EXOSC6 (англ. Exosome component 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 28 235.
EXOSC6 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EXOSC6, EAP4, MTR3, Mtr3p, hMtr3p, p11, Exosome component 6 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606490 MGI: 1919794 HomoloGene: 12469 GeneCards: EXOSC6 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 70.25 – 70.25 Mb | Хр. 8: 111.78 – 111.78 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPGDHRRIRG | PEESQPPQLY | AADEEEAPGT | RDPTRLRPVY | ARAGLLSQAK | ||||
GSAYLEAGGT | KVLCAVSGPR | QAEGGERGGG | PAGAGGEAPA | ALRGRLLCDF | ||||
RRAPFAGRRR | RAPPGGCEER | ELALALQEAL | EPAVRLGRYP | RAQLEVSALL | ||||
LEDGGSALAA | ALTAAALALA | DAGVEMYDLV | VGCGLSLAPG | PAPTWLLDPT | ||||
RLEEERAAAG | LTVALMPVLN | QVAGLLGSGE | GGLTESWAEA | VRLGLEGCQR | ||||
LYPVLQQSLV | RAARRRGAAA | QP |
Задіяний у такому біологічному процесі, як процесмнг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Raijmakers R., Vree Egberts W., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions between human exosome components support the assembly of RNase PH-type subunits into a six-membered PNPase-like ring. J. Mol. Biol. 323: 653—663. PMID 12419256 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00947-6
- Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189.
{{}}
: Пропущений або порожній|title=
()
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19055 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EXOSC6 angl Exosome component 6 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 272 aminokislot a molekulyarna masa 28 235 EXOSC6Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2NN6IdentifikatoriSimvoliEXOSC6 EAP4 MTR3 Mtr3p hMtr3p p11 Exosome component 6Zovnishni ID OMIM 606490 MGI 1919794 HomoloGene 12469 GeneCards EXOSC6Ontologiya genaMolekulyarna funkciya exoribonuclease activity RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma Ekzosoma nuclear exosome RNase complex cytoplasmic exosome RNase complex yaderce klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces regulation of mRNA stability nuclear transcribed mRNA catabolic process exonucleolytic 3 5 rRNA 3 end processing rRNA catabolic process DNA deamination GO 0071049 GO 0071048 GO 0071033 nuclear mRNA surveillance exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA U4 snRNA 3 end processing polyadenylation dependent snoRNA 3 end processing rRNA processing positive regulation of isotype switching Peremikannya klasu imunoglobuliniv RNA phosphodiester bond hydrolysis exonucleolyticDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez118460 72544Ensembl ENSG00000223496 ENSMUSG00000109941UniProt Q5RKV6 Q8BTW3RefSeq mRNK NM 058219NM 028274RefSeq bilok NP 478126NP 082550Lokus UCSC Hr 16 70 25 70 25 MbHr 8 111 78 111 78 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPGDHRRIRGPEESQPPQLYAADEEEAPGTRDPTRLRPVYARAGLLSQAK GSAYLEAGGTKVLCAVSGPRQAEGGERGGGPAGAGGEAPAALRGRLLCDF RRAPFAGRRRRAPPGGCEERELALALQEALEPAVRLGRYPRAQLEVSALL LEDGGSALAAALTAAALALADAGVEMYDLVVGCGLSLAPGPAPTWLLDPT RLEEERAAAGLTVALMPVLNQVAGLLGSGEGGLTESWAEAVRLGLEGCQR LYPVLQQSLVRAARRRGAAAQP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesmng rRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri ekzosomi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Raijmakers R Vree Egberts W van Venrooij W J Pruijn G J M 2002 Protein protein interactions between human exosome components support the assembly of RNase PH type subunits into a six membered PNPase like ring J Mol Biol 323 653 663 PMID 12419256 DOI 10 1016 S0022 2836 02 00947 6 Lehner B Sanderson C M 2004 A protein interaction framework for human mRNA degradation Genome Res 14 1315 1323 PMID 15231747 DOI 10 1101 gr 2122004 Liu Q Greimann J C Lima C D 2006 Reconstitution activities and structure of the eukaryotic RNA exosome Cell 127 1223 1237 PMID 17174896 DOI 10 1016 j cell 2006 10 037 Liu Q Greimann J C Lima C D 2007 Cell 131 188 189 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Propushenij abo porozhnij title dovidka PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 19055 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 4 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi