EGR2 (англ. Early growth response 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302.
EGR2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EGR2, AT591, CMT1D, CMT4E, KROX20, early growth response 2, CHN1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 129010 MGI: 95296 HomoloGene: 20123 GeneCards: EGR2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Charcot-Marie-Tooth disease type 4E, Charcot-Marie-Tooth disease type 1D | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 62.81 – 62.82 Mb | Хр. 10: 67.54 – 67.54 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMTAKAVDKI | PVTLSGFVHQ | LSDNIYPVED | LAATSVTIFP | NAELGGPFDQ | ||||
MNGVAGDGMI | NIDMTGEKRS | LDLPYPSSFA | PVSAPRNQTF | TYMGKFSIDP | ||||
QYPGASCYPE | GIINIVSAGI | LQGVTSPAST | TASSSVTSAS | PNPLATGPLG | ||||
VCTMSQTQPD | LDHLYSPPPP | PPPYSGCAGD | LYQDPSAFLS | AATTSTSSSL | ||||
AYPPPPSYPS | PKPATDPGLF | PMIPDYPGFF | PSQCQRDLHG | TAGPDRKPFP | ||||
CPLDTLRVPP | PLTPLSTIRN | FTLGGPSAGV | TGPGASGGSE | GPRLPGSSSA | ||||
AAAAAAAAAY | NPHHLPLRPI | LRPRKYPNRP | SKTPVHERPY | PCPAEGCDRR | ||||
FSRSDELTRH | IRIHTGHKPF | QCRICMRNFS | RSDHLTTHIR | THTGEKPFAC | ||||
DYCGRKFARS | DERKRHTKIH | LRQKERKSSA | PSASVPAPST | ASCSGGVQPG | ||||
GTLCSSNSSS | LGGGPLAPCS | SRTRTP |
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rangnekar V.M., Aplin A.C., Sukhatme V.P. (1990). The serum and TPA responsive promoter and intron-exon structure of EGR2, a human early growth response gene encoding a zinc finger protein. Nucleic Acids Res. 18: 2749—2757. PMID 2111009 DOI:10.1093/nar/18.9.2749
- Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem. 278: 51116—51124. PMID 14532282 DOI:10.1074/jbc.M303470200
- Garcia-Gutierrez P., Juarez-Vicente F., Gallardo-Chamizo F., Charnay P., Garcia-Dominguez M. (2011). The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators. EMBO Rep. 12: 1018—1023. PMID 21836637 DOI:10.1038/embor.2011.152
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з EGR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EGR2 angl Early growth response 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 476 aminokislot a molekulyarna masa 50 302 EGR2IdentifikatoriSimvoliEGR2 AT591 CMT1D CMT4E KROX20 early growth response 2 CHN1Zovnishni ID OMIM 129010 MGI 95296 HomoloGene 20123 GeneCards EGR2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaCharcot Marie Tooth disease type 4E Charcot Marie Tooth disease type 1D Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity HMG box domain binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding ubiquitin protein ligase binding transferase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific SUMO ligase activityKlitinna komponenta citoplazma klitinne yadro nukleoplazma vnutrishnoklitinna membranna organelaBiologichnij proces cellular response to organic substance rhythmic behavior peripheral nervous system development GO 0009373 regulation of transcription DNA templated rhombomere 3 development brain segmentation transcription by RNA polymerase II protein sumoylation rhombomere 3 formation transcription DNA templated response to insulin GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated brain development rhombomere 5 formation protein export from nucleus learning or memory skeletal muscle cell differentiation Schwann cell differentiation regulation of neuronal synaptic plasticity myelination facial nerve structural organization regulation of ossification motor neuron axon guidance fat cell differentiation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1959 13654Ensembl ENSG00000122877 ENSMUSG00000037868UniProt P11161 P08152RefSeq mRNK NM 000399 NM 001136177 NM 001136178 NM 001136179 NM 001321037NM 010118 NM 001347458RefSeq bilok NP 000390 NP 001129649 NP 001129650 NP 001129651 NP 001307966NP 001334387 NP 034248 NP 001360912 NP 001360914 NP 001360915NP 001360916Lokus UCSC Hr 10 62 81 62 82 MbHr 10 67 54 67 54 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MMTAKAVDKIPVTLSGFVHQLSDNIYPVEDLAATSVTIFPNAELGGPFDQ MNGVAGDGMINIDMTGEKRSLDLPYPSSFAPVSAPRNQTFTYMGKFSIDP QYPGASCYPEGIINIVSAGILQGVTSPASTTASSSVTSASPNPLATGPLG VCTMSQTQPDLDHLYSPPPPPPPYSGCAGDLYQDPSAFLSAATTSTSSSL AYPPPPSYPSPKPATDPGLFPMIPDYPGFFPSQCQRDLHGTAGPDRKPFP CPLDTLRVPPPLTPLSTIRNFTLGGPSAGVTGPGASGGSEGPRLPGSSSA AAAAAAAAAYNPHHLPLRPILRPRKYPNRPSKTPVHERPYPCPAEGCDRR FSRSDELTRHIRIHTGHKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFAC DYCGRKFARSDERKRHTKIHLRQKERKSSAPSASVPAPSTASCSGGVQPG GTLCSSNSSSLGGGPLAPCSSRTRTP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ligaz aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi ubikvitinuvannya bilkiv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Rangnekar V M Aplin A C Sukhatme V P 1990 The serum and TPA responsive promoter and intron exon structure of EGR2 a human early growth response gene encoding a zinc finger protein Nucleic Acids Res 18 2749 2757 PMID 2111009 DOI 10 1093 nar 18 9 2749 Luciano R L Wilson A C 2003 HCF 1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20 J Biol Chem 278 51116 51124 PMID 14532282 DOI 10 1074 jbc M303470200 Garcia Gutierrez P Juarez Vicente F Gallardo Chamizo F Charnay P Garcia Dominguez M 2011 The transcription factor Krox20 is an E3 ligase that sumoylates its Nab coregulators EMBO Rep 12 1018 1023 PMID 21836637 DOI 10 1038 embor 2011 152PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z EGR2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 travnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 5 zhovtnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi