NLRC5 (англ. NLR family CARD domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 866 амінокислот, а молекулярна маса — 204 595.
NLRC5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NLRC5, CLR16.1, NOD27, NOD4, NLR family, CARD domain containing 5, NLR family CARD domain containing 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 613537 MGI: 3612191 HomoloGene: 88935 GeneCards: NLRC5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
шизофренія, біполярний афективний розлад | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 56.99 – 57.08 Mb | Хр. 8: 95.16 – 95.25 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDPVGLQLGN | KNLWSCLVRL | LTKDPEWLNA | KMKFFLPNTD | LDSRNETLDP | ||||
EQRVILQLNK | LHVQGSDTWQ | SFIHCVCMQL | EVPLDLEVLL | LSTFGYDDGF | ||||
TSQLGAEGKS | QPESQLHHGL | KRPHQSCGSS | PRRKQCKKQQ | LELAKKYLQL | ||||
LRTSAQQRYR | SQIPGSGQPH | AFHQVYVPPI | LRRATASLDT | PEGAIMGDVK | ||||
VEDGADVSIS | DLFNTRVNKG | PRVTVLLGKA | GMGKTTLAHR | LCQKWAEGHL | ||||
NCFQALFLFE | FRQLNLITRF | LTPSELLFDL | YLSPESDHDT | VFQYLEKNAD | ||||
QVLLIFDGLD | EALQPMGPDG | PGPVLTLFSH | LCNGTLLPGC | RVMATSRPGK | ||||
LPACLPAEAA | MVHMLGFDGP | RVEEYVNHFF | SAQPSREGAL | VELQTNGRLR | ||||
SLCAVPALCQ | VACLCLHHLL | PDHAPGQSVA | LLPNMTQLYM | QMVLALSPPG | ||||
HLPTSSLLDL | GEVALRGLET | GKVIFYAKDI | APPLIAFGAT | HSLLTSFCVC | ||||
TGPGHQQTGY | AFTHLSLQEF | LAALHLMASP | KVNKDTLTQY | VTLHSRWVQR | ||||
TKARLGLSDH | LPTFLAGLAS | CTCRPFLSHL | AQGNEDCVGA | KQAAVVQVLK | ||||
KLATRKLTGP | KVVELCHCVD | ETQEPELASL | TAQSLPYQLP | FHNFPLTCTD | ||||
LATLTNILEH | REAPIHLDFD | GCPLEPHCPE | ALVGCGQIEN | LSFKSRKCGD | ||||
AFAEALSRSL | PTMGRLQMLG | LAGSKITARG | ISHLVKALPL | CPQLKEVSFR | ||||
DNQLSDQVVL | NIVEVLPHLP | RLRKLDLSSN | SICVSTLLCL | ARVAVTCPTV | ||||
RMLQAREADL | IFLLSPPTET | TAELQRAPDL | QESDGQRKGA | QSRSLTLRLQ | ||||
KCQLQVHDAE | ALIALLQEGP | HLEEVDLSGN | QLEDEGCRLM | AEAASQLHIA | ||||
RKLDLSNNGL | SVAGVHCVLR | AVSACWTLAE | LHISLQHKTV | IFMFAQEPEE | ||||
QKGPQERAAF | LDSLMLQMPS | ELPLSSRRMR | LTHCGLQEKH | LEQLCKALGG | ||||
SCHLGHLHLD | FSGNALGDEG | AARLAQLLPG | LGALQSLNLS | ENGLSLDAVL | ||||
GLVRCFSTLQ | WLFRLDISFE | SQHILLRGDK | TSRDMWATGS | LPDFPAAAKF | ||||
LGFRQRCIPR | SLCLSECPLE | PPSLTRLCAT | LKDCPGPLEL | QLSCEFLSDQ | ||||
SLETLLDCLP | QLPQLSLLQL | SQTGLSPKSP | FLLANTLSLC | PRVKKVDLRS | ||||
LHHATLHFRS | NEEEEGVCCG | RFTGCSLSQE | HVESLCWLLS | KCKDLSQVDL | ||||
SANLLGDSGL | RCLLECLPQV | PISGLLDLSH | NSISQESALY | LLETLPSCPR | ||||
VREASVNLGS | EQSFRIHFSR | EDQAGKTLRL | SECSFRPEHV | SRLATGLSKS | ||||
LQLTELTLTQ | CCLGQKQLAI | LLSLVGRPAG | LFSLRVQEPW | ADRARVLSLL | ||||
EVCAQASGSV | TEISISETQQ | QLCVQLEFPR | QEENPEAVAL | RLAHCDLGAH | ||||
HSLLVGQLME | TCARLQQLSL | SQVNLCEDDD | ASSLLLQSLL | LSLSELKTFR | ||||
LTSSCVSTEG | LAHLASGLGH | CHHLEELDLS | NNQFDEEGTK | ALMRALEGKW | ||||
MLKRLDLSHL | LLNSSTLALL | THRLSQMTCL | QSLRLNRNSI | GDVGCCHLSE | ||||
ALRAATSLEE | LDLSHNQIGD | AGVQHLATIL | PGLPELRKID | LSGNSISSAG | ||||
GVQLAESLVL | CRRLEELMLG | CNALGDPTAL | GLAQELPQHL | RVLHLPFSHL | ||||
GPGGALSLAQ | ALDGSPHLEE | ISLAENNLAG | GVLRFCMELP | LLRQIDLVSC | ||||
KIDNQTAKLL | TSSFTSCPAL | EVILLSWNLL | GDEAAAELAQ | VLPQMGRLKR | ||||
VDLEKNQITA | LGAWLLAEGL | AQGSSIQVIR | LWNNPIPCDM | AQHLKSQEPR | ||||
LDFAFFDNQP | QAPWGT |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases. Annu. Rev. Immunol. 23: 387—414. PMID 15771576 DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NLRC5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29933 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NLRC5 angl NLR family CARD domain containing 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 866 aminokislot a molekulyarna masa 204 595 NLRC5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2MJMIdentifikatoriSimvoliNLRC5 CLR16 1 NOD27 NOD4 NLR family CARD domain containing 5 NLR family CARD domain containing 5Zovnishni ID OMIM 613537 MGI 3612191 HomoloGene 88935 GeneCards NLRC5Pov yazani genetichni zahvoryuvannyashizofreniya bipolyarnij afektivnij rozlad Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ATP binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta citoplazma centrosoma klitinne yadro gialoplazmaBiologichnij proces positive regulation of type I interferon mediated signaling pathway negative regulation of type I interferon production positive regulation of interferon gamma mediated signaling pathway positive regulation of MHC class I biosynthetic process GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of kinase activity proces imunnoyi sistemi vrodzhenij imunitet negative regulation of NF kappaB transcription factor activity negative regulation of type I interferon mediated signaling pathway response to bacterium GO 0007243 intracellular signal transductionDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez84166 434341Ensembl ENSG00000140853 ENSMUSG00000074151UniProt Q86WI3 C3VPR6RefSeq mRNK NM 032206 NM 001330552NM 001033207RefSeq bilok NP 001317481 NP 115582NP 001028379Lokus UCSC Hr 16 56 99 57 08 MbHr 8 95 16 95 25 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDPVGLQLGNKNLWSCLVRLLTKDPEWLNAKMKFFLPNTDLDSRNETLDP EQRVILQLNKLHVQGSDTWQSFIHCVCMQLEVPLDLEVLLLSTFGYDDGF TSQLGAEGKSQPESQLHHGLKRPHQSCGSSPRRKQCKKQQLELAKKYLQL LRTSAQQRYRSQIPGSGQPHAFHQVYVPPILRRATASLDTPEGAIMGDVK VEDGADVSISDLFNTRVNKGPRVTVLLGKAGMGKTTLAHRLCQKWAEGHL NCFQALFLFEFRQLNLITRFLTPSELLFDLYLSPESDHDTVFQYLEKNAD QVLLIFDGLDEALQPMGPDGPGPVLTLFSHLCNGTLLPGCRVMATSRPGK LPACLPAEAAMVHMLGFDGPRVEEYVNHFFSAQPSREGALVELQTNGRLR SLCAVPALCQVACLCLHHLLPDHAPGQSVALLPNMTQLYMQMVLALSPPG HLPTSSLLDLGEVALRGLETGKVIFYAKDIAPPLIAFGATHSLLTSFCVC TGPGHQQTGYAFTHLSLQEFLAALHLMASPKVNKDTLTQYVTLHSRWVQR TKARLGLSDHLPTFLAGLASCTCRPFLSHLAQGNEDCVGAKQAAVVQVLK KLATRKLTGPKVVELCHCVDETQEPELASLTAQSLPYQLPFHNFPLTCTD LATLTNILEHREAPIHLDFDGCPLEPHCPEALVGCGQIENLSFKSRKCGD AFAEALSRSLPTMGRLQMLGLAGSKITARGISHLVKALPLCPQLKEVSFR DNQLSDQVVLNIVEVLPHLPRLRKLDLSSNSICVSTLLCLARVAVTCPTV RMLQAREADLIFLLSPPTETTAELQRAPDLQESDGQRKGAQSRSLTLRLQ KCQLQVHDAEALIALLQEGPHLEEVDLSGNQLEDEGCRLMAEAASQLHIA RKLDLSNNGLSVAGVHCVLRAVSACWTLAELHISLQHKTVIFMFAQEPEE QKGPQERAAFLDSLMLQMPSELPLSSRRMRLTHCGLQEKHLEQLCKALGG SCHLGHLHLDFSGNALGDEGAARLAQLLPGLGALQSLNLSENGLSLDAVL GLVRCFSTLQWLFRLDISFESQHILLRGDKTSRDMWATGSLPDFPAAAKF LGFRQRCIPRSLCLSECPLEPPSLTRLCATLKDCPGPLELQLSCEFLSDQ SLETLLDCLPQLPQLSLLQLSQTGLSPKSPFLLANTLSLCPRVKKVDLRS LHHATLHFRSNEEEEGVCCGRFTGCSLSQEHVESLCWLLSKCKDLSQVDL SANLLGDSGLRCLLECLPQVPISGLLDLSHNSISQESALYLLETLPSCPR VREASVNLGSEQSFRIHFSREDQAGKTLRLSECSFRPEHVSRLATGLSKS LQLTELTLTQCCLGQKQLAILLSLVGRPAGLFSLRVQEPWADRARVLSLL EVCAQASGSVTEISISETQQQLCVQLEFPRQEENPEAVALRLAHCDLGAH HSLLVGQLMETCARLQQLSLSQVNLCEDDDASSLLLQSLLLSLSELKTFR LTSSCVSTEGLAHLASGLGHCHHLEELDLSNNQFDEEGTKALMRALEGKW MLKRLDLSHLLLNSSTLALLTHRLSQMTCLQSLRLNRNSIGDVGCCHLSE ALRAATSLEELDLSHNQIGDAGVQHLATILPGLPELRKIDLSGNSISSAG GVQLAESLVLCRRLEELMLGCNALGDPTALGLAQELPQHLRVLHLPFSHL GPGGALSLAQALDGSPHLEEISLAENNLAGGVLRFCMELPLLRQIDLVSC KIDNQTAKLLTSSFTSCPALEVILLSWNLLGDEAAAELAQVLPQMGRLKR VDLEKNQITALGAWLLAEGLAQGSSIQVIRLWNNPIPCDMAQHLKSQEPR LDFAFFDNQPQAPWGT A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Ting J P Y Davis B K 2005 CATERPILLER a novel gene family important in immunity cell death and diseases Annu Rev Immunol 23 387 414 PMID 15771576 DOI 10 1146 annurev immunol 23 021704 115616PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z NLRC5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 29933 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 10 listopada 2012 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi