PMS1 (англ. PMS1 homolog 1, mismatch repair system component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 932 амінокислот, а молекулярна маса — 105 830.
PMS1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PMS1, HNPCC3, PMSL1, hMLH2, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600258 MGI: 1202302 HomoloGene: 449 GeneCards: PMS1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 189.78 – 189.88 Mb | Хр. 1: 53.23 – 53.34 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKQLPAATVR | LLSSSQIITS | VVSVVKELIE | NSLDAGATSV | DVKLENYGFD | ||||
KIEVRDNGEG | IKAVDAPVMA | MKYYTSKINS | HEDLENLTTY | GFRGEALGSI | ||||
CCIAEVLITT | RTAADNFSTQ | YVLDGSGHIL | SQKPSHLGQG | TTVTALRLFK | ||||
NLPVRKQFYS | TAKKCKDEIK | KIQDLLMSFG | ILKPDLRIVF | VHNKAVIWQK | ||||
SRVSDHKMAL | MSVLGTAVMN | NMESFQYHSE | ESQIYLSGFL | PKCDADHSFT | ||||
SLSTPERSFI | FINSRPVHQK | DILKLIRHHY | NLKCLKESTR | LYPVFFLKID | ||||
VPTADVDVNL | TPDKSQVLLQ | NKESVLIALE | NLMTTCYGPL | PSTNSYENNK | ||||
TDVSAADIVL | SKTAETDVLF | NKVESSGKNY | SNVDTSVIPF | QNDMHNDESG | ||||
KNTDDCLNHQ | ISIGDFGYGH | CSSEISNIDK | NTKNAFQDIS | MSNVSWENSQ | ||||
TEYSKTCFIS | SVKHTQSENG | NKDHIDESGE | NEEEAGLENS | SEISADEWSR | ||||
GNILKNSVGE | NIEPVKILVP | EKSLPCKVSN | NNYPIPEQMN | LNEDSCNKKS | ||||
NVIDNKSGKV | TAYDLLSNRV | IKKPMSASAL | FVQDHRPQFL | IENPKTSLED | ||||
ATLQIEELWK | TLSEEEKLKY | EEKATKDLER | YNSQMKRAIE | QESQMSLKDG | ||||
RKKIKPTSAW | NLAQKHKLKT | SLSNQPKLDE | LLQSQIEKRR | SQNIKMVQIP | ||||
FSMKNLKINF | KKQNKVDLEE | KDEPCLIHNL | RFPDAWLMTS | KTEVMLLNPY | ||||
RVEEALLFKR | LLENHKLPAE | PLEKPIMLTE | SLFNGSHYLD | VLYKMTADDQ | ||||
RYSGSTYLSD | PRLTANGFKI | KLIPGVSITE | NYLEIEGMAN | CLPFYGVADL | ||||
KEILNAILNR | NAKEVYECRP | RKVISYLEGE | AVRLSRQLPM | YLSKEDIQDI | ||||
IYRMKHQFGN | EIKECVHGRP | FFHHLTYLPE | TT |
Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Leung W.K., Kim J.J., Wu L., Sepulveda J.L., Sepulveda A.R. (2000). Identification of a second MutL DNA mismatch repair complex (hPMS1 and hMLH1) in human epithelial cells. J. Biol. Chem. 275: 15728—15732. PMID 10748105 DOI:10.1074/jbc.M908768199
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PMS1 angl PMS1 homolog 1 mismatch repair system component bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 932 aminokislot a molekulyarna masa 105 830 PMS1Nayavni strukturiPDBPoshuk dlya lyudej PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2CS1IdentifikatoriSimvoliPMS1 HNPCC3 PMSL1 hMLH2 PMS1 homolog 1 mismatch repair system componentZovnishni ID OMIM 600258 MGI 1202302 HomoloGene 449 GeneCards PMS1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya single stranded DNA binding DNA binding ATP binding mismatched DNA binding ATPase activity enzyme bindingKlitinna komponenta MutLalpha complex klitinne yadro mismatch repair complexBiologichnij proces GO 0100026 Reparaciya DNK cellular response to DNA damage stimulus DNA mismatch repairDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5378 227099Ensembl ENSG00000064933 ENSMUSG00000026098UniProt P54277 Q5FBZ4 n dRefSeq mRNK NM 000534 NM 001128143 NM 001128144 NM 001289408 NM 001289409NM 001321044 NM 001321045 NM 001321046 NM 001321047 NM 001321048 NM 001321049 NM 001321051NM 153556RefSeq bilok NP 000525 NP 001121615 NP 001121616 NP 001276337 NP 001276338NP 001307973 NP 001307974 NP 001307975 NP 001307976 NP 001307977 NP 001307978 NP 001307980n dLokus UCSC Hr 2 189 78 189 88 MbHr 1 53 23 53 34 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLENYGFD KIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYYTSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSI CCIAEVLITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRLFK NLPVRKQFYSTAKKCKDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNKAVIWQK SRVSDHKMALMSVLGTAVMNNMESFQYHSEESQIYLSGFLPKCDADHSFT SLSTPERSFIFINSRPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFFLKID VPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNK TDVSAADIVLSKTAETDVLFNKVESSGKNYSNVDTSVIPFQNDMHNDESG KNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNAFQDISMSNVSWENSQ TEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEISADEWSR GNILKNSVGENIEPVKILVPEKSLPCKVSNNNYPIPEQMNLNEDSCNKKS NVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASALFVQDHRPQFLIENPKTSLED ATLQIEELWKTLSEEEKLKYEEKATKDLERYNSQMKRAIEQESQMSLKDG RKKIKPTSAWNLAQKHKLKTSLSNQPKLDELLQSQIEKRRSQNIKMVQIP FSMKNLKINFKKQNKVDLEEKDEPCLIHNLRFPDAWLMTSKTEVMLLNPY RVEEALLFKRLLENHKLPAEPLEKPIMLTESLFNGSHYLDVLYKMTADDQ RYSGSTYLSDPRLTANGFKIKLIPGVSITENYLEIEGMANCLPFYGVADL KEILNAILNRNAKEVYECRPRKVISYLEGEAVRLSRQLPMYLSKEDIQDI IYRMKHQFGNEIKECVHGRPFFHHLTYLPETT A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak poshkodzhennya DNK reparaciya DNK polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Leung W K Kim J J Wu L Sepulveda J L Sepulveda A R 2000 Identification of a second MutL DNA mismatch repair complex hPMS1 and hMLH1 in human epithelial cells J Biol Chem 275 15728 15732 PMID 10748105 DOI 10 1074 jbc M908768199PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 26 bereznya 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 3 zhovtnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi