Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TDG англ Thymine DNA glycosylase білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 12 ї хро

Тимін-ДНК-глікозилаза

Тимін-ДНК-глікозилаза

TDG (англ. Thymine DNA glycosylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 46 053.

TDG
image
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TDG, hThymine-DNA glycosylase, thymine DNA glycosylase
Зовнішні ІД OMIM: 601423 MGI: 3645587 HomoloGene: 2415 GeneCards: TDG
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6996
545124
Ensembl
ENSG00000139372
н/д
UniProt
Q13569
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_001008411
NM_003211
NM_001363612
XM_006521630
RefSeq (білок)
NP_003202
NP_001350541
н/д
Локус (UCSC) Хр. 12: 103.97 – 103.99 Mb н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MEAENAGSYSLQQAQAFYTFPFQQLMAEAPNMAVVNEQQMPEEVPAPAPA
QEPVQEAPKGRKRKPRTTEPKQPVEPKKPVESKKSGKSAKSKEKQEKITD
TFKVKRKVDRFNGVSEAELLTKTLPDILTFNLDIVIIGINPGLMAAYKGH
HYPGPGNHFWKCLFMSGLSEVQLNHMDDHTLPGKYGIGFTNMVERTTPGS
KDLSSKEFREGGRILVQKLQKYQPRIAVFNGKCIYEIFSKEVFGVKVKNL
EFGLQPHKIPDTETLCYVMPSSSARCAQFPRAQDKVHYYIKLKDLRDQLK
GIERNMDVQEVQYTFDLQLAQEDAKKMAVKEEKYDPGYEAAYGGAYGENP
CSSEPCGFSSNGLIESVELRGESAFSGIPNGQWMTQSFTDQIPSFSNHCG
TQEQEEESHA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, . Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Neddermann P., Jiricny J. (1994). Efficient removal of uracil from G.U mispairs by the mismatch-specific thymine DNA glycosylase from HeLa cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1642—1646. PMID 8127859 DOI:10.1073/pnas.91.5.1642
  • Hardeland U., Steinacher R., Jiricny J., Schaer P. (2002). Modification of the human thymine-DNA glycosylase by ubiquitin-like proteins facilitates enzymatic turnover. EMBO J. 21: 1456—1464. PMID 11889051 DOI:10.1093/emboj/21.6.1456
  • Maiti A., Drohat A.C. (2011). Thymine DNA glycosylase can rapidly excise 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine: potential implications for active demethylation of CpG sites. J. Biol. Chem. 286: 35334—35338. PMID 21862836 DOI:10.1074/jbc.C111.284620
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Maiti A., Morgan M.T., Pozharski E., Drohat A.C. (2008). Crystal structure of human thymine DNA glycosylase bound to DNA elucidates sequence-specific mismatch recognition. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 8890—8895. PMID 18587051 DOI:10.1073/pnas.0711061105

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11700 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TDG angl Thymine DNA glycosylase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 410 aminokislot a molekulyarna masa 46 053 TDGNayavni strukturiPDBPoshuk dlya lyudej PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1WYW 2D07 2RBA 3UFJ 3UO7 3UOB 4FNC 4JGC 4XEG 4Z3A 4Z47 4Z7B 4Z7Z 5CYSIdentifikatoriSimvoliTDG hThymine DNA glycosylase thymine DNA glycosylaseZovnishni ID OMIM 601423 MGI 3645587 HomoloGene 2415 GeneCards TDGOntologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity GO 0001104 transcription coregulator activity damaged DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding double stranded DNA binding hydrolase activity protein kinase C binding transcription factor binding DNA N glycosylase activity mismatched DNA binding protein domain specific binding DNA binding magnesium ion binding uracil DNA N glycosylase activity ATP binding pyrimidine specific mismatch base pair DNA N glycosylase activity sodium ion binding chloride ion binding SUMO binding protein self association G U mismatch specific uracil DNA glycosylase activityKlitinna komponenta PML body klitinna membrana nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated embryo development negative regulation of chromatin binding oxidative DNA demethylation GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of protein binding transcription DNA templated cellular response to DNA damage stimulus depyrimidination DNA demethylation base excision repair GO 0100026 Reparaciya DNK DNA mismatch repair Epigenetichne uspadkuvannya base excision repair AP site formation regulation of DNA N glycosylase activity GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization regulation of embryonic developmentDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6996 545124Ensembl ENSG00000139372 n dUniProt Q13569 n dRefSeq mRNK NM 001008411 NM 003211 NM 001363612XM 006521630RefSeq bilok NP 003202 NP 001350541n dLokus UCSC Hr 12 103 97 103 99 Mbn dPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEAENAGSYSLQQAQAFYTFPFQQLMAEAPNMAVVNEQQMPEEVPAPAPA QEPVQEAPKGRKRKPRTTEPKQPVEPKKPVESKKSGKSAKSKEKQEKITD TFKVKRKVDRFNGVSEAELLTKTLPDILTFNLDIVIIGINPGLMAAYKGH HYPGPGNHFWKCLFMSGLSEVQLNHMDDHTLPGKYGIGFTNMVERTTPGS KDLSSKEFREGGRILVQKLQKYQPRIAVFNGKCIYEIFSKEVFGVKVKNL EFGLQPHKIPDTETLCYVMPSSSARCAQFPRAQDKVHYYIKLKDLRDQLK GIERNMDVQEVQYTFDLQLAQEDAKKMAVKEEKYDPGYEAAYGGAYGENP CSSEPCGFSSNGLIESVELRGESAFSGIPNGQWMTQSFTDQIPSFSNHCG TQEQEEESHA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi poshkodzhennya DNK reparaciya DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Neddermann P Jiricny J 1994 Efficient removal of uracil from G U mispairs by the mismatch specific thymine DNA glycosylase from HeLa cells Proc Natl Acad Sci U S A 91 1642 1646 PMID 8127859 DOI 10 1073 pnas 91 5 1642 Hardeland U Steinacher R Jiricny J Schaer P 2002 Modification of the human thymine DNA glycosylase by ubiquitin like proteins facilitates enzymatic turnover EMBO J 21 1456 1464 PMID 11889051 DOI 10 1093 emboj 21 6 1456 Maiti A Drohat A C 2011 Thymine DNA glycosylase can rapidly excise 5 formylcytosine and 5 carboxylcytosine potential implications for active demethylation of CpG sites J Biol Chem 286 35334 35338 PMID 21862836 DOI 10 1074 jbc C111 284620 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Maiti A Morgan M T Pozharski E Drohat A C 2008 Crystal structure of human thymine DNA glycosylase bound to DNA elucidates sequence specific mismatch recognition Proc Natl Acad Sci U S A 105 8890 8895 PMID 18587051 DOI 10 1073 pnas 0711061105PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11700 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 6 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ