LAMC1 (англ. Laminin subunit gamma 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 609 амінокислот, а молекулярна маса — 177 603.
LAMC1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LAMC1, LAMB2, Laminin, gamma 1, laminin subunit gamma 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 150290 MGI: 99914 HomoloGene: 1724 GeneCards: LAMC1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
колоректальний рак | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 183.02 – 183.15 Mb | Хр. 1: 153.09 – 153.21 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRGSHRAAPA | LRPRGRLWPV | LAVLAAAAAA | GCAQAAMDEC | TDEGGRPQRC | ||||
MPEFVNAAFN | VTVVATNTCG | TPPEEYCVQT | GVTGVTKSCH | LCDAGQPHLQ | ||||
HGAAFLTDYN | NQADTTWWQS | QTMLAGVQYP | SSINLTLHLG | KAFDITYVRL | ||||
KFHTSRPESF | AIYKRTREDG | PWIPYQYYSG | SCENTYSKAN | RGFIRTGGDE | ||||
QQALCTDEFS | DISPLTGGNV | AFSTLEGRPS | AYNFDNSPVL | QEWVTATDIR | ||||
VTLNRLNTFG | DEVFNDPKVL | KSYYYAISDF | AVGGRCKCNG | HASECMKNEF | ||||
DKLVCNCKHN | TYGVDCEKCL | PFFNDRPWRR | ATAESASECL | PCDCNGRSQE | ||||
CYFDPELYRS | TGHGGHCTNC | QDNTDGAHCE | RCRENFFRLG | NNEACSSCHC | ||||
SPVGSLSTQC | DSYGRCSCKP | GVMGDKCDRC | QPGFHSLTEA | GCRPCSCDPS | ||||
GSIDECNIET | GRCVCKDNVE | GFNCERCKPG | FFNLESSNPR | GCTPCFCFGH | ||||
SSVCTNAVGY | SVYSISSTFQ | IDEDGWRAEQ | RDGSEASLEW | SSERQDIAVI | ||||
SDSYFPRYFI | APAKFLGKQV | LSYGQNLSFS | FRVDRRDTRL | SAEDLVLEGA | ||||
GLRVSVPLIA | QGNSYPSETT | VKYVFRLHEA | TDYPWRPALT | PFEFQKLLNN | ||||
LTSIKIRGTY | SERSAGYLDD | VTLASARPGP | GVPATWVESC | TCPVGYGGQF | ||||
CEMCLSGYRR | ETPNLGPYSP | CVLCACNGHS | ETCDPETGVC | NCRDNTAGPH | ||||
CEKCSDGYYG | DSTAGTSSDC | QPCPCPGGSS | CAVVPKTKEV | VCTNCPTGTT | ||||
GKRCELCDDG | YFGDPLGRNG | PVRLCRLCQC | SDNIDPNAVG | NCNRLTGECL | ||||
KCIYNTAGFY | CDRCKDGFFG | NPLAPNPADK | CKACNCNLYG | TMKQQSSCNP | ||||
VTGQCECLPH | VTGQDCGACD | PGFYNLQSGQ | GCERCDCHAL | GSTNGQCDIR | ||||
TGQCECQPGI | TGQHCERCEV | NHFGFGPEGC | KPCDCHPEGS | LSLQCKDDGR | ||||
CECREGFVGN | RCDQCEENYF | YNRSWPGCQE | CPACYRLVKD | KVADHRVKLQ | ||||
ELESLIANLG | TGDEMVTDQA | FEDRLKEAER | EVMDLLREAQ | DVKDVDQNLM | ||||
DRLQRVNNTL | SSQISRLQNI | RNTIEETGNL | AEQARAHVEN | TERLIEIASR | ||||
ELEKAKVAAA | NVSVTQPEST | GDPNNMTLLA | EEARKLAERH | KQEADDIVRV | ||||
AKTANDTSTE | AYNLLLRTLA | GENQTAFEIE | ELNRKYEQAK | NISQDLEKQA | ||||
ARVHEEAKRA | GDKAVEIYAS | VAQLSPLDSE | TLENEANNIK | MEAENLEQLI | ||||
DQKLKDYEDL | REDMRGKELE | VKNLLEKGKT | EQQTADQLLA | RADAAKALAE | ||||
EAAKKGRDTL | QEANDILNNL | KDFDRRVNDN | KTAAEEALRK | IPAINQTITE | ||||
ANEKTREAQQ | ALGSAAADAT | EAKNKAHEAE | RIASAVQKNA | TSTKAEAERT | ||||
FAEVTDLDNE | VNNMLKQLQE | AEKELKRKQD | DADQDMMMAG | MASQAAQEAE | ||||
INARKAKNSV | TSLLSIINDL | LEQLGQLDTV | DLNKLNEIEG | TLNKAKDEMK | ||||
VSDLDRKVSD | LENEAKKQEA | AIMDYNRDIE | EIMKDIRNLE | DIRKTLPSGC | ||||
FNTPSIEKP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Santos C.L.S., Sabbaga J., Brentani R. (1991). Differences in human laminin B2 sequences. DNA Seq. 1: 275—277. PMID 1806043 DOI:10.3109/10425179109020782
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Pikkarainen T., Kallunki T., Tryggvason K. (1988). Human laminin B2 chain. Comparison of the complete amino acid sequence with the B1 chain reveals variability in sequence homology between different structural domains. J. Biol. Chem. 263: 6751—6758. PMID 3360804
- Kallunki T., Ikonen J., Chow L.T., Kallunki P., Tryggvason K. (1991). Structure of the human laminin B2 chain gene reveals extensive divergence from the laminin B1 chain gene. J. Biol. Chem. 266: 221—228. PMID 1985895
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з LAMC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6492 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
LAMC1 angl Laminin subunit gamma 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 609 aminokislot a molekulyarna masa 177 603 LAMC1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1KLO 1NPE 1TLE 4AQTIdentifikatoriSimvoliLAMC1 LAMB2 Laminin gamma 1 laminin subunit gamma 1Zovnishni ID OMIM 150290 MGI 99914 HomoloGene 1724 GeneCards LAMC1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyakolorektalnij rak Ontologiya genaMolekulyarna funkciya extracellular matrix structural constituent extracellular matrix constituent conferring elasticityKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region bazalna membrana laminin 1 complex ekzosoma laminin 10 complex laminin 11 complex mizhklitinnij prostir endoplasmic reticulum lumen collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces hemidesmosome assembly substrate adhesion dependent cell spreading endoderm development adgeziya klitin extracellular matrix organization cell migration positive regulation of epithelial cell proliferation extracellular matrix disassembly posttranslyacijna modifikaciya GO 0034622 protein containing complex assembly animal organ morphogenesis gistogenez organism system development basement membrane assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3915 226519Ensembl ENSG00000135862 ENSMUSG00000026478UniProt P11047 P02468RefSeq mRNK NM 002293NM 010683RefSeq bilok NP 002284n dLokus UCSC Hr 1 183 02 183 15 MbHr 1 153 09 153 21 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRC MPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQ HGAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRL KFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDE QQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIR VTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQE CYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHC SPVGSLSTQCDSYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPS GSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGH SSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVI SDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNN LTSIKIRGTYSERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQF CEMCLSGYRRETPNLGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPH CEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTT GKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECL KCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQSSCNP VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIR TGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGR CECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQ ELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLM DRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASR ELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQA ARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLI DQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAE EAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITE ANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERT FAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMK VSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGC FNTPSIEKP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya polimorfizm Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi bazalnij membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaSantos C L S Sabbaga J Brentani R 1991 Differences in human laminin B2 sequences DNA Seq 1 275 277 PMID 1806043 DOI 10 3109 10425179109020782 Zhang H Li X J Martin D B Aebersold R 2003 Identification and quantification of N linked glycoproteins using hydrazide chemistry stable isotope labeling and mass spectrometry Nat Biotechnol 21 660 666 PMID 12754519 DOI 10 1038 nbt827 Pikkarainen T Kallunki T Tryggvason K 1988 Human laminin B2 chain Comparison of the complete amino acid sequence with the B1 chain reveals variability in sequence homology between different structural domains J Biol Chem 263 6751 6758 PMID 3360804 Kallunki T Ikonen J Chow L T Kallunki P Tryggvason K 1991 Structure of the human laminin B2 chain gene reveals extensive divergence from the laminin B1 chain gene J Biol Chem 266 221 228 PMID 1985895PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z LAMC1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6492 angl Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 sichnya 2018 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi