EXOSC5 (англ. Exosome component 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 25 249.
EXOSC5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EXOSC5, RRP41B, RRP46, Rrp46p, hRrp46p, p12B, Exosome component 5, CABAC | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606492 MGI: 107889 HomoloGene: 5981 GeneCards: EXOSC5 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 41.39 – 41.4 Mb | Хр. 7: 25.36 – 25.37 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEEETHTDAK | IRAENGTGSS | PRGPGCSLRH | FACEQNLLSR | PDGSASFLQG | ||||
DTSVLAGVYG | PAEVKVSKEI | FNKATLEVIL | RPKIGLPGVA | EKSRERLIRN | ||||
TCEAVVLGTL | HPRTSITVVL | QVVSDAGSLL | ACCLNAACMA | LVDAGVPMRA | ||||
LFCGVACALD | SDGTLVLDPT | SKQEKEARAV | LTFALDSVER | KLLMSSTKGL | ||||
YSDTELQQCL | AAAQAASQHV | FRFYRESLQR | RYSKS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Raijmakers R., Noordman Y.E., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions of hCsl4p with other human exosome subunits. J. Mol. Biol. 315: 809—818. PMID 11812149 DOI:10.1006/jmbi.2001.5265
- Guo X., Ma J., Sun J., Gao G. (2007). The zinc-finger antiviral protein recruits the RNA processing exosome to degrade the target mRNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 151—156. PMID 17185417 DOI:10.1073/pnas.0607063104
- Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189.
{{}}
: Пропущений або порожній|title=
()
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24662 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EXOSC5 angl Exosome component 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 235 aminokislot a molekulyarna masa 25 249 EXOSC5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2NN6IdentifikatoriSimvoliEXOSC5 RRP41B RRP46 Rrp46p hRrp46p p12B Exosome component 5 CABACZovnishni ID OMIM 606492 MGI 107889 HomoloGene 5981 GeneCards EXOSC5Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya 3 5 exoribonuclease activity exoribonuclease activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma Ekzosoma nuclear exosome RNase complex cytoplasmic exosome RNase complex yaderce klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces regulation of mRNA stability nuclear transcribed mRNA catabolic process exonucleolytic 3 5 rRNA 3 end processing rRNA catabolic process DNA deamination GO 0071049 GO 0071048 GO 0071033 nuclear mRNA surveillance defense response to virus exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA U4 snRNA 3 end processing polyadenylation dependent snoRNA 3 end processing Degradaciya RNK rRNA processing RNA phosphodiester bond hydrolysis exonucleolyticDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez56915 27998Ensembl ENSG00000077348 ENSMUSG00000061286UniProt Q9NQT4 Q9CRA8RefSeq mRNK NM 020158NM 138586RefSeq bilok NP 064543NP 613052Lokus UCSC Hr 19 41 39 41 4 MbHr 7 25 36 25 37 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEEETHTDAKIRAENGTGSSPRGPGCSLRHFACEQNLLSRPDGSASFLQG DTSVLAGVYGPAEVKVSKEIFNKATLEVILRPKIGLPGVAEKSRERLIRN TCEAVVLGTLHPRTSITVVLQVVSDAGSLLACCLNAACMALVDAGVPMRA LFCGVACALDSDGTLVLDPTSKQEKEARAVLTFALDSVERKLLMSSTKGL YSDTELQQCLAAAQAASQHVFRFYRESLQRRYSKS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesing rRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri ekzosomi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Raijmakers R Noordman Y E van Venrooij W J Pruijn G J M 2002 Protein protein interactions of hCsl4p with other human exosome subunits J Mol Biol 315 809 818 PMID 11812149 DOI 10 1006 jmbi 2001 5265 Guo X Ma J Sun J Gao G 2007 The zinc finger antiviral protein recruits the RNA processing exosome to degrade the target mRNA Proc Natl Acad Sci U S A 104 151 156 PMID 17185417 DOI 10 1073 pnas 0607063104 Chen G Guo X Lv F Xu Y Gao G 2008 p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc finger antiviral protein Proc Natl Acad Sci U S A 105 4352 4357 PMID 18334637 DOI 10 1073 pnas 0712276105 Liu Q Greimann J C Lima C D 2006 Reconstitution activities and structure of the eukaryotic RNA exosome Cell 127 1223 1237 PMID 17174896 DOI 10 1016 j cell 2006 10 037 Liu Q Greimann J C Lima C D 2007 Cell 131 188 189 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Propushenij abo porozhnij title dovidka PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Exosome component 5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 24662 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi