SMC1A (англ. Structural maintenance of chromosomes 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 233 амінокислот, а молекулярна маса — 143 233.
SMC1A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SMC1A, CDLS2, DXS423E, SB1.8, SMC1, SMC1L1, SMC1alpha, SMCB, structural maintenance of chromosomes 1A, EIEE85, DEE85 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 300040 MGI: 1344345 HomoloGene: 4597 GeneCards: SMC1A | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 53.37 – 53.42 Mb | Хр. X: 150.8 – 150.85 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGFLKLIEIE | NFKSYKGRQI | IGPFQRFTAI | IGPNGSGKSN | LMDAISFVLG | ||||
EKTSNLRVKT | LRDLIHGAPV | GKPAANRAFV | SMVYSEEGAE | DRTFARVIVG | ||||
GSSEYKINNK | VVQLHEYSEE | LEKLGILIKA | RNFLVFQGAV | ESIAMKNPKE | ||||
RTALFEEISR | SGELAQEYDK | RKKEMVKAEE | DTQFNYHRKK | NIAAERKEAK | ||||
QEKEEADRYQ | RLKDEVVRAQ | VQLQLFKLYH | NEVEIEKLNK | ELASKNKEIE | ||||
KDKKRMDKVE | DELKEKKKEL | GKMMREQQQI | EKEIKEKDSE | LNQKRPQYIK | ||||
AKENTSHKIK | KLEAAKKSLQ | NAQKHYKKRK | GDMDELEKEM | LSVEKARQEF | ||||
EERMEEESQS | QGRDLTLEEN | QVKKYHRLKE | EASKRAATLA | QELEKFNRDQ | ||||
KADQDRLDLE | ERKKVETEAK | IKQKLREIEE | NQKRIEKLEE | YITTSKQSLE | ||||
EQKKLEGELT | EEVEMAKRRI | DEINKELNQV | MEQLGDARID | RQESSRQQRK | ||||
AEIMESIKRL | YPGSVYGRLI | DLCQPTQKKY | QIAVTKVLGK | NMDAIIVDSE | ||||
KTGRDCIQYI | KEQRGEPETF | LPLDYLEVKP | TDEKLRELKG | AKLVIDVIRY | ||||
EPPHIKKALQ | YACGNALVCD | NVEDARRIAF | GGHQRHKTVA | LDGTLFQKSG | ||||
VISGGASDLK | AKARRWDEKA | VDKLKEKKER | LTEELKEQMK | AKRKEAELRQ | ||||
VQSQAHGLQM | RLKYSQSDLE | QTKTRHLALN | LQEKSKLESE | LANFGPRIND | ||||
IKRIIQSRER | EMKDLKEKMN | QVEDEVFEEF | CREIGVRNIR | EFEEEKVKRQ | ||||
NEIAKKRLEF | ENQKTRLGIQ | LDFEKNQLKE | DQDKVHMWEQ | TVKKDENEIE | ||||
KLKKEEQRHM | KIIDETMAQL | QDLKNQHLAK | KSEVNDKNHE | MEEIRKKLGG | ||||
ANKEMTHLQK | EVTAIETKLE | QKRSDRHNLL | QACKMQDIKL | PLSKGTMDDI | ||||
SQEEGSSQGE | DSVSGSQRIS | SIYAREALIE | IDYGDLCEDL | KDAQAEEEIK | ||||
QEMNTLQQKL | NEQQSVLQRI | AAPNMKAMEK | LESVRDKFQE | TSDEFEAARK | ||||
RAKKAKQAFE | QIKKERFDRF | NACFESVATN | IDEIYKALSR | NSSAQAFLGP | ||||
ENPEEPYLDG | INYNCVAPGK | RFRPMDNLSG | GEKTVAALAL | LFAIHSYKPA | ||||
PFFVLDEIDA | ALDNTNIGKV | ANYIKEQSTC | NFQAIVISLK | EEFYTKAESL | ||||
IGVYPEQGDC | VISKVLTFDL | TKYPDANPNP | NEQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.
Література
- Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen Y., Sharp Z.D., Lee W.-H. (1997). HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins. J. Biol. Chem. 272: 24081—24087. PMID 9295362 DOI:10.1074/jbc.272.38.24081
- Zheng L., Chen Y., Lee W.-H. (1999). Hec1p, an evolutionarily conserved coiled-coil protein, modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5417—5428. PMID 10409732 DOI:10.1128/MCB.19.8.5417
- Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749
- Gregson H.C., Van Hooser A.A., Ball A.R. Jr., Brinkley B.R., Yokomori K. (2002). Localization of human SMC1 protein at kinetochores. Chromosome Res. 10: 267—277. PMID 12199140 DOI:10.1023/A:1016563523208
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 9 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SMC1A angl Structural maintenance of chromosomes 1A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 233 aminokislot a molekulyarna masa 143 233 SMC1ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2WD5IdentifikatoriSimvoliSMC1A CDLS2 DXS423E SB1 8 SMC1 SMC1L1 SMC1alpha SMCB structural maintenance of chromosomes 1A EIEE85 DEE85Zovnishni ID OMIM 300040 MGI 1344345 HomoloGene 4597 GeneCards SMC1AOntologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding mediator complex binding chromatin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein heterodimerization activity ATP binding RNA binding GO 0032403 protein containing complex bindingKlitinna komponenta GO 0034991 meiotic cohesin complex hromosoma nukleoplazma condensed nuclear chromosome centromera klitinne yadro kinetohor gialoplazma GO 0000798 cohesin complex nuclear matrix mitotic spindle poleBiologichnij proces GO 0051312 GO 0007083 chromosome organization cellular response to DNA damage stimulus stem cell population maintenance podil klitini negative regulation of DNA endoreduplication mitotic sister chromatid cohesion mitotic sister chromatid segregation klitinnij cikl response to radiation GO 0100026 Reparaciya DNK sister chromatid cohesion response to DNA damage checkpoint signaling GO 0007126 mejoz regulation of mitotic spindle assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8243 24061Ensembl ENSG00000072501 ENSMUSG00000041133UniProt Q14683 Q68EN4 Q9CU62RefSeq mRNK NM 006306 NM 001281463NM 019710RefSeq bilok NP 001268392 NP 006297 NP 006297 2NP 062684Lokus UCSC Hr X 53 37 53 42 MbHr X 150 8 150 85 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLG EKTSNLRVKTLRDLIHGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVG GSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKE RTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAERKEAK QEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIE KDKKRMDKVEDELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIK AKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKHYKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEF EERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLAQELEKFNRDQ KADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLE EQKKLEGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRK AEIMESIKRLYPGSVYGRLIDLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSE KTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKLRELKGAKLVIDVIRY EPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSG VISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQ VQSQAHGLQMRLKYSQSDLEQTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRIND IKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEFCREIGVRNIREFEEEKVKRQ NEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKDENEIE KLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGG ANKEMTHLQKEVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDI SQEEGSSQGEDSVSGSQRISSIYAREALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIK QEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARK RAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGP ENPEEPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPA PFFVLDEIDAALDNTNIGKVANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESL IGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK mitoz mejoz acetilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u yadri hromosomah centromerah kinetohori LiteraturaNagase T Seki N Ishikawa K Tanaka A Nomura N 1996 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes V The coding sequences of 40 new genes KIAA0161 KIAA0200 deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG 1 DNA Res 3 17 24 PMID 8724849 DOI 10 1093 dnares 3 1 17 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Chen Y Sharp Z D Lee W H 1997 HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins J Biol Chem 272 24081 24087 PMID 9295362 DOI 10 1074 jbc 272 38 24081 Zheng L Chen Y Lee W H 1999 Hec1p an evolutionarily conserved coiled coil protein modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins Mol Cell Biol 19 5417 5428 PMID 10409732 DOI 10 1128 MCB 19 8 5417 Sumara I Vorlaufer E Gieffers C Peters B H Peters J M 2000 Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase J Cell Biol 151 749 762 PMID 11076961 DOI 10 1083 jcb 151 4 749 Gregson H C Van Hooser A A Ball A R Jr Brinkley B R Yokomori K 2002 Localization of human SMC1 protein at kinetochores Chromosome Res 10 267 277 PMID 12199140 DOI 10 1023 A 1016563523208PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 1 travnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 9 listopada 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi