EDC3 (англ. Enhancer of mRNA decapping 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 56 078.
EDC3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EDC3, LSM16, YJDC, YJEFN2, MRT50, enhancer of mRNA decapping 3, hYjeF_N2-15q23 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609842 MGI: 2142951 HomoloGene: 11827 GeneCards: EDC3 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 15: 74.63 – 74.7 Mb | Хр. 9: 57.62 – 57.66 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MATDWLGSIV | SINCGDSLGV | YQGRVSAVDQ | VSQTISLTRP | FHNGVKCLVP | ||||
EVTFRAGDIT | ELKILEIPGP | GDNQHFGDLH | QTELGPSGAG | CQVGINQNGT | ||||
GKFVKKPASS | SSAPQNIPKR | TDVKSQDVAV | SPQQQQCSKS | YVDRHMESLS | ||||
QSKSFRRRHN | SWSSSSRHPN | QATPKKSGLK | NGQMKNKDDE | CFGDDIEEIP | ||||
DTDFDFEGNL | ALFDKAAVFE | EIDTYERRSG | TRSRGIPNER | PTRYRHDENI | ||||
LESEPIVYRR | IIVPHNVSKE | FCTDSGLVVP | SISYELHKKL | LSVAEKHGLT | ||||
LERRLEMTGV | CASQMALTLL | GGPNRLNPKN | VHQRPTVALL | CGPHVKGAQG | ||||
ISCGRHLANH | DVQVILFLPN | FVKMLESITN | ELSLFSKTQG | QQVSSLKDLP | ||||
TSPVDLVINC | LDCPENVFLR | DQPWYKAAVA | WANQNRAPVL | SIDPPVHEVE | ||||
QGIDAKWSLA | LGLPLPLGEH | AGRIYLCDIG | IPQQVFQEVG | INYHSPFGCK | ||||
FVIPLHSA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EDC3 angl Enhancer of mRNA decapping 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 15 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 508 aminokislot a molekulyarna masa 56 078 EDC3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2VC8 2WAX 2WAY 3D3J 3D3KIdentifikatoriSimvoliEDC3 LSM16 YJDC YJEFN2 MRT50 enhancer of mRNA decapping 3 hYjeF N2 15q23Zovnishni ID OMIM 609842 MGI 2142951 HomoloGene 11827 GeneCards EDC3Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding phosphodiesterase decapping endonuclease activity identical protein binding RNA binding mRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma membrana P body cytoplasmic ribonucleoprotein granuleBiologichnij proces P body assembly exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA RNA phosphodiester bond hydrolysis endonucleolytic deadenylation independent decapping of nuclear transcribed mRNADzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez80153 353190Ensembl ENSG00000179151 ENSMUSG00000038957UniProt Q96F86 Q8K2D3RefSeq mRNK NM 001142443 NM 001142444 NM 025083 NM 001351378 NM 001351379NM 153799RefSeq bilok NP 001135915 NP 001135916 NP 079359 NP 001338307 NP 001338308NP 722494Lokus UCSC Hr 15 74 63 74 7 MbHr 9 57 62 57 66 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MATDWLGSIVSINCGDSLGVYQGRVSAVDQVSQTISLTRPFHNGVKCLVP EVTFRAGDITELKILEIPGPGDNQHFGDLHQTELGPSGAGCQVGINQNGT GKFVKKPASSSSAPQNIPKRTDVKSQDVAVSPQQQQCSKSYVDRHMESLS QSKSFRRRHNSWSSSSRHPNQATPKKSGLKNGQMKNKDDECFGDDIEEIP DTDFDFEGNLALFDKAAVFEEIDTYERRSGTRSRGIPNERPTRYRHDENI LESEPIVYRRIIVPHNVSKEFCTDSGLVVPSISYELHKKLLSVAEKHGLT LERRLEMTGVCASQMALTLLGGPNRLNPKNVHQRPTVALLCGPHVKGAQG ISCGRHLANHDVQVILFLPNFVKMLESITNELSLFSKTQGQQVSSLKDLP TSPVDLVINCLDCPENVFLRDQPWYKAAVAWANQNRAPVLSIDPPVHEVE QGIDAKWSLALGLPLPLGEHAGRIYLCDIGIPQQVFQEVGINYHSPFGCK FVIPLHSA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Fenger Groen M Fillman C Norrild B Lykke Andersen J 2005 Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping Mol Cell 20 905 915 PMID 16364915 DOI 10 1016 j molcel 2005 10 031 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 21 zhovtnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 15 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi