EFEMP1 (англ. EGF containing fibulin like extracellular matrix protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 54 641.
EFEMP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EFEMP1, DHRD, DRAD, FBLN3, FBNL, FIBL-3, MLVT, MTLV, S1-5, EGF containing fibulin like extracellular matrix protein 1, EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601548 MGI: 1339998 HomoloGene: 3028 GeneCards: EFEMP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 55.87 – 55.92 Mb | Хр. 11: 28.8 – 28.88 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLKALFLTML | TLALVKSQDT | EETITYTQCT | DGYEWDPVRQ | QCKDIDECDI | ||||
VPDACKGGMK | CVNHYGGYLC | LPKTAQIIVN | NEQPQQETQP | AEGTSGATTG | ||||
VVAASSMATS | GVLPGGGFVA | SAAAVAGPEM | QTGRNNFVIR | RNPADPQRIP | ||||
SNPSHRIQCA | AGYEQSEHNV | CQDIDECTAG | THNCRADQVC | INLRGSFACQ | ||||
CPPGYQKRGE | QCVDIDECTI | PPYCHQRCVN | TPGSFYCQCS | PGFQLAANNY | ||||
TCVDINECDA | SNQCAQQCYN | ILGSFICQCN | QGYELSSDRL | NCEDIDECRT | ||||
SSYLCQYQCV | NEPGKFSCMC | PQGYQVVRSR | TCQDINECET | TNECREDEMC | ||||
WNYHGGFRCY | PRNPCQDPYI | LTPENRCVCP | VSNAMCRELP | QSIVYKYMSI | ||||
RSDRSVPSDI | FQIQATTIYA | NTINTFRIKS | GNENGEFYLR | QTSPVSAMLV | ||||
LVKSLSGPRE | HIVDLEMLTV | SSIGTFRTSS | VLRLTIIVGP | FSF |
Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Lecka-Czernik B., Lumpkin C.K. Jr., Goldstein S. (1995). An overexpressed gene transcript in senescent and quiescent human fibroblasts encoding a novel protein in the epidermal growth factor-like repeat family stimulates DNA synthesis. Mol. Cell. Biol. 15: 120—128. PMID 7799918 DOI:10.1128/MCB.15.1.120
- Ikegawa S., Toda T., Okui K., Nakamura Y. (1996). Structure and chromosomal assignment of the human S1-5 gene (FBNL) that is highly homologous to fibrillin. Genomics. 35: 590—592. PMID 8812496 DOI:10.1006/geno.1996.0402
- Giltay R., Timpl R., Kostka G. (1999). Sequence, recombinant expression and tissue localization of two novel extracellular matrix proteins, fibulin-3 and fibulin-4. Matrix Biol. 18: 469—480. PMID 10601734 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00038-4
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Klenotic P.A., Munier F.L., Marmorstein L.Y., Anand-Apte B. (2004). Tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) is a binding partner of epithelial growth factor-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 (EFEMP1). Implications for macular degenerations. J. Biol. Chem. 279: 30469—30473. PMID 15123717 DOI:10.1074/jbc.M403026200
- Hu B., Thirtamara-Rajamani K.K., Sim H., Viapiano M.S. (2009). Fibulin-3 is uniquely upregulated in malignant gliomas and promotes tumor cell motility and invasion. Mol. Cancer Res. 7: 1756—1770. PMID 19887559 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-09-0207
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3218 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EFEMP1 angl EGF containing fibulin like extracellular matrix protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 493 aminokislot a molekulyarna masa 54 641 EFEMP1IdentifikatoriSimvoliEFEMP1 DHRD DRAD FBLN3 FBNL FIBL 3 MLVT MTLV S1 5 EGF containing fibulin like extracellular matrix protein 1 EGF containing fibulin extracellular matrix protein 1Zovnishni ID OMIM 601548 MGI 1339998 HomoloGene 3028 GeneCards EFEMP1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding epidermal growth factor receptor binding GO 0008313 epidermal growth factor activated receptor activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding growth factor activity extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya ekzosoma mizhklitinnij prostir extracellular region collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated epidermal growth factor receptor signaling pathway embryonic eye morphogenesis post embryonic eye morphogenesis negative regulation of chondrocyte differentiation peptidyl tyrosine phosphorylation camera type eye development zir regulation of signaling receptor activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2202 216616Ensembl ENSG00000115380 ENSMUSG00000020467UniProt Q12805 Q8BPB5RefSeq mRNK NM 001039348 NM 001039349 NM 004105 NM 018894NM 146015RefSeq bilok NP 001034437 NP 001034438NP 666127Lokus UCSC Hr 2 55 87 55 92 MbHr 11 28 8 28 88 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLKALFLTMLTLALVKSQDTEETITYTQCTDGYEWDPVRQQCKDIDECDI VPDACKGGMKCVNHYGGYLCLPKTAQIIVNNEQPQQETQPAEGTSGATTG VVAASSMATSGVLPGGGFVASAAAVAGPEMQTGRNNFVIRRNPADPQRIP SNPSHRIQCAAGYEQSEHNVCQDIDECTAGTHNCRADQVCINLRGSFACQ CPPGYQKRGEQCVDIDECTIPPYCHQRCVNTPGSFYCQCSPGFQLAANNY TCVDINECDASNQCAQQCYNILGSFICQCNQGYELSSDRLNCEDIDECRT SSYLCQYQCVNEPGKFSCMCPQGYQVVRSRTCQDINECETTNECREDEMC WNYHGGFRCYPRNPCQDPYILTPENRCVCPVSNAMCRELPQSIVYKYMSI RSDRSVPSDIFQIQATTIYANTINTFRIKSGNENGEFYLRQTSPVSAMLV LVKSLSGPREHIVDLEMLTVSSIGTFRTSSVLRLTIIVGPFSF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do faktoriv rostu Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaLecka Czernik B Lumpkin C K Jr Goldstein S 1995 An overexpressed gene transcript in senescent and quiescent human fibroblasts encoding a novel protein in the epidermal growth factor like repeat family stimulates DNA synthesis Mol Cell Biol 15 120 128 PMID 7799918 DOI 10 1128 MCB 15 1 120 Ikegawa S Toda T Okui K Nakamura Y 1996 Structure and chromosomal assignment of the human S1 5 gene FBNL that is highly homologous to fibrillin Genomics 35 590 592 PMID 8812496 DOI 10 1006 geno 1996 0402 Giltay R Timpl R Kostka G 1999 Sequence recombinant expression and tissue localization of two novel extracellular matrix proteins fibulin 3 and fibulin 4 Matrix Biol 18 469 480 PMID 10601734 DOI 10 1016 S0945 053X 99 00038 4 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Klenotic P A Munier F L Marmorstein L Y Anand Apte B 2004 Tissue inhibitor of metalloproteinases 3 TIMP 3 is a binding partner of epithelial growth factor containing fibulin like extracellular matrix protein 1 EFEMP1 Implications for macular degenerations J Biol Chem 279 30469 30473 PMID 15123717 DOI 10 1074 jbc M403026200 Hu B Thirtamara Rajamani K K Sim H Viapiano M S 2009 Fibulin 3 is uniquely upregulated in malignant gliomas and promotes tumor cell motility and invasion Mol Cancer Res 7 1756 1770 PMID 19887559 DOI 10 1158 1541 7786 MCR 09 0207PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 3218 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 listopada 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi