CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528.
CDH5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 66.37 – 66.4 Mb | Хр. 8: 104.83 – 104.87 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQRLMMLLAT | SGACLGLLAV | AAVAAAGANP | AQRDTHSLLP | THRRQKRDWI | ||||
WNQMHIDEEK | NTSLPHHVGK | IKSSVSRKNA | KYLLKGEYVG | KVFRVDAETG | ||||
DVFAIERLDR | ENISEYHLTA | VIVDKDTGEN | LETPSSFTIK | VHDVNDNWPV | ||||
FTHRLFNASV | PESSAVGTSV | ISVTAVDADD | PTVGDHASVM | YQILKGKEYF | ||||
AIDNSGRIIT | ITKSLDREKQ | ARYEIVVEAR | DAQGLRGDSG | TATVLVTLQD | ||||
INDNFPFFTQ | TKYTFVVPED | TRVGTSVGSL | FVEDPDEPQN | RMTKYSILRG | ||||
DYQDAFTIET | NPAHNEGIIK | PMKPLDYEYI | QQYSFIVEAT | DPTIDLRYMS | ||||
PPAGNRAQVI | INITDVDEPP | IFQQPFYHFQ | LKENQKKPLI | GTVLAMDPDA | ||||
ARHSIGYSIR | RTSDKGQFFR | VTKKGDIYNE | KELDREVYPW | YNLTVEAKEL | ||||
DSTGTPTGKE | SIVQVHIEVL | DENDNAPEFA | KPYQPKVCEN | AVHGQLVLQI | ||||
SAIDKDITPR | NVKFKFILNT | ENNFTLTDNH | DNTANITVKY | GQFDREHTKV | ||||
HFLPVVISDN | GMPSRTGTST | LTVAVCKCNE | QGEFTFCEDM | AAQVGVSIQA | ||||
VVAILLCILT | ITVITLLIFL | RRRLRKQARA | HGKSVPEIHE | QLVTYDEEGG | ||||
GEMDTTSYDV | SVLNSVRRGG | AKPPRPALDA | RPSLYAQVQK | PPRHAPGAHG | ||||
GPGEMAAMIE | VKKDEADHDG | DGPPYDTLHI | YGYEGSESIA | ESLSSLGTDS | ||||
SDSDVDYDFL | NDWGPRFKML | AELYGSDPRE | ELLY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
- Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CDH5 angl Cadherin 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 784 aminokislot a molekulyarna masa 87 528 CDH5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2KOHIdentifikatoriSimvoliCDH5 7B4 CD144 VE cadherin cadherin 5Zovnishni ID OMIM 601120 MGI 105057 HomoloGene 1359 GeneCards CDH5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding beta catenin binding transmembrane transporter binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein phosphatase binding signaling receptor binding cytoskeletal protein binding protein homodimerization activity cadherin binding vascular endothelial growth factor receptor 2 bindingKlitinna komponenta integral component of membrane membrana cell cell junction bicellular tight junction Adgezivni kontakti cell surface mizhklitinni kontakti external side of plasma membrane cell periphery klitinna membrana catenin complexBiologichnij proces positive regulation of establishment of endothelial barrier adgeziya klitin cell cell junction assembly adherens junction organization transforming growth factor beta receptor signaling pathway regulation of establishment of cell polarity negative regulation of cell population proliferation homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules blood vessel maturation cell cell adhesion negative regulation of inflammatory response positive regulation of angiogenesis calcium dependent cell cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules cell cell adhesion mediated by cadherin GO 0000767 cell morphogenesisDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1003 12562Ensembl ENSG00000179776 ENSMUSG00000031871UniProt P33151 P55284RefSeq mRNK NM 001114117 NM 001795NM 009868RefSeq bilok NP 001786NP 033998Lokus UCSC Hr 16 66 37 66 4 MbHr 8 104 83 104 87 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MQRLMMLLATSGACLGLLAVAAVAAAGANPAQRDTHSLLPTHRRQKRDWI WNQMHIDEEKNTSLPHHVGKIKSSVSRKNAKYLLKGEYVGKVFRVDAETG DVFAIERLDRENISEYHLTAVIVDKDTGENLETPSSFTIKVHDVNDNWPV FTHRLFNASVPESSAVGTSVISVTAVDADDPTVGDHASVMYQILKGKEYF AIDNSGRIITITKSLDREKQARYEIVVEARDAQGLRGDSGTATVLVTLQD INDNFPFFTQTKYTFVVPEDTRVGTSVGSLFVEDPDEPQNRMTKYSILRG DYQDAFTIETNPAHNEGIIKPMKPLDYEYIQQYSFIVEATDPTIDLRYMS PPAGNRAQVIINITDVDEPPIFQQPFYHFQLKENQKKPLIGTVLAMDPDA ARHSIGYSIRRTSDKGQFFRVTKKGDIYNEKELDREVYPWYNLTVEAKEL DSTGTPTGKESIVQVHIEVLDENDNAPEFAKPYQPKVCENAVHGQLVLQI SAIDKDITPRNVKFKFILNTENNFTLTDNHDNTANITVKYGQFDREHTKV HFLPVVISDNGMPSRTGTSTLTVAVCKCNEQGEFTFCEDMAAQVGVSIQA VVAILLCILTITVITLLIFLRRRLRKQARAHGKSVPEIHEQLVTYDEEGG GEMDTTSYDVSVLNSVRRGGAKPPRPALDARPSLYAQVQKPPRHAPGAHG GPGEMAAMIEVKKDEADHDGDGPPYDTLHIYGYEGSESIAESLSSLGTDS SDSDVDYDFLNDWGPRFKMLAELYGSDPREELLY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah LiteraturaShimoyama Y Tsujimoto G Kitajima M Natori M 2000 Identification of three human type II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type II classic cadherins Biochem J 349 159 167 PMID 10861224 DOI 10 1042 0264 6021 3490159 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Ali J Liao F Martens E Muller W A 1997 Vascular endothelial cadherin VE cadherin cloning and role in endothelial cell cell adhesion Microcirculation 4 267 277 PMID 9219219 Suzuki S Sano K Tanihara H 1991 Diversity of the cadherin family evidence for eight new cadherins in nervous tissue Cell Regul 2 261 270 PMID 2059658PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1764 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 10 kvitnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi