OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135.
OPN1SW | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
тританопія | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 128.77 – 128.78 Mb | Хр. 6: 29.38 – 29.39 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRKMSEEEFY | LFKNISSVGP | WDGPQYHIAP | VWAFYLQAAF | MGTVFLIGFP | ||||
LNAMVLVATL | RYKKLRQPLN | YILVNVSFGG | FLLCIFSVFP | VFVASCNGYF | ||||
VFGRHVCALE | GFLGTVAGLV | TGWSLAFLAF | ERYIVICKPF | GNFRFSSKHA | ||||
LTVVLATWTI | GIGVSIPPFF | GWSRFIPEGL | QCSCGPDWYT | VGTKYRSESY | ||||
TWFLFIFCFI | VPLSLICFSY | TQLLRALKAV | AAQQQESATT | QKAEREVSRM | ||||
VVVMVGSFCV | CYVPYAAFAM | YMVNNRNHGL | DLRLVTIPSF | FSKSACIYNP | ||||
IIYCFMNKQF | QACIMKMVCG | KAMTDESDTC | SSQKTEVSTV | SSTQVGPN |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, , фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.
Література
- Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments. Science. 232: 193—202. PMID 2937147 DOI:10.1126/science.2937147
- Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes. J. Mol. Evol. 44: 378—382. PMID 9089077 DOI:10.1007/PL00006157
- Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity. Science. 244: 331—334. PMID 2565599 DOI:10.1126/science.2565599
- Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments. Vision Res. 26: 1881—1895. PMID 3303660 DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
- Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment. Am. J. Hum. Genet. 51: 444—446. PMID 1386496
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з OPN1SW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
OPN1SW angl Opsin 1 short wave sensitive bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 348 aminokislot a molekulyarna masa 39 135 OPN1SWNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1KPNIdentifikatoriSimvoliOPN1SW BCP BOP CBT opsin 1 cone pigments short wave sensitive opsin 1 short wave sensitiveZovnishni ID OMIM 613522 MGI 99438 HomoloGene 1291 GeneCards OPN1SWPov yazani genetichni zahvoryuvannyatritanopiya Ontologiya genaMolekulyarna funkciya G protein coupled receptor activity photoreceptor activity signal transducer activity G protein coupled photoreceptor activity signaling receptor activityKlitinna komponenta integral component of membrane integral component of plasma membrane membrana photoreceptor outer segment photoreceptor disc membraneBiologichnij proces vidpovid na stimul GO 0072468 signalna transdukciya zir retinoid metabolic process phototransduction detection of visible light G protein coupled receptor signaling pathway cellular response to light stimulusDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez611 12057Ensembl ENSG00000128617 ENSMUSG00000058831UniProt P03999 P51491RefSeq mRNK NM 001708 NM 001385125NM 007538RefSeq bilok NP 001699NP 031564Lokus UCSC Hr 7 128 77 128 78 MbHr 6 29 38 29 39 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRKMSEEEFYLFKNISSVGPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFMGTVFLIGFP LNAMVLVATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYF VFGRHVCALEGFLGTVAGLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHA LTVVLATWTIGIGVSIPPFFGWSRFIPEGLQCSCGPDWYTVGTKYRSESY TWFLFIFCFIVPLSLICFSYTQLLRALKAVAAQQQESATTQKAEREVSRM VVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGLDLRLVTIPSFFSKSACIYNP IIYCFMNKQFQACIMKMVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTVSSTQVGPN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv g bilokspryazhenih receptoriv fosfoproteyiniv Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z hromoforom Lokalizovanij u membrani LiteraturaNathans J Thomas D Hogness D S 1986 Molecular genetics of human color vision the genes encoding blue green and red pigments Science 232 193 202 PMID 2937147 DOI 10 1126 science 2937147 Shimmin L C Mai P Li W H 1997 Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes J Mol Evol 44 378 382 PMID 9089077 DOI 10 1007 PL00006157 Sarkar G Sommer S S 1989 Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity Science 244 331 334 PMID 2565599 DOI 10 1126 science 2565599 Applebury M L Hargrave P A 1986 Molecular biology of the visual pigments Vision Res 26 1881 1895 PMID 3303660 DOI 10 1016 0042 6989 86 90115 X Weitz C J Went L N Nathans J 1992 Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue sensitive visual pigment Am J Hum Genet 51 444 446 PMID 1386496PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z OPN1SW pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 1 kvitnya 2016 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 travnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi