APOBEC1 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 28 192.
APOBEC1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | APOBEC1, APOBEC-1, BEDP, CDAR1, HEPR, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600130 MGI: 103298 HomoloGene: 1243 GeneCards: APOBEC1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 7.65 – 7.67 Mb | Хр. 6: 122.55 – 122.58 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTSEKGPSTG | DPTLRRRIEP | WEFDVFYDPR | ELRKEACLLY | EIKWGMSRKI | ||||
WRSSGKNTTN | HVEVNFIKKF | TSERDFHPSM | SCSITWFLSW | SPCWECSQAI | ||||
REFLSRHPGV | TLVIYVARLF | WHMDQQNRQG | LRDLVNSGVT | IQIMRASEYY | ||||
HCWRNFVNYP | PGDEAHWPQY | PPLWMMLYAL | ELHCIILSLP | PCLKISRRWQ | ||||
NHLTFFRLHL | QNCHYQTIPP | HILLATGLIH | PSVAWR |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Hadjiagapiou C., Giannoni F., Funahashi T., Skarosi S.F., Davidson N.O. (1994). Molecular cloning of a human small intestinal apolipoprotein B mRNA editing protein. Nucleic Acids Res. 22: 1874—1879. PMID 8208612 DOI:10.1093/nar/22.10.1874
- Lau P.P., Zhu H.-J., Baldini A., Charnsangavej C., Chan L. (1994). Dimeric structure of a human apolipoprotein B mRNA editing protein and cloning and chromosomal localization of its gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8522—8526. PMID 8078915 DOI:10.1073/pnas.91.18.8522
- Fujino T., Navaratnam N., Scott J. (1998). Human apolipoprotein B RNA editing deaminase gene (APOBEC1). Genomics. 47: 266—275. PMID 9479499 DOI:10.1006/geno.1997.5110
- Lau P.P., Zhu H.J., Nakamuta M., Chan L. (1997). Cloning of an Apobec-1-binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing. J. Biol. Chem. 272: 1452—1455. PMID 8999813 DOI:10.1074/jbc.272.3.1452
- Lau P.P., Chang B.-H., Chan L. (2001). Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 977—983. PMID 11352648 DOI:10.1006/bbrc.2001.4679
- Hirano K., Min J., Funahashi T., Baunoch D.A., Davidson N.O. (1997). Characterization of the human apobec-1 gene: expression in gastrointestinal tissues determined by alternative splicing with production of a novel truncated peptide. J. Lipid Res. 38: 847—859. PMID 9186903
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
APOBEC1 angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 236 aminokislot a molekulyarna masa 28 192 APOBEC1IdentifikatoriSimvoliAPOBEC1 APOBEC 1 BEDP CDAR1 HEPR apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1Zovnishni ID OMIM 600130 MGI 103298 HomoloGene 1243 GeneCards APOBEC1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0010577 enzyme activator activity hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines GO 0001948 GO 0016582 protein binding mRNA binding cytidine deaminase activity RNA binding katalitichna aktivnist zinc ion binding hydrolase activity cytosine deaminase activity zv yazuvannya z ionom metalu protein domain specific binding ribonucleoprotein complex binding mRNA 3 UTR AU rich region bindingKlitinna komponenta klitinne yadro nukleoplazma citoplazmaBiologichnij proces DNA cytosine deamination cellular response to insulin stimulus response to osmotic stress mRNA processing GO 0033168 GO 0036404 GO 1902360 RNA processing response to calcium ion response to ethanol regulation of cell population proliferation response to zinc ion defense response to virus cytidine to uridine editing response to gamma radiation mRNA stabilization DNA demethylation lipoprotein metabolic process lipoprotein transport GO 0048554 positive regulation of catalytic activity lipoprotein biosynthetic process lipid metabolism negative regulation of DNA methylation dependent heterochromatin assembly positive regulation of mRNA modification cytidine deamination mRNA modification triglyceride metabolic process negative regulation of triglyceride metabolic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez339 11810Ensembl ENSG00000111701 ENSMUSG00000040613UniProt P41238 P51908RefSeq mRNK NM 005889 NM 001304566 NM 001644NM 001134391 NM 031159RefSeq bilok NP 001291495 NP 001635 NP 005880NP 001127863 NP 112436Lokus UCSC Hr 12 7 65 7 67 MbHr 6 122 55 122 58 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MTSEKGPSTGDPTLRRRIEPWEFDVFYDPRELRKEACLLYEIKWGMSRKI WRSSGKNTTNHVEVNFIKKFTSERDFHPSMSCSITWFLSWSPCWECSQAI REFLSRHPGVTLVIYVARLFWHMDQQNRQGLRDLVNSGVTIQIMRASEYY HCWRNFVNYPPGDEAHWPQYPPLWMMLYALELHCIILSLPPCLKISRRWQ NHLTFFRLHLQNCHYQTIPPHILLATGLIHPSVAWR A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaHadjiagapiou C Giannoni F Funahashi T Skarosi S F Davidson N O 1994 Molecular cloning of a human small intestinal apolipoprotein B mRNA editing protein Nucleic Acids Res 22 1874 1879 PMID 8208612 DOI 10 1093 nar 22 10 1874 Lau P P Zhu H J Baldini A Charnsangavej C Chan L 1994 Dimeric structure of a human apolipoprotein B mRNA editing protein and cloning and chromosomal localization of its gene Proc Natl Acad Sci U S A 91 8522 8526 PMID 8078915 DOI 10 1073 pnas 91 18 8522 Fujino T Navaratnam N Scott J 1998 Human apolipoprotein B RNA editing deaminase gene APOBEC1 Genomics 47 266 275 PMID 9479499 DOI 10 1006 geno 1997 5110 Lau P P Zhu H J Nakamuta M Chan L 1997 Cloning of an Apobec 1 binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing J Biol Chem 272 1452 1455 PMID 8999813 DOI 10 1074 jbc 272 3 1452 Lau P P Chang B H Chan L 2001 Two hybrid cloning identifies an RNA binding protein GRY RBP as a component of apobec 1 editosome Biochem Biophys Res Commun 282 977 983 PMID 11352648 DOI 10 1006 bbrc 2001 4679 Hirano K Min J Funahashi T Baunoch D A Davidson N O 1997 Characterization of the human apobec 1 gene expression in gastrointestinal tissues determined by alternative splicing with production of a novel truncated peptide J Lipid Res 38 847 859 PMID 9186903PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 12 bereznya 2016 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 lipnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi