Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Протеом сукупність всіх білків клітини тканини організму або популяції організмів Протеом досліджує спеціальна наука про

Протеом

Протеом

Протеом — сукупність всіх білків клітини, тканини, організму або популяції організмів. Протеом досліджує спеціальна наука протеоміка, підрозділ молекулярної біології.

Термінологія

Термін «протеом» був запропонований в 1994 році австралійським дослідником Марком Вілкінсом на конференції в Італії, пізніше ця робота стала частиною його дисертації на здобуття ступеня PhD. Термін «протеом» складається з частин слів «протеїни» (білки) та суфіксу «-ом».

З того часу термін «протеом» був застосований для кількох різних типів біологічних систем. Клітинний протеом — набір білків, знайдених в специфічному типі клітин за специфічними умовами, наприклад під дією певного гормону. «Протеом організму» означає набір білків протеомів всіх клітин організму. Термін також використовується для опису набору білків на рівні менше клітини, наприклад всі білки у вірусі можуть бути названі вірусним протеомом.

Загальна характеристика

Протеом більше, ніж геном, особливо у еукаріотів, в тому сенсі, що білків більше, ніж генів. Це пов'язано з альтернативним сплайсингом генів і посттрансляційною модифікацією білків, наприклад, глікозилюванням або фосфорилюванням.

Окрім того протеом має як мінімум два рівні складності, яких не має геном. Тоді як геном визначається нуклеотидною послідовністю, протеом не може бути обмежений сумою послідовностей всіх наявних білків. Повна характеризація протеому вимагає характеризації структури білків протеому та функціональної взаємодії між білками.

Методи дослідження

Дослідження протеому вивчає наука протеоміка, шляхом застосування різноманітних методів, як мас-спектрометрія, гелевий електрофорез, очищення, секвенування білків, створення рекомбінантних та мічених білків. Отримання великих масивів даних привело до розробки численних обчислювальних методів їх аналізу. Багато досліджень проводяться в міжнародній колаборації, для координації таких зусиль в 2001 році була створена міжнародна (англ. Human Proteome Organization — HUPO).

Двовимірний гелевий електрофорез

Методом двовимірного гелевого електрофорезу (). У першому вимірювання білки розділялися за ізоелектричним фокусуванням, а у другому — за розміром.

Мас-спектрометрія

Важливим методом протеоміки є мас-спектрометрія. «Зняття відбитків пільців» білків за допомогою мас-спектрометрії швидко підвищило ефективність досліджень протеому. Застосовують різноманітні типи мас-спектрометрії: SELDI-TOF-MS, MALDI-TOF-MS, LC-MS (Рідинна хроматографія — мас-спектрометрія).

Див. також

Література

Книги

  • Srivastava Sanjeeva (2023). From Proteins to Proteomics. Boca Raton: CRC Press. ISBN .
  • Donev Rossen; Karabencheva-Christova Tatyana (2021). Proteomics and systems biology. Advances in protein chemistry and structural biology (1st edition). Academic Press. ISBN .
  • Kuang, Tingyun; Li, Ling; Wang, Xuchu; Dai, Shaojun; Qin, Xiaochun (2020). Plant Protein and Proteome Altlas--Integrated Omics Analyses of Plants under Abiotic Stresses. MDPI AG. ISBN 
  • Comai Lucio; Katz Jonathan E.; Mallick Parag (2017). Proteomics: methods and protocols. Methods in molecular biology. New York, NY: Humana Press. ISBN .
  • Keerthikumar, Shivakumar; Mathivanan, Suresh (2017). Proteome bioinformatics. New York, N.Y. ISBN 

Журнали

Посилання

  1. Wilkins, Marc (Dec. 2009). Proteomics data mining. Expert review of proteomics. England. 6 (6): 599—603. doi:10.1586/epr.09.81. PMID 19929606.


image Це незавершена стаття з молекулярної біології.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Proteom sukupnist vsih bilkiv klitini tkanini organizmu abo populyaciyi organizmiv Proteom doslidzhuye specialna nauka proteomika pidrozdil molekulyarnoyi biologiyi TerminologiyaTermin proteom buv zaproponovanij v 1994 roci avstralijskim doslidnikom Markom Vilkinsom na konferenciyi v Italiyi piznishe cya robota stala chastinoyu jogo disertaciyi na zdobuttya stupenya PhD Termin proteom skladayetsya z chastin sliv proteyini bilki ta sufiksu om Z togo chasu termin proteom buv zastosovanij dlya kilkoh riznih tipiv biologichnih sistem Klitinnij proteom nabir bilkiv znajdenih v specifichnomu tipi klitin za specifichnimi umovami napriklad pid diyeyu pevnogo gormonu Proteom organizmu oznachaye nabir bilkiv proteomiv vsih klitin organizmu Termin takozh vikoristovuyetsya dlya opisu naboru bilkiv na rivni menshe klitini napriklad vsi bilki u virusi mozhut buti nazvani virusnim proteomom Zagalna harakteristikaProteom bilshe nizh genom osoblivo u eukariotiv v tomu sensi sho bilkiv bilshe nizh geniv Ce pov yazano z alternativnim splajsingom geniv i posttranslyacijnoyu modifikaciyeyu bilkiv napriklad glikozilyuvannyam abo fosforilyuvannyam Okrim togo proteom maye yak minimum dva rivni skladnosti yakih ne maye genom Todi yak genom viznachayetsya nukleotidnoyu poslidovnistyu proteom ne mozhe buti obmezhenij sumoyu poslidovnostej vsih nayavnih bilkiv Povna harakterizaciya proteomu vimagaye harakterizaciyi strukturi bilkiv proteomu ta funkcionalnoyi vzayemodiyi mizh bilkami Metodi doslidzhennyaDoslidzhennya proteomu vivchaye nauka proteomika shlyahom zastosuvannya riznomanitnih metodiv yak mas spektrometriya gelevij elektroforez ochishennya sekvenuvannya bilkiv stvorennya rekombinantnih ta michenih bilkiv Otrimannya velikih masiviv danih privelo do rozrobki chislennih obchislyuvalnih metodiv yih analizu Bagato doslidzhen provodyatsya v mizhnarodnij kolaboraciyi dlya koordinaciyi takih zusil v 2001 roci bula stvorena mizhnarodna angl Human Proteome Organization HUPO Dvovimirnij gelevij elektroforez Metodom dvovimirnogo gelevogo elektroforezu U pershomu vimiryuvannya bilki rozdilyalisya za izoelektrichnim fokusuvannyam a u drugomu za rozmirom Mas spektrometriya Vazhlivim metodom proteomiki ye mas spektrometriya Znyattya vidbitkiv pilciv bilkiv za dopomogoyu mas spektrometriyi shvidko pidvishilo efektivnist doslidzhen proteomu Zastosovuyut riznomanitni tipi mas spektrometriyi SELDI TOF MS MALDI TOF MS LC MS Ridinna hromatografiya mas spektrometriya Div takozhProteomika Multiomika Folding bilkiv Genom Metabolom Molekulyarna biologiya Molekulyarna nejronauka Biohimiya NejrohimiyaLiteraturaKnigi Srivastava Sanjeeva 2023 From Proteins to Proteomics Boca Raton CRC Press ISBN 978 1 003 09864 5 Donev Rossen Karabencheva Christova Tatyana 2021 Proteomics and systems biology Advances in protein chemistry and structural biology 1st edition Academic Press ISBN 978 0 323 85319 4 Kuang Tingyun Li Ling Wang Xuchu Dai Shaojun Qin Xiaochun 2020 Plant Protein and Proteome Altlas Integrated Omics Analyses of Plants under Abiotic Stresses MDPI AG ISBN 978 3 03921 960 5 Comai Lucio Katz Jonathan E Mallick Parag 2017 Proteomics methods and protocols Methods in molecular biology New York NY Humana Press ISBN 978 1 4939 6745 2 Keerthikumar Shivakumar Mathivanan Suresh 2017 Proteome bioinformatics New York N Y ISBN 978 1 4939 6740 7 Zhurnali Journal of Proteome Research American Chemical Society Proteome Science BioMed Central PosilannyaWilkins Marc Dec 2009 Proteomics data mining Expert review of proteomics England 6 6 599 603 doi 10 1586 epr 09 81 PMID 19929606 Ce nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ