GRN (англ. Granulin precursor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 63 544.
GRN | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GRN, CLN11, GEP, GP88, PCDGF, PEPI, PGranulin, granulin precursor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 138945 MGI: 95832 HomoloGene: 1577 GeneCards: GRN | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
GRN-related frontotemporal lobar degeneration with Tdp43 inclusions, neuronal ceroid lipofuscinosis 11 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 44.35 – 44.35 Mb | Хр. 11: 102.32 – 102.33 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MWTLVSWVAL | TAGLVAGTRC | PDGQFCPVAC | CLDPGGASYS | CCRPLLDKWP | ||||
TTLSRHLGGP | CQVDAHCSAG | HSCIFTVSGT | SSCCPFPEAV | ACGDGHHCCP | ||||
RGFHCSADGR | SCFQRSGNNS | VGAIQCPDSQ | FECPDFSTCC | VMVDGSWGCC | ||||
PMPQASCCED | RVHCCPHGAF | CDLVHTRCIT | PTGTHPLAKK | LPAQRTNRAV | ||||
ALSSSVMCPD | ARSRCPDGST | CCELPSGKYG | CCPMPNATCC | SDHLHCCPQD | ||||
TVCDLIQSKC | LSKENATTDL | LTKLPAHTVG | DVKCDMEVSC | PDGYTCCRLQ | ||||
SGAWGCCPFT | QAVCCEDHIH | CCPAGFTCDT | QKGTCEQGPH | QVPWMEKAPA | ||||
HLSLPDPQAL | KRDVPCDNVS | SCPSSDTCCQ | LTSGEWGCCP | IPEAVCCSDH | ||||
QHCCPQGYTC | VAEGQCQRGS | EIVAGLEKMP | ARRASLSHPR | DIGCDQHTSC | ||||
PVGQTCCPSL | GGSWACCQLP | HAVCCEDRQH | CCPAGYTCNV | KARSCEKEVV | ||||
SAQPATFLAR | SPHVGVKDVE | CGEGHFCHDN | QTCCRDNRQG | WACCPYRQGV | ||||
CCADRRHCCP | AGFRCAARGT | KCLRREAPRW | DAPLRDPALR | QLL |
Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.
Література
- Bhandari V., Bateman A. (1992). Structure and chromosomal location of the human granulin gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 188: 57—63. PMID 1417868 DOI:10.1016/0006-291X(92)92349-3
- Bhandari V., Palfree R.G.E., Bateman A. (1992). Isolation and sequence of the granulin precursor cDNA from human bone marrow reveals tandem cysteine-rich granulin domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1715—1719. PMID 1542665 DOI:10.1073/pnas.89.5.1715
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bateman A., Belcourt D.R., Bennett H.P., Lazure C., Solomon S. (1990). Granulins, a novel class of peptide from leukocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 173: 1161—1168. PMID 2268320 DOI:10.1016/S0006-291X(05)80908-8
- Kardana A., Bagshawe K.D., Coles B., Read D., Taylor M. (1993). Characterisation of UGP and its relationship with beta-core fragment. Br. J. Cancer. 67: 686—692. PMID 8471426 DOI:10.1038/bjc.1993.127
- Songsrirote K., Li Z., Ashford D., Bateman A., Thomas-Oates J. (2010). Development and application of mass spectrometric methods for the analysis of progranulin N-glycosylation. J. Proteomics. 73: 1479—1490. PMID 20188224 DOI:10.1016/j.jprot.2010.02.013
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з GRN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GRN angl Granulin precursor bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 17 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 593 aminokislot a molekulyarna masa 63 544 GRNNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1G26 2JYE 2JYT 2JYU 2JYVIdentifikatoriSimvoliGRN CLN11 GEP GP88 PCDGF PEPI PGranulin granulin precursorZovnishni ID OMIM 138945 MGI 95832 HomoloGene 1577 GeneCards GRNPov yazani genetichni zahvoryuvannyaGRN related frontotemporal lobar degeneration with Tdp43 inclusions neuronal ceroid lipofuscinosis 11 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya cytokine activity growth factor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding chaperone bindingKlitinna komponenta ekzosoma extracellular region mizhklitinnij prostir lizosoma endosoma endoplazmatichnij retikulum azurophil granule lumen lysosomal membrane late endosome kompleks Goldzhi trans Golgi network klitinna membrana membranaBiologichnij proces GO 0072468 signalna transdukciya neutrophil degranulation regulation of signaling receptor activity positive regulation of cell migration astrocyte activation involved in immune response microglial cell activation involved in immune response lysosome organization lysosomal transport lysosomal lumen acidification positive regulation of endothelial cell migration GO 1904089 negative regulation of neuron apoptotic process positive regulation of neuron apoptotic process positive regulation of angiogenesis positive regulation of axon regeneration positive regulation of epithelial cell proliferation protein stabilization negative regulation of respiratory burst involved in inflammatory response positive regulation of inflammatory response to wounding positive regulation of defense response to bacterium negative regulation of neutrophil activation positive regulation of protein folding negative regulation of microglial cell activation positive regulation of aspartic type peptidase activity positive regulation of lysosome organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2896 14824Ensembl ENSG00000030582 ENSMUSG00000034708UniProt P28799 P28798RefSeq mRNK NM 001012479 NM 002087NM 008175RefSeq bilok NP 002078NP 032201Lokus UCSC Hr 17 44 35 44 35 MbHr 11 102 32 102 33 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MWTLVSWVALTAGLVAGTRCPDGQFCPVACCLDPGGASYSCCRPLLDKWP TTLSRHLGGPCQVDAHCSAGHSCIFTVSGTSSCCPFPEAVACGDGHHCCP RGFHCSADGRSCFQRSGNNSVGAIQCPDSQFECPDFSTCCVMVDGSWGCC PMPQASCCEDRVHCCPHGAFCDLVHTRCITPTGTHPLAKKLPAQRTNRAV ALSSSVMCPDARSRCPDGSTCCELPSGKYGCCPMPNATCCSDHLHCCPQD TVCDLIQSKCLSKENATTDLLTKLPAHTVGDVKCDMEVSCPDGYTCCRLQ SGAWGCCPFTQAVCCEDHIHCCPAGFTCDTQKGTCEQGPHQVPWMEKAPA HLSLPDPQALKRDVPCDNVSSCPSSDTCCQLTSGEWGCCPIPEAVCCSDH QHCCPQGYTCVAEGQCQRGSEIVAGLEKMPARRASLSHPRDIGCDQHTSC PVGQTCCPSLGGSWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARSCEKEVV SAQPATFLARSPHVGVKDVECGEGHFCHDNQTCCRDNRQGWACCPYRQGV CCADRRHCCPAGFRCAARGTKCLRREAPRWDAPLRDPALRQLL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do citokiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Sekretovanij nazovni LiteraturaBhandari V Bateman A 1992 Structure and chromosomal location of the human granulin gene Biochem Biophys Res Commun 188 57 63 PMID 1417868 DOI 10 1016 0006 291X 92 92349 3 Bhandari V Palfree R G E Bateman A 1992 Isolation and sequence of the granulin precursor cDNA from human bone marrow reveals tandem cysteine rich granulin domains Proc Natl Acad Sci U S A 89 1715 1719 PMID 1542665 DOI 10 1073 pnas 89 5 1715 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bateman A Belcourt D R Bennett H P Lazure C Solomon S 1990 Granulins a novel class of peptide from leukocytes Biochem Biophys Res Commun 173 1161 1168 PMID 2268320 DOI 10 1016 S0006 291X 05 80908 8 Kardana A Bagshawe K D Coles B Read D Taylor M 1993 Characterisation of UGP and its relationship with beta core fragment Br J Cancer 67 686 692 PMID 8471426 DOI 10 1038 bjc 1993 127 Songsrirote K Li Z Ashford D Bateman A Thomas Oates J 2010 Development and application of mass spectrometric methods for the analysis of progranulin N glycosylation J Proteomics 73 1479 1490 PMID 20188224 DOI 10 1016 j jprot 2010 02 013PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z GRN pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 zhovtnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 17 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi