Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

ATG16L1 англ Autophagy related 16 like 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

ATG16L1

ATG16L1

ATG16L1 (англ. Autophagy related 16 like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 68 265.

ATG16L1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ATG16L1, autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae), APG16L, ATG16A, ATG16L, IBD10, WDR30, autophagy related 16 like 1
Зовнішні ІД OMIM: 610767 MGI: 1924290 HomoloGene: 41786 GeneCards: ATG16L1
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Крона, inflammatory bowel disease 10
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55054
77040
Ensembl
ENSG00000281089
ENSG00000085978
ENSMUSG00000026289
UniProt
Q676U5
Q8C0J2
RefSeq (мРНК)
NM_001205391
NM_001205392
NM_029846
RefSeq (білок)
NP_001192320
NP_001192321
NP_084122
Локус (UCSC) Хр. 2: 233.21 – 233.3 Mb Хр. 1: 87.68 – 87.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSSGLRAADFPRWKRHISEQLRRRDRLQRQAFEEIILQYNKLLEKSDLHS
VLAQKLQAEKHDVPNRHEISPGHDGTWNDNQLQEMAQLRIKHQEELTELH
KKRGELAQLVIDLNNQMQRKDREMQMNEAKIAECLQTISDLETECLDLRT
KLCDLERANQTLKDEYDALQITFTALEGKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQ
EANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVIVDETSDH
TEETSPVRAISRAATKRLSQPAGGLLDSITNIFGRRSVSSFPVPQDNVDT
HPGSGKEVRVPATALCVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWE
VFGEKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRL
RHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCIKTVFAGS
SCNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREMELLGKITALDLNPER
TELLSCSRDDLLKVIDLRTNAIKQTFSAPGFKCGSDWTRVVFSPDGSYVA
AGSAEGSLYIWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVSVDKGCK
AVLWAQY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ravikumar B., Moreau K., Jahreiss L., Puri C., Rubinsztein D.C. (2010). Plasma membrane contributes to the formation of pre-autophagosomal structures. Nat. Cell Biol. 12: 747—757. PMID 20639872 DOI:10.1038/ncb2078
  • Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115
  • Gammoh N., Florey O., Overholtzer M., Jiang X. (2013). Interaction between FIP200 and ATG16L1 distinguishes ULK1 complex-dependent and -independent autophagy. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 144—149. PMID 23262492 DOI:10.1038/nsmb.2475
  • Otomo C., Metlagel Z., Takaesu G., Otomo T. (2013). Structure of the human ATG12-ATG5 conjugate required for LC3 lipidation in autophagy. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 59—66. PMID 23202584 DOI:10.1038/nsmb.2431
  • Metlagel Z., Otomo C., Takaesu G., Otomo T. (2013). Structural basis of ATG3 recognition by the autophagic ubiquitin-like protein ATG12. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 18844—18849. PMID 24191030 DOI:10.1073/pnas.1314755110

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ATG16L1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

ATG16L1 angl Autophagy related 16 like 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 607 aminokislot a molekulyarna masa 68 265 ATG16L1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4GDK 4GDL 4NAW 4TQ0 5D7GIdentifikatoriSimvoliATG16L1 autophagy related 16 like 1 S cerevisiae APG16L ATG16A ATG16L IBD10 WDR30 autophagy related 16 like 1Zovnishni ID OMIM 610767 MGI 1924290 HomoloGene 41786 GeneCards ATG16L1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaHvoroba Krona inflammatory bowel disease 10 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya ubiquitin like protein transferase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding GTPase bindingKlitinna komponenta citoplazma autophagosome GO 0035085 Aksonema gialoplazma phagophore assembly site membrane autophagosome membrane membranaBiologichnij proces protein transport avtofagiya negative stranded viral RNA replication protein homooligomerization macroautophagy autophagosome assembly protein localization to phagophore assembly site protein lipidation involved in autophagosome assembly xenophagy positive regulation of autophagyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez55054 77040Ensembl ENSG00000281089 ENSG00000085978 ENSMUSG00000026289UniProt Q676U5 Q8C0J2RefSeq mRNK NM 001190266 NM 001190267 NM 017974 NM 030803 NM 198890NM 001363742NM 001205391 NM 001205392 NM 029846RefSeq bilok NP 001177195 NP 001177196 NP 060444 NP 110430 NP 942593NP 001350671 NP 060444 3NP 001192320 NP 001192321 NP 084122Lokus UCSC Hr 2 233 21 233 3 MbHr 1 87 68 87 72 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSSGLRAADFPRWKRHISEQLRRRDRLQRQAFEEIILQYNKLLEKSDLHS VLAQKLQAEKHDVPNRHEISPGHDGTWNDNQLQEMAQLRIKHQEELTELH KKRGELAQLVIDLNNQMQRKDREMQMNEAKIAECLQTISDLETECLDLRT KLCDLERANQTLKDEYDALQITFTALEGKLRKTTEENQELVTRWMAEKAQ EANRLNAENEKDSRRRQARLQKELAEAAKEPLPVEQDDDIEVIVDETSDH TEETSPVRAISRAATKRLSQPAGGLLDSITNIFGRRSVSSFPVPQDNVDT HPGSGKEVRVPATALCVFDAHDGEVNAVQFSPGSRLLATGGMDRRVKLWE VFGEKCEFKGSLSGSNAGITSIEFDSAGSYLLAASNDFASRIWTVDDYRL RHTLTGHSGKVLSAKFLLDNARIVSGSHDRTLKLWDLRSKVCIKTVFAGS SCNDIVCTEQCVMSGHFDKKIRFWDIRSESIVREMELLGKITALDLNPER TELLSCSRDDLLKVIDLRTNAIKQTFSAPGFKCGSDWTRVVFSPDGSYVA AGSAEGSLYIWSVLTGKVEKVLSKQHSSSINAVAWSPSGSHVVSVDKGCK AVLWAQY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport transport bilkiv avtofagiya polimorfizm alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi membrani LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Ravikumar B Moreau K Jahreiss L Puri C Rubinsztein D C 2010 Plasma membrane contributes to the formation of pre autophagosomal structures Nat Cell Biol 12 747 757 PMID 20639872 DOI 10 1038 ncb2078 Nottingham R M Ganley I G Barr F A Lambright D G Pfeffer S R 2011 RUTBC1 protein a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins J Biol Chem 286 33213 33222 PMID 21808068 DOI 10 1074 jbc M111 261115 Gammoh N Florey O Overholtzer M Jiang X 2013 Interaction between FIP200 and ATG16L1 distinguishes ULK1 complex dependent and independent autophagy Nat Struct Mol Biol 20 144 149 PMID 23262492 DOI 10 1038 nsmb 2475 Otomo C Metlagel Z Takaesu G Otomo T 2013 Structure of the human ATG12 ATG5 conjugate required for LC3 lipidation in autophagy Nat Struct Mol Biol 20 59 66 PMID 23202584 DOI 10 1038 nsmb 2431 Metlagel Z Otomo C Takaesu G Otomo T 2013 Structural basis of ATG3 recognition by the autophagic ubiquitin like protein ATG12 Proc Natl Acad Sci U S A 110 18844 18849 PMID 24191030 DOI 10 1073 pnas 1314755110PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ATG16L1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 2 veresnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 13 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij

Дата публікації:
Топ