Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Гліцеральдегід-3-фосфатдегідрогеназа (англ. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) – білок, який кодується геном GAPDH, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 36 053.
| Гліцеральдегід-3-фосфатаза-дегідрогеназа | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | GAPDH, GAPD, G3PD, HEL-S-162eP, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 138400 MGI: 5434255 HomoloGene: 107053 GeneCards: GAPDH | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 12: 6.53 – 6.54 Mb | н/д | |||||||||||||||
| PubMed search | |||||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGKVKVGVNG | FGRIGRLVTR | AAFNSGKVDI | VAINDPFIDL | NYMVYMFQYD | ||||
| STHGKFHGTV | KAENGKLVIN | GNPITIFQER | DPSKIKWGDA | GAEYVVESTG | ||||
| VFTTMEKAGA | HLQGGAKRVI | ISAPSADAPM | FVMGVNHEKY | DNSLKIISNA | ||||
| SCTTNCLAPL | AKVIHDNFGI | VEGLMTTVHA | ITATQKTVDG | PSGKLWRDGR | ||||
| GALQNIIPAS | TGAAKAVGKV | IPELNGKLTG | MAFRVPTANV | SVVDLTCRLE | ||||
| KPAKYDDIKK | VVKQASEGPL | KGILGYTEHQ | VVSSDFNSDT | HSSTFDAGAG | ||||
| IALNDHFVKL | ISWYDNEFGY | SNRVVDLMAH | MASKE |
Цей білок за функціями належить до оксидоредуктаз, трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, гліколіз, регуляція трансляції. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.
Участь у гліколізі
Гліцеральдегід-3-фосфатдегідрогеназа каталізує реакцію окиснення із одночасним його фосфорилюванням. Це перша реакція гліколізу в якій виділяється енергія. В ході цієї реакції альдегід перетворюється не на вільну кислоту, а на змішаний ангідрид із фосфатною кислотою (). Сполуки такого типу — — мають дуже велику від'ємну зміну вільної енергії гідролізу (ΔG0 = −49,3 кДж/моль).
Реакцію перетворення гліцеральдегід-3-фосфату в 1,3-бісфосфогліцерат можна розглядати як два окремі процеси: окиснення альдегідної групи за допомогою НАД+ та приєднання фосфатної групи до утвореної карбонової кислоти. Перша реакція термодинамічно вигідна (ΔG0 = −50 кДж/моль), друга, навпаки, невигідна. Зміна вільної енергії для другої реакції майже така сама, тільки ця зміна додатна. Якби вони відбувались послідовно одна за одною, то друга реакція вимагала б надто великої енергії активації, щоб перебігати в клітині з достатньою швидкістю. Але обидва процеси є спряженими тому, що проміжна сполука — 3-фосфогліцерат — ковалентно зв'язана із залишком цистеїну зв'язком в активному центрі ферменту. Такий тип зв'язку дозволяє «законсервувати» частину енергії, яка виділяється під час окиснення гліцеральдегід-3-фосфату, та використати її для реакції із ортофосфатною кислотою.
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2016. Процитовано 30 січня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 27 лютого 2017. Процитовано 30 січня 2017.
- Nelson et al, 2008, с. 536.
- Berg et al, 2007, с. 442.
Література
- Arcari P., Martinelli R., Salvatore F. (1984). The complete sequence of a full length cDNA for human liver glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase: evidence for multiple mRNA species. Nucleic Acids Res. 12: 9179—9189. PMID 6096821 DOI:10.1093/nar/12.23.9179
- Tso J.Y., Sun X.-H., Kao T.-H., Reece K.S., Wu R. (1985). Isolation and characterization of rat and human glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase cDNAs: genomic complexity and molecular evolution of the gene. Nucleic Acids Res. 13: 2485—2502. PMID 2987855 DOI:10.1093/nar/13.7.2485
- Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nowak K., Wolny M., Banas T. (1981). The complete amino acid sequence of human muscle glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase. FEBS Lett. 134: 143—146. PMID 7030790 DOI:10.1016/0014-5793(81)80587-X
- Tisdale E.J. (2002). Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase is phosphorylated by protein kinase Ciota /lambda and plays a role in microtubule dynamics in the early secretory pathway. J. Biol. Chem. 277: 3334—3341. PMID 11724794 DOI:10.1074/jbc.M109744200
- Berg JM, Tymoczko JL, Stryer L (2007). Biochemistry (вид. 6th). W.H. Freeman and Company. ISBN . (англ.)
- Campbell NA, Reece JB (2008). (вид. 8th). Benjamin Cammings. ISBN . Архів оригіналу за 3 березня 2011. Процитовано 2 травня 2017. (англ.)
- Marieb EN, Hoehn K (2006). Human Anatomy & Physiology (вид. 7th). Benjamin Cummings. ISBN . (англ.)
- Nelson D.L., Cox M.M. (2008). Lehninger Principles of Biochemistry (вид. 5th). W. H. Freeman. ISBN . (англ.)
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Gliceraldegid 3 fosfatdegidrogenaza angl Glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase bilok yakij koduyetsya genom GAPDH roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 335 aminokislot a molekulyarna masa 36 053 Gliceraldegid 3 fosfataza degidrogenazaNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1U8F 1ZNQ 3GPD 4WNC 4WNIIdentifikatoriSimvoliGAPDH GAPD G3PD HEL S 162eP glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenaseZovnishni ID OMIM 138400 MGI 5434255 HomoloGene 107053 GeneCards GAPDHOntologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity microtubule binding NAD binding oxidoreductase activity acting on the aldehyde or oxo group of donors NAD or NADP as acceptor GO 0001948 GO 0016582 protein binding peptidyl cysteine S nitrosylase activity NADP binding identical protein binding oxidoreductase activity glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase NAD phosphorylating activity aspartic type endopeptidase inhibitor activity disordered domain specific bindingKlitinna komponenta vezikula yaderna membrana membrana vnutrishnoklitinna membranna organela microtubule cytoskeleton lipid droplet klitinna membrana perinuclear region of cytoplasm GAIT complex citoskelet ekzosoma gialoplazma klitinne yadro GO 0005578 Pozaklitinna matricya citoplazma RibonukleoproteyiniBiologichnij proces peptidyl cysteine S trans nitrosylation neuron apoptotic process glyukoneogenez negative regulation of translation glikoliz canonical glycolysis protein stabilization cellular response to interferon gamma regulation of translation microtubule cytoskeleton organization regulation of macroautophagy GO 0097285 apoptoz glucose metabolic process negative regulation of endopeptidase activity antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptideDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2597 100042025Ensembl ENSG00000111640 n dUniProt P04406 P16858RefSeq mRNK NM 002046 NM 001256799 NM 001289745 NM 001289746 NM 001357938NM 001357943 NM 001357944XM 001476707RefSeq bilok NP 001243728 NP 001276674 NP 001276675 NP 002037 NP 001344872NP 001276655 NP 032110Lokus UCSC Hr 12 6 53 6 54 Mbn dPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MGKVKVGVNGFGRIGRLVTRAAFNSGKVDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGNPITIFQERDPSKIKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEKAGAHLQGGAKRVIISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIISNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKLWRDGRGALQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTANVSVVDLTCRLEKPAKYDDIKKVVKQASEGPLKGILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAGIALNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMAHMASKEA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Cej bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz transferaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak apoptoz glikoliz regulyaciya translyaciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z NAD Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti yadri membrani Uchast u glikoliziZmina vilnoyi energiyi pid chas okisnennya gliceraldegid 3 fosfatu ta fosforilyuvannya utvorenogo 3 fosfogliceratu yaksho voni vidbuvayutsya poslidovno zverhu ta yaksho voni spryazheni zavdyaki kovalentnomu zv yazuvannyu promizhnogo produktu iz fermentom znizu Gliceraldegid 3 fosfatdegidrogenaza katalizuye reakciyu okisnennya iz odnochasnim jogo fosforilyuvannyam Ce persha reakciya glikolizu v yakij vidilyayetsya energiya V hodi ciyeyi reakciyi aldegid peretvoryuyetsya ne na vilnu kislotu a na zmishanij angidrid iz fosfatnoyu kislotoyu Spoluki takogo tipu mayut duzhe veliku vid yemnu zminu vilnoyi energiyi gidrolizu DG0 49 3 kDzh mol Reakciyu peretvorennya gliceraldegid 3 fosfatu v 1 3 bisfosfoglicerat mozhna rozglyadati yak dva okremi procesi okisnennya aldegidnoyi grupi za dopomogoyu NAD ta priyednannya fosfatnoyi grupi do utvorenoyi karbonovoyi kisloti Persha reakciya termodinamichno vigidna DG0 50 kDzh mol druga navpaki nevigidna Zmina vilnoyi energiyi dlya drugoyi reakciyi majzhe taka sama tilki cya zmina dodatna Yakbi voni vidbuvalis poslidovno odna za odnoyu to druga reakciya vimagala b nadto velikoyi energiyi aktivaciyi shob perebigati v klitini z dostatnoyu shvidkistyu Ale obidva procesi ye spryazhenimi tomu sho promizhna spoluka 3 fosfoglicerat kovalentno zv yazana iz zalishkom cisteyinu zv yazkom v aktivnomu centri fermentu Takij tip zv yazku dozvolyaye zakonservuvati chastinu energiyi yaka vidilyayetsya pid chas okisnennya gliceraldegid 3 fosfatu ta vikoristati yiyi dlya reakciyi iz ortofosfatnoyu kislotoyu DG0 6 3 kDzh molPrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 zhovtnya 2016 Procitovano 30 sichnya 2017 angl Arhiv originalu za 27 lyutogo 2017 Procitovano 30 sichnya 2017 Nelson et al 2008 s 536 Berg et al 2007 s 442 LiteraturaArcari P Martinelli R Salvatore F 1984 The complete sequence of a full length cDNA for human liver glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase evidence for multiple mRNA species Nucleic Acids Res 12 9179 9189 PMID 6096821 DOI 10 1093 nar 12 23 9179 Tso J Y Sun X H Kao T H Reece K S Wu R 1985 Isolation and characterization of rat and human glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase cDNAs genomic complexity and molecular evolution of the gene Nucleic Acids Res 13 2485 2502 PMID 2987855 DOI 10 1093 nar 13 7 2485 Ye Z Connor J R 2000 cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non IRE regulated iron responsive mRNAs Biochem Biophys Res Commun 275 223 227 PMID 10944468 DOI 10 1006 bbrc 2000 3282 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Nowak K Wolny M Banas T 1981 The complete amino acid sequence of human muscle glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase FEBS Lett 134 143 146 PMID 7030790 DOI 10 1016 0014 5793 81 80587 X Tisdale E J 2002 Glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase is phosphorylated by protein kinase Ciota lambda and plays a role in microtubule dynamics in the early secretory pathway J Biol Chem 277 3334 3341 PMID 11724794 DOI 10 1074 jbc M109744200 Berg JM Tymoczko JL Stryer L 2007 Biochemistry vid 6th W H Freeman and Company ISBN 0 7167 8724 5 angl Campbell NA Reece JB 2008 vid 8th Benjamin Cammings ISBN 978 0321543257 Arhiv originalu za 3 bereznya 2011 Procitovano 2 travnya 2017 angl Marieb EN Hoehn K 2006 Human Anatomy amp Physiology vid 7th Benjamin Cummings ISBN 978 0805359091 angl Nelson D L Cox M M 2008 Lehninger Principles of Biochemistry vid 5th W H Freeman ISBN 978 0 7167 7108 1 angl Div takozhHromosoma 12Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi