Оклюдин

Оклюдин (англ. Occludin) – , який кодується геном OCLN, розташованим у людини на довгому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 144. білок з молекулярною масою 65 кДа, що розташований в щільних контактах та є їх компонентом. В людини оклюдин кодується геном OCLN та являє собою 522-амінокислотний поліпептид.

Оклюдин
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WPA, 1XAW, 3G7C
Ідентифікатори
Символи	OCLN, BLCPMG, PPP1R115, occludin, PTORCH1
Зовнішні ІД	OMIM: 602876 MGI: 106183 HomoloGene: 1905 GeneCards: OCLN
Пов'язані генетичні захворювання
pseudo-TORCH syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • клітинна мембрана • endocytic vesicle • apicolateral plasma membrane • apical plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • lateral plasma membrane • міжклітинні контакти Біологічний процес • cell-cell junction organization • bicellular tight junction assembly • response to interleukin-18 • cellular response to tumor necrosis factor • regulation of bicellular tight junction assembly • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100506658	18260
Ensembl	ENSG00000197822 ENSG00000273814	ENSMUSG00000021638
UniProt	Q16625	Q61146
RefSeq (мРНК)	NM_002538 NM_001205254 NM_001205255	NM_008756 NM_001360536 NM_001360537 NM_001360538 NM_001360539
RefSeq (білок)	NP_001192183 NP_001192184 NP_002529	NP_032782 NP_001347465 NP_001347466 NP_001347467 NP_001347468
Локус (UCSC)	Хр. 5: 69.49 – 69.56 Mb	Хр. 13: 100.63 – 100.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSRPLESPP		PYRPDEFKPN		HYAPSNDIYG		GEMHVRPMLS		QPAYSFYPED
EILHFYKWTS		PPGVIRILSM		LIIVMCIAIF		ACVASTLAWD		RGYGTSLLGG
SVGYPYGGSG		FGSYGSGYGY		GYGYGYGYGG		YTDPRAAKGF		MLAMAAFCFI
AALVIFVTSV		IRSEMSRTRR		YYLSVIIVSA		ILGIMVFIAT		IVYIMGVNPT
AQSSGSLYGS		QIYALCNQFY		TPAATGLYVD		QYLYHYCVVD		PQEAIAIVLG
FMIIVAFALI		IFFAVKTRRK		MDRYDKSNIL		WDKEHIYDEQ		PPNVEEWVKN
VSAGTQDVPS		PPSDYVERVD		SPMAYSSNGK		VNDKRFYPES		SYKSTPVPEV
VQELPLTSPV		DDFRQPRYSS		GGNFETPSKR		APAKGRAGRS		KRTEQDHYET
DYTTGGESCD		ELEEDWIREY		PPITSDQQRQ		LYKRNFDTGL		QEYKSLQSEL
DEINKELSRL		DKELDDYREE		SEEYMAAADE		YNRLKQVKGS		ADYKSKKNHC
KQLKSKLSHI		KKMVGDYDRQ		KT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані щільних контактів.

Ген OCLN

Ген OCLN розташований на довгому (q) плечі хромосоми 5 у позиції q13.1. Він починається з 69 492 292 пари основ та простягається до 69 558 104 пари основ, маючи довжину 65 813 пар основ. В результаті альтернативного сплайсингу експресуються дві ізоформи оклюдину.

Структура

В структурі оклюдину виділяють 9 доменів, що розділені на дві групи. Перша група об'єднує 5 доменів, що розташовані внутрішньоклітинно та позаклітинно, а друга група об'єднує 4 трансмембранних домени. Ці 9 доменів є наступними:

• N-кінцевий домен (66 амінокислот);
• трансмембранний домен 1 (23 амінокислот);
• позаклітинна петля 1 (46 амінокислот);
• трансмембранний домен 2 (25 амінокислот);
• внутрішньоклітинна петля (10 амінокислот);
• трансмембранний домен 3 (25 амінокислот);
• позаклітинний домен 2 (48 амінокислот);
• трансмембранний домен 4 (22 амінокислот);
• C-кінцевий домен (257 амінокислот).

C-кінцевий домен необхідний для правильного утворення щільних контактів. Він також взаємодіє з декількома цитоплазматичними білками в з'єднувальному диску і сигнальними молекулами, відповідальними за виживання клітин, а його N-кінцевий домен бере участь в ущільнені щільних контактів. Позаклітинна петля оклюдину бере участь в регуляції парацелюлярної проникності, а позаклітинний домен 2 бере участь в локалізації щодо щільного контакту.

Функції

Оклюдин є важливим для функціювання щільних контактів. Він визначає щільність щільних контактів та відіграє важливу роль в забезпеченні бар'єрної функції.

Див. також

• Хромосома 5

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sallee J.L., Burridge K. (2009). Density-enhanced phosphatase 1 regulates phosphorylation of tight junction proteins and enhances barrier function of epithelial cells. J. Biol. Chem. 284: 14997—15006. PMID 19332538 DOI:10.1074/jbc.M901901200
• Van Itallie C.M., Anderson J.M. (1997). Occludin confers adhesiveness when expressed in fibroblasts. J. Cell Sci. 110: 1113—1121. PMID 9175707
• Lapierre L.A., Tuma P.L., Navarre J., Goldenring J.R., Anderson J.M. (1999). VAP-33 localizes to both an intracellular vesicle population and with occludin at the tight junction. J. Cell Sci. 112: 3723—3732. PMID 10523508

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Оклюдин переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 27 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 26 квітня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.