Цитидиндезаміназа (англ. Cytidine deaminase) — білок, який кодується геном CDA, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 146 амінокислот, а молекулярна маса — 16 185.
CDA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CDA, CDD, cytidine deaminase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 123920 MGI: 1919519 HomoloGene: 1352 GeneCards: CDA | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 20.59 – 20.62 Mb | Хр. 4: 138.07 – 138.1 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAQKRPACTL | KPECVQQLLV | CSQEAKKSAY | CPYSHFPVGA | ALLTQEGRIF | ||||
KGCNIENACY | PLGICAERTA | IQKAVSEGYK | DFRAIAIASD | MQDDFISPCG | ||||
ACRQVMREFG | TNWPVYMTKP | DGTYIVMTVQ | ELLPSSFGPE | DLQKTQ |
Кодований геном білок за функцією належить до підгрупи гідролаз — дезаміназ. Цей фермент каталізує реакцію відщеплення аміногрупи від нуклеотиду цитидину. Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку.
У геномі реброплавів наявні 2 ізоформи цитидиндезамінази: CDA1 та CDA2.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kuhn K., Bertling W.M., Emmrich F. (1993). Cloning of a functional cDNA for human cytidine deaminase (CDD) and its use as a marker of monocyte/macrophage differentiation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 190: 1—7. PMID 8422236 DOI:10.1006/bbrc.1993.1001
- Chung S.J., Fromme J.C., Verdine G.L. (2005). Structure of human cytidine deaminase bound to a potent inhibitor. J. Med. Chem. 48: 658—660. PMID 15689149 DOI:10.1021/jm0496279
- Laliberte J., Momparler R.L. (1994). Human cytidine deaminase: purification of enzyme, cloning, and expression of its complementary DNA. Cancer Res. 54: 5401—5407. PMID 7923172
- Gran C., Boyum A., Johansen R.F., Lovhaug D., Seeberg E.C. (1998). Growth inhibition of granulocyte-macrophage colony forming cells by human cytidine deaminase requires the catalytic function of the protein. Blood. 91: 4127—4135. PMID 9596658
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1712 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- UniProt, P32320 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- Moroz, Leonid L.; Kocot, Kevin M.; Citarella, Mathew R.; Dosung, Sohn; Norekian, Tigran P.; Povolotskaya, Inna S.; Grigorenko, Anastasia P.; Dailey, Christopher; Berezikov, Eugene; Buckley, Katherine M.; Ptitsyn, Andrey; Reshetov, Denis; Mukherjee, Krishanu; Moroz, Tatiana P.; Bobkova, Yelena; Yu, Fahong; Kapitonov, Vladimir V.; Jurka, Jerzy; Bobkov, Yuri V.; Swore, Joshua J.; Girardo, David O.; Fodor, Alexander; Gusev, Fedor; Sanford, Rachel; Bruders, Rebecca; Kittler, Ellen; Mills, Claudia E.; Rast, Jonathan P.; Derelle, Romain; Solovyev, Victor V.; Kondrashov, Fyodor A.; Swalla, Billie J.; Sweedler, Jonathan V.; Rogaev, Evgeny I.; Halanych, Kenneth M.; Kohn, Andrea B. (2014). The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems. Nature. 510 (7503): 109—114. doi:10.1038/nature13400. ISSN 0028-0836.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Ne plutati z citidindezaminazami rodinoyu fermentiv yaki modifikuyut DNK ta RNK Citidindezaminaza angl Cytidine deaminase bilok yakij koduyetsya genom CDA roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 146 aminokislot a molekulyarna masa 16 185 CDANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1MQ0IdentifikatoriSimvoliCDA CDD cytidine deaminaseZovnishni ID OMIM 123920 MGI 1919519 HomoloGene 1352 GeneCards CDAOntologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity nucleoside binding cytidine deaminase activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist identical protein binding hydrolase activityKlitinna komponenta gialoplazma extracellular region secretory granule lumen tertiary granule lumen ficolin 1 rich granule lumenBiologichnij proces cytosine metabolic process pyrimidine nucleoside salvage cell surface receptor signaling pathway cytidine deamination negative regulation of cell growth pyrimidine containing compound salvage negative regulation of nucleotide metabolic process protein homotetramerization neutrophil degranulationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez978 72269Ensembl ENSG00000158825 ENSMUSG00000028755UniProt P32320 P56389RefSeq mRNK NM 001785NM 028176RefSeq bilok NP 001776NP 082452Lokus UCSC Hr 1 20 59 20 62 MbHr 4 138 07 138 1 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAQKRPACTLKPECVQQLLVCSQEAKKSAYCPYSHFPVGAALLTQEGRIF KGCNIENACYPLGICAERTAIQKAVSEGYKDFRAIAIASDMQDDFISPCG ACRQVMREFGTNWPVYMTKPDGTYIVMTVQELLPSSFGPEDLQKTQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do pidgrupi gidrolaz dezaminaz Cej ferment katalizuye reakciyu vidsheplennya aminogrupi vid nukleotidu citidinu Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom cinku U genomi rebroplaviv nayavni 2 izoformi citidindezaminazi CDA1 ta CDA2 LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kuhn K Bertling W M Emmrich F 1993 Cloning of a functional cDNA for human cytidine deaminase CDD and its use as a marker of monocyte macrophage differentiation Biochem Biophys Res Commun 190 1 7 PMID 8422236 DOI 10 1006 bbrc 1993 1001 Chung S J Fromme J C Verdine G L 2005 Structure of human cytidine deaminase bound to a potent inhibitor J Med Chem 48 658 660 PMID 15689149 DOI 10 1021 jm0496279 Laliberte J Momparler R L 1994 Human cytidine deaminase purification of enzyme cloning and expression of its complementary DNA Cancer Res 54 5401 5407 PMID 7923172 Gran C Boyum A Johansen R F Lovhaug D Seeberg E C 1998 Growth inhibition of granulocyte macrophage colony forming cells by human cytidine deaminase requires the catalytic function of the protein Blood 91 4127 4135 PMID 9596658PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1712 angl Procitovano 25 serpnya 2017 UniProt P32320 angl Procitovano 25 serpnya 2017 Moroz Leonid L Kocot Kevin M Citarella Mathew R Dosung Sohn Norekian Tigran P Povolotskaya Inna S Grigorenko Anastasia P Dailey Christopher Berezikov Eugene Buckley Katherine M Ptitsyn Andrey Reshetov Denis Mukherjee Krishanu Moroz Tatiana P Bobkova Yelena Yu Fahong Kapitonov Vladimir V Jurka Jerzy Bobkov Yuri V Swore Joshua J Girardo David O Fodor Alexander Gusev Fedor Sanford Rachel Bruders Rebecca Kittler Ellen Mills Claudia E Rast Jonathan P Derelle Romain Solovyev Victor V Kondrashov Fyodor A Swalla Billie J Sweedler Jonathan V Rogaev Evgeny I Halanych Kenneth M Kohn Andrea B 2014 The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems Nature 510 7503 109 114 doi 10 1038 nature13400 ISSN 0028 0836 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi