводнів. Таким чином ця бактерія приймає важливе значення в біоочищенні нафтових забруднень морських екосистем. Також представляють інтерес позаклітинні A. borkumensis, що мають властивості детергентів і здібні до емульгація нафти, руйнуючи нафтові плями. Зараз розробляються генно-інженерні підходи використання позаклітинних полігідроксиалконатів A. borkumensis.
Посилання
- Yakimov, M.M., Golyshin, P.N., Lang, S., Moore, E.R., Abraham, W.R., Lunsdorf, H., and Timmis, K.N. (1998). Alcanivorax borkumensis gen. nov., sp. nov., a new, hydrocarbon-degrading and surfactant-producing marine bacterium. Int. J. Syst. Bacteriol. 48: 339—348. PMID 9731272.
- . Архів оригіналу за 4 липня 2008. Процитовано 24 січня 2009.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=genome&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=19683
- . Архів оригіналу за 10 лютого 2009. Процитовано 24 січня 2009.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - http://bib1lp1.rz.tu-bs.de/docportal/servlets/MCRFileNodeServlet/DocPortal_derivate_00003237/Sabirova-diss.pdf;jsessionid=0000Ld7MQC9JW1rnqPz0pkvn0Ty?hosts=local[недоступне посилання з лютого 2019]
- http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1482905
- . Архів оригіналу за 12 жовтня 2008. Процитовано 24 січня 2009.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title () - http://www3.interscience.wiley.com/journal/118898677/abstract[недоступне посилання з травня 2019]
- http://www3.interscience.wiley.com/journal/119879245/abstract[недоступне посилання з травня 2019]
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9714737
- http://www2.psu.ac.th/PresidentOffice/EduService/journal/27-6-pdf/15-marine-microorganisms.pdf[недоступне посилання з лютого 2019]
- . Архів оригіналу за 4 березня 2016. Процитовано 24 січня 2009.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title ()
Це незавершена стаття з бактеріології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Alcanivorax borkumensis Biologichna klasifikaciya Domen Bakteriyi Bacteria Tip Proteobakteriyi Proteobacteria Klas Gamma proteobakteriyi g Proteobacteria Ryad Oceanospirillales Rodina Alcanivoracaceae Rid Alcanivorax Vid Alcanivorax borkumensis Binomialna nazva Alcanivorax borkumensis Yakimov et al 1998 Posilannya Vikividi Alcanivorax borkumensis EOL 971679 ITIS 959121 NCBI 59754 Alcanivorax borkumensis gram negativna palichkopodibna bakteriya rodu Alcanivorax Ye tipovim vidom cogo rodu Vpershe bula vidilena v akvatoriyi Pivnichnogo morya i opisana Yakimovim ta spivavtorami v 1998 roci Zdatna vikoristovuvati vuglevodni yak yedine dzherelo vuglyacyu Bere uchast v bioochishenni morskih ekosistem vid naftovih zabrudnen Biologichni vlastivostiMorfologiya A borkumensis neruhomi nesporotvorni gram negativni palichkopodibni bakteriyi rozmirom 2 3 0 4 0 7 mikron Ne utvoryuyut kapsul na mayut dzhgutikiv klitini chutlivi do osmotichnogo shoku Zerna yaki mozhna pobachiti v klitinah na elektronno mikroskopichnih znimkah ye granulami polifosfatu Klitini stayut korotshimi 1 1 5 mikron u prisutnosti n alkaniv v zhivilnomu seredovishi Kulturalni vlastivosti A borkumensis hemoorganogeterotrof aerob Optimalna temperatura dlya rostu 20 30 C Galofil optimalna koncentraciya hloridu natriyu v seredovishi 3 10 maksimalna 12 5 rist v osmotichno ekvivalentnomu seredovishu u vidsutnosti ionov natriyu nemozhlivij Oksidazo pozitivnij sintezuye katalazu vidnovlyuye nitrat do nitritu Vikoristovuye vuglevodni napriklad n geksadekan yak yedine dzherelo vuglecyu ne zdatnij vikoristovuvati vuglevodi glyukozu laktozu fruktozu cukrozu i t d yak dzherelo vuglecyu Zdatnij utilizuvati formiat acetat propionat metilpiruvat i a ketoglutarat Produkuye pozaklitinni glyukolipidi sho volodiyut poverhnevo aktivnimi vlastivostyami Genom Genom A borkumensis shtamu SK2 predstavlenij kilcevoyu dvolancyuzhkovoyu molekuloyu DNK rozmirom 3120143 par osnov i mistit 2806 geniv z yakih 2755 koduyut bilki vmist GC stanovit 54 Osoblivostyami genomu A borkumensis ye silna sproshenist nechislennist mobilnih genetichnih elementiv i geniv sho vidpovidayut za produkciyu energiyi prote velike chislo geniv sho vidpovidayut za degradaciyu vuglevodniv utvorennya detergentiv sho polegshuyut emulguvannya vuglevodniv v morskij vodi utvorennya bioplivok na poverhni krapel nafti vse ce pov yazano zi specifichnim pristosuvannyam do biodegradaciyi vuglevodniv Pri rosti na piruvati i geksadekani vidmichayut zminu rivnya ekspresiyi 97 membrannih i citoplazmatichnih bilkiv sho imovirno vidnosyatsya do 46 operoniv Takozh dlya A borkumensis harakternij alternativnij shlyah biosintezu zhiriv ZnachennyaNaftofa plyama v zatoci San Francisko 2007 rik A borkumensis ye dominuyuchim mikroorganizmom naftovih zabrudnen u prisutnosti dostupnih dzherel fosforu i azotu zdijsnyuyuchi biodegradaciyu vuklevodniv Takim chinom cya bakteriya prijmaye vazhlive znachennya v bioochishenni naftovih zabrudnen morskih ekosistem Takozh predstavlyayut interes pozaklitinni A borkumensis sho mayut vlastivosti detergentiv i zdibni do emulgaciya nafti rujnuyuchi naftovi plyami Zaraz rozroblyayutsya genno inzhenerni pidhodi vikoristannya pozaklitinnih poligidroksialkonativ A borkumensis PosilannyaYakimov M M Golyshin P N Lang S Moore E R Abraham W R Lunsdorf H and Timmis K N 1998 Alcanivorax borkumensis gen nov sp nov a new hydrocarbon degrading and surfactant producing marine bacterium Int J Syst Bacteriol 48 339 348 PMID 9731272 Arhiv originalu za 4 lipnya 2008 Procitovano 24 sichnya 2009 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya http www ncbi nlm nih gov sites entrez Db genome amp Cmd ShowDetailView amp TermToSearch 19683 Arhiv originalu za 10 lyutogo 2009 Procitovano 24 sichnya 2009 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya http bib1lp1 rz tu bs de docportal servlets MCRFileNodeServlet DocPortal derivate 00003237 Sabirova diss pdf jsessionid 0000Ld7MQC9JW1rnqPz0pkvn0Ty hosts local nedostupne posilannya z lyutogo 2019 http www pubmedcentral nih gov articlerender fcgi artid 1482905 Arhiv originalu za 12 zhovtnya 2008 Procitovano 24 sichnya 2009 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya http www3 interscience wiley com journal 118898677 abstract nedostupne posilannya z travnya 2019 http www3 interscience wiley com journal 119879245 abstract nedostupne posilannya z travnya 2019 http www ncbi nlm nih gov pubmed 9714737 http www2 psu ac th PresidentOffice EduService journal 27 6 pdf 15 marine microorganisms pdf nedostupne posilannya z lyutogo 2019 Arhiv originalu za 4 bereznya 2016 Procitovano 24 sichnya 2009 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya Ce nezavershena stattya z bakteriologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi