XPO5 (англ. Exportin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 204 амінокислот, а молекулярна маса — 136 311.
XPO5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | XPO5, exp5, exportin 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607845 MGI: 1913789 HomoloGene: 69316 GeneCards: XPO5 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 43.52 – 43.58 Mb | Хр. 17: 46.51 – 46.55 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAMDQVNALC | EQLVKAVTVM | MDPNSTQRYR | LEALKFCEEF | KEKCPICVPC | ||||
GLRLAEKTQV | AIVRHFGLQI | LEHVVKFRWN | GMSRLEKVYL | KNSVMELIAN | ||||
GTLNILEEEN | HIKDALSRIV | VEMIKREWPQ | HWPDMLIELD | TLSKQGETQT | ||||
ELVMFILLRL | AEDVVTFQTL | PPQRRRDIQQ | TLTQNMERIF | SFLLNTLQEN | ||||
VNKYQQVKTD | TSQESKAQAN | CRVGVAALNT | LAGYIDWVSM | SHITAENCKL | ||||
LEILCLLLNE | QELQLGAAEC | LLIAVSRKGK | LEDRKPLMVL | FGDVAMHYIL | ||||
SAAQTADGGG | LVEKHYVFLK | RLCQVLCALG | NQLCALLGAD | SDVETPSNFG | ||||
KYLESFLAFT | THPSQFLRSS | TQMTWGALFR | HEILSRDPLL | LAIIPKYLRA | ||||
SMTNLVKMGF | PSKTDSPSCE | YSRFDFDSDE | DFNAFFNSSR | AQQGEVMRLA | ||||
CRLDPKTSFQ | MAGEWLKYQL | STFLDAGSVN | SCSAVGTGEG | SLCSVFSPSF | ||||
VQWEAMTLFL | ESVITQMFRT | LNREEIPVND | GIELLQMVLN | FDTKDPLILS | ||||
CVLTNVSALF | PFVTYRPEFL | PQVFSKLFSS | VTFETVEESK | APRTRAVRNV | ||||
RRHACSSIIK | MCRDYPQLVL | PNFDMLYNHV | KQLLSNELLL | TQMEKCALME | ||||
ALVLISNQFK | NYERQKVFLE | ELMAPVASIW | LSQDMHRVLS | DVDAFIAYVG | ||||
TDQKSCDPGL | EDPCGLNRAR | MSFCVYSILG | VVKRTCWPTD | LEEAKAGGFV | ||||
VGYTSSGNPI | FRNPCTEQIL | KLLDNLLALI | RTHNTLYAPE | MLAKMAEPFT | ||||
KALDMLDAEK | SAILGLPQPL | LELNDSPVFK | TVLERMQRFF | STLYENCFHI | ||||
LGKAGPSMQQ | DFYTVEDLAT | QLLSSAFVNL | NNIPDYRLRP | MLRVFVKPLV | ||||
LFCPPEHYEA | LVSPILGPLF | TYLHMRLSQK | WQVINQRSLL | CGEDEAADEN | ||||
PESQEMLEEQ | LVRMLTREVM | DLITVCCVSK | KGADHSSAPP | ADGDDEEMMA | ||||
TEVTPSAMAE | LTDLGKCLMK | HEDVCTALLI | TAFNSLAWKD | TLSCQRTTSQ | ||||
LCWPLLKQVL | SGTLLADAVT | WLFTSVLKGL | QMHGQHDGCM | ASLVHLAFQI | ||||
YEALRPRYLE | IRAVMEQIPE | IQKDSLDQFD | CKLLNPSLQK | VADKRRKDQF | ||||
KRLIAGCIGK | PLGEQFRKEV | HIKNLPSLFK | KTKPMLETEV | LDNDGGGLAT | ||||
IFEP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Calado A., Treichel N., Mueller E.-C., Otto A., Kutay U. (2002). Exportin-5-mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA. EMBO J. 21: 6216—6224. PMID 12426393 DOI:10.1093/emboj/cdf620
- Yi R., Qin Y., Macara I.G., Cullen B.R. (2003). Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs. Genes Dev. 17: 3011—3016. PMID 14681208 DOI:10.1101/gad.1158803
- Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5. Mol. Cell. Biol. 24: 6608—6619. PMID 15254228 DOI:10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
- Bohnsack M.T., Czaplinski K., Goerlich D. (2004). Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs. RNA. 10: 185—191. PMID 14730017 DOI:10.1261/rna.5167604
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17675 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
XPO5 angl Exportin 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 204 aminokislot a molekulyarna masa 136 311 XPO5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3A6PIdentifikatoriSimvoliXPO5 exp5 exportin 5Zovnishni ID OMIM 607845 MGI 1913789 HomoloGene 69316 GeneCards XPO5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya tRNA binding mRNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding nuclear export signal receptor activity pre miRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma RNA nuclear export complex klitinne yadro nukleoplazma gialoplazma nuclear RNA export factor complexBiologichnij proces protein export from nucleus positive regulation of RNA interference protein transport intracellular protein transport GO 0061715 miRNA metabolic process Sajlensing geniv regulation of protein export from nucleus pre miRNA export from nucleus GO 0015915 transport nuclear exportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57510 72322Ensembl ENSG00000124571 ENSMUSG00000067150UniProt Q9HAV4 Q924C1RefSeq mRNK NM 020750NM 028198RefSeq bilok NP 065801NP 082474Lokus UCSC Hr 6 43 52 43 58 MbHr 17 46 51 46 55 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAMDQVNALCEQLVKAVTVMMDPNSTQRYRLEALKFCEEFKEKCPICVPC GLRLAEKTQVAIVRHFGLQILEHVVKFRWNGMSRLEKVYLKNSVMELIAN GTLNILEEENHIKDALSRIVVEMIKREWPQHWPDMLIELDTLSKQGETQT ELVMFILLRLAEDVVTFQTLPPQRRRDIQQTLTQNMERIFSFLLNTLQEN VNKYQQVKTDTSQESKAQANCRVGVAALNTLAGYIDWVSMSHITAENCKL LEILCLLLNEQELQLGAAECLLIAVSRKGKLEDRKPLMVLFGDVAMHYIL SAAQTADGGGLVEKHYVFLKRLCQVLCALGNQLCALLGADSDVETPSNFG KYLESFLAFTTHPSQFLRSSTQMTWGALFRHEILSRDPLLLAIIPKYLRA SMTNLVKMGFPSKTDSPSCEYSRFDFDSDEDFNAFFNSSRAQQGEVMRLA CRLDPKTSFQMAGEWLKYQLSTFLDAGSVNSCSAVGTGEGSLCSVFSPSF VQWEAMTLFLESVITQMFRTLNREEIPVNDGIELLQMVLNFDTKDPLILS CVLTNVSALFPFVTYRPEFLPQVFSKLFSSVTFETVEESKAPRTRAVRNV RRHACSSIIKMCRDYPQLVLPNFDMLYNHVKQLLSNELLLTQMEKCALME ALVLISNQFKNYERQKVFLEELMAPVASIWLSQDMHRVLSDVDAFIAYVG TDQKSCDPGLEDPCGLNRARMSFCVYSILGVVKRTCWPTDLEEAKAGGFV VGYTSSGNPIFRNPCTEQILKLLDNLLALIRTHNTLYAPEMLAKMAEPFT KALDMLDAEKSAILGLPQPLLELNDSPVFKTVLERMQRFFSTLYENCFHI LGKAGPSMQQDFYTVEDLATQLLSSAFVNLNNIPDYRLRPMLRVFVKPLV LFCPPEHYEALVSPILGPLFTYLHMRLSQKWQVINQRSLLCGEDEAADEN PESQEMLEEQLVRMLTREVMDLITVCCVSKKGADHSSAPPADGDDEEMMA TEVTPSAMAELTDLGKCLMKHEDVCTALLITAFNSLAWKDTLSCQRTTSQ LCWPLLKQVLSGTLLADAVTWLFTSVLKGLQMHGQHDGCMASLVHLAFQI YEALRPRYLEIRAVMEQIPEIQKDSLDQFDCKLLNPSLQKVADKRRKDQF KRLIAGCIGKPLGEQFRKEVHIKNLPSLFKKTKPMLETEVLDNDGGGLAT IFEP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport transport bilkiv RNK zalezhne zaglushennya geniv acetilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK tRNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaBrownawell A M Macara I G 2002 Exportin 5 a novel karyopherin mediates nuclear export of double stranded RNA binding proteins J Cell Biol 156 53 64 PMID 11777942 DOI 10 1083 jcb 200110082 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Calado A Treichel N Mueller E C Otto A Kutay U 2002 Exportin 5 mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA EMBO J 21 6216 6224 PMID 12426393 DOI 10 1093 emboj cdf620 Yi R Qin Y Macara I G Cullen B R 2003 Exportin 5 mediates the nuclear export of pre microRNAs and short hairpin RNAs Genes Dev 17 3011 3016 PMID 14681208 DOI 10 1101 gad 1158803 Chen T Brownawell A M Macara I G 2004 Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ a new cargo protein for exportin 5 Mol Cell Biol 24 6608 6619 PMID 15254228 DOI 10 1128 MCB 24 15 6608 6619 2004 Bohnsack M T Czaplinski K Goerlich D 2004 Exportin 5 is a RanGTP dependent dsRNA binding protein that mediates nuclear export of pre miRNAs RNA 10 185 191 PMID 14730017 DOI 10 1261 rna 5167604PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17675 angl Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 serpnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi