Гліцил тРНК синтаза англ Glycyl tRNA synthetase білок який кодується геном GARS розташованим у людей на короткому плечі

Гліцил-тРНК-синтаза (англ. Glycyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном GARS, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 83 166.

Гліцил-тРНК-синтаза

Наявні структури

PDB

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PME, 2PMF, 2Q5H, 2Q5I, 2ZT5, 2ZT6, 2ZT7, 2ZT8, 2ZXF, 4KQE, 4KR2, 4QEI, 5E6M

Ідентифікатори

Символи

GARS1, CMT2D, DSMAV, GlyRS, HMN5, SMAD1, glycyl-tRNA synthetase, GARS, glycyl-tRNA synthetase 1, HMN5A, SMAJI

Зовнішні ІД

OMIM: 600287 MGI: 2449057 HomoloGene: 1547 GeneCards: GARS1

Пов'язані генетичні захворювання

Charcot-Marie-Tooth disease type 2D, Distal hereditary motor neuropathy type V, distal hereditary motor neuronopathy type 5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • ligase activity • protein dimerization activity • ATP binding • bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (asymmetrical) activity • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • glycine-tRNA ligase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• аксон • мітохондріальний матрикс • cell projection • secretory granule • гіалоплазма • екзосома • extracellular region • цитоплазма • мітохондрія
Біологічний процес	• diadenosine tetraphosphate biosynthetic process • Біосинтез білків • glycyl-tRNA aminoacylation • mitochondrial glycyl-tRNA aminoacylation • tRNA aminoacylation for protein translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2617


353172

Ensembl


ENSG00000106105


ENSMUSG00000029777

UniProt


P41250


Q9CZD3

RefSeq (мРНК)


NM_002047 NM_001316772


NM_180678

RefSeq (білок)


NP_001303701 NP_002038


NP_851009

Локус (UCSC)

Хр. 7: 30.58 – 30.63 Mb

Хр. 6: 55.01 – 55.06 Mb

PubMed search

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSPRPVLLR	GARAALLLLL	PPRLLARPSL	LLRRSLSAAS	CPPISLPAAA
SRSSMDGAGA	EEVLAPLRLA	VRQQGDLVRK	LKEDKAPQVD	VDKAVAELKA
RKRVLEAKEL	ALQPKDDIVD	RAKMEDTLKR	RFFYDQAFAI	YGGVSGLYDF
GPVGCALKNN	IIQTWRQHFI	QEEQILEIDC	TMLTPEPVLK	TSGHVDKFAD
FMVKDVKNGE	CFRADHLLKA	HLQKLMSDKK	CSVEKKSEME	SVLAQLDNYG
QQELADLFVN	YNVKSPITGN	DLSPPVSFNL	MFKTFIGPGG	NMPGYLRPET
AQGIFLNFKR	LLEFNQGKLP	FAAAQIGNSF	RNEISPRSGL	IRVREFTMAE
IEHFVDPSEK	DHPKFQNVAD	LHLYLYSAKA	QVSGQSARKM	RLGDAVEQGV
INNTVLGYFI	GRIYLYLTKV	GISPDKLRFR	QHMENEMAHY	ACDCWDAESK
TSYGWIEIVG	CADRSCYDLS	CHARATKVPL	VAEKPLKEPK	TVNVVQFEPS
KGAIGKAYKK	DAKLVMEYLA	ICDECYITEM	EMLLNEKGEF	TIETEGKTFQ
LTKDMINVKR	FQKTLYVEEV	VPNVIEPSFG	LGRIMYTVFE	HTFHVREGDE
QRTFFSFPAV	VAPFKCSVLP	LSQNQEFMPF	VKELSEALTR	HGVSHKVDDS
SGSIGRRYAR	TDEIGVAFGV	TIDFDTVNKT	PHTATLRDRD	SMRQIRAEIS
ELPSIVQDLA	NGNITWADVE	ARYPLFEGQE	TGKKETIEE

A: Аланін
 C: Цистеїн
 D: Аспарагінова кислота
 E: Глутамінова кислота
 F: Фенілаланін
 G: Гліцин
 H: Гістидин
 I: Ізолейцин
 K: Лізин
 L: Лейцин
 M: Метіонін
 N: Аспарагін
 P: Пролін
 Q: Глутамін
 R: Аргінін
 S: Серин
 T: Треонін
 V: Валін
 W: Триптофан
 
 Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

Williams J.H., Osvath S.R., Khong T.-F., Pearse M.J., Power D.A. (1995). Cloning, sequencing and bacterial expression of human glycine tRNA synthetase. Nucleic Acids Res. 23: 1307—1310. PMID 7753621 DOI:10.1093/nar/23.8.1307
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xie W., Nangle L.A., Zhang W., Schimmel P., Yang X.-L. (2007). Long-range structural effects of a Charcot-Marie-Tooth disease-causing mutation in human glycyl-tRNA synthetase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 9976—9981. PMID 17545306 DOI:10.1073/pnas.0703908104
Guo R.-T., Chong Y.E., Guo M., Yang X.-L. (2009). Crystal structures and biochemical analyses suggest a unique mechanism and role for human glycyl-tRNA synthetase in Ap4A homeostasis. J. Biol. Chem. 284: 28968—28976. PMID 19710017 DOI:10.1074/jbc.M109.030692
Shiba K., Schimmel P., Motegi H., Noda T. (1994). Human glycyl-tRNA synthetase. Wide divergence of primary structure from bacterial counterpart and species-specific aminoacylation. J. Biol. Chem. 269: 30049—30055. PMID 7962006
Ge Q., Trieu E.P., Targoff I.N. (1994). Primary structure and functional expression of human glycyl-tRNA synthetase, an autoantigen in myositis. J. Biol. Chem. 269: 28790—28797. PMID 7961834

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Гліцил-тРНК-синтаза переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4162 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
UniProt, P41250 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Гліцил-тРНК-синтаза переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4162 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()

[UniProt-5] UniProt, P41250 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.