Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
PTBP1 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 57 221.
| PTBP1 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | PTBP1, HNRNP-I, HNRNPI, HNRPI, PTB, PTB-1, PTB-T, PTB2, PTB3, PTB4, pPTB, polypyrimidine tract binding protein 1 | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 600693 MGI: 97791 HomoloGene: 49188 GeneCards: PTBP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
   | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 0.8 – 0.81 Mb | Хр. 10: 79.69 – 79.7 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | |||||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MDGIVPDIAV | GTKRGSDELF | STCVTNGPFI | MSSNSASAAN | GNDSKKFKGD | ||||
| SRSAGVPSRV | IHIRKLPIDV | TEGEVISLGL | PFGKVTNLLM | LKGKNQAFIE | ||||
| MNTEEAANTM | VNYYTSVTPV | LRGQPIYIQF | SNHKELKTDS | SPNQARAQAA | ||||
| LQAVNSVQSG | NLALAASAAA | VDAGMAMAGQ | SPVLRIIVEN | LFYPVTLDVL | ||||
| HQIFSKFGTV | LKIITFTKNN | QFQALLQYAD | PVSAQHAKLS | LDGQNIYNAC | ||||
| CTLRIDFSKL | TSLNVKYNND | KSRDYTRPDL | PSGDSQPSLD | QTMAAAFGLS | ||||
| VPNVHGALAP | LAIPSAAAAA | AAAGRIAIPG | LAGAGNSVLL | VSNLNPERVT | ||||
| PQSLFILFGV | YGDVQRVKIL | FNKKENALVQ | MADGNQAQLA | MSHLNGHKLH | ||||
| GKPIRITLSK | HQNVQLPREG | QEDQGLTKDY | GNSPLHRFKK | PGSKNFQNIF | ||||
| PPSATLHLSN | IPPSVSEEDL | KVLFSSNGGV | VKGFKFFQKD | RKMALIQMGS | ||||
| VEEAVQALID | LHNHDLGENH | HLRVSFSKST | I |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Gil A., Sharp P.A., Jamison S.F., Garcia-Blanco M.A. (1991). Characterization of cDNAs encoding the polypyrimidine tract-binding protein. Genes Dev. 5: 1224—1236. PMID 1906035 DOI:10.1101/gad.5.7.1224
- Patton J.G., Mayer S.A., Tempst P., Nadal-Ginard B. (1991). Characterization and molecular cloning of polypyrimidine tract-binding protein: a component of a complex necessary for pre-mRNA splicing. Genes Dev. 5: 1237—1251. PMID 1906036 DOI:10.1101/gad.5.7.1237
- Ghetti A., Pinol-Roma S., Michael W., Morandi C., Dreyfuss G. (1992). hnRNP I, the polypyrimidine tract-binding protein: distinct nuclear localization and association with hnRNAs. Nucleic Acids Res. 20: 3671—3678. PMID 1641332 DOI:10.1093/nar/20.14.3671
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lin J.C., Tarn W.Y. (2005). Exon selection in alpha-tropomyosin mRNA is regulated by the antagonistic action of RBM4 and PTB. Mol. Cell. Biol. 25: 10111—10121. PMID 16260624 DOI:10.1128/MCB.25.22.10111-10121.2005
- Lin J.C., Tarn W.Y. (2011). RBM4 down-regulates PTB and antagonizes its activity in muscle cell-specific alternative splicing. J. Cell Biol. 193: 509—520. PMID 21518792 DOI:10.1083/jcb.201007131
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9583 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PTBP1 angl Polypyrimidine tract binding protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 531 aminokislot a molekulyarna masa 57 221 PTBP1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1QM9 1SJQ 1SJR 2AD9 2ADB 2ADC 2EVZ 3ZZY 3ZZZIdentifikatoriSimvoliPTBP1 HNRNP I HNRNPI HNRPI PTB PTB 1 PTB T PTB2 PTB3 PTB4 pPTB polypyrimidine tract binding protein 1Zovnishni ID OMIM 600693 MGI 97791 HomoloGene 49188 GeneCards PTBP1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya pre mRNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding poly pyrimidine tract binding nucleic acid binding RNA bindingKlitinna komponenta yaderce ekzosoma membrana klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome mRNA processing negative regulation of mRNA splicing via spliceosome regulation of alternative mRNA splicing via spliceosome negative regulation of RNA splicing Splajsing RNK negative regulation of muscle cell differentiation fibroblast growth factor receptor signaling pathway IRES dependent viral translational initiation RNA metabolic process positive regulation of protein dephosphorylation positive regulation of calcineurin NFAT signaling cascadeDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5725 19205Ensembl ENSG00000011304 ENSMUSG00000006498UniProt P26599 P17225RefSeq mRNK NM 002819 NM 031990 NM 031991 NM 175847NM 001077363 NM 001283013 NM 008956RefSeq bilok NP 002810 NP 114367 NP 114368n dLokus UCSC Hr 19 0 8 0 81 MbHr 10 79 69 79 7 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDGIVPDIAVGTKRGSDELFSTCVTNGPFIMSSNSASAANGNDSKKFKGD SRSAGVPSRVIHIRKLPIDVTEGEVISLGLPFGKVTNLLMLKGKNQAFIE MNTEEAANTMVNYYTSVTPVLRGQPIYIQFSNHKELKTDSSPNQARAQAA LQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLRIIVENLFYPVTLDVL HQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQHAKLSLDGQNIYNAC CTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDYTRPDLPSGDSQPSLDQTMAAAFGLS VPNVHGALAPLAIPSAAAAAAAAGRIAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPERVT PQSLFILFGVYGDVQRVKILFNKKENALVQMADGNQAQLAMSHLNGHKLH GKPIRITLSKHQNVQLPREGQEDQGLTKDYGNSPLHRFKKPGSKNFQNIF PPSATLHLSNIPPSVSEEDLKVLFSSNGGVVKGFKFFQKDRKMALIQMGS VEEAVQALIDLHNHDLGENHHLRVSFSKSTI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaGil A Sharp P A Jamison S F Garcia Blanco M A 1991 Characterization of cDNAs encoding the polypyrimidine tract binding protein Genes Dev 5 1224 1236 PMID 1906035 DOI 10 1101 gad 5 7 1224 Patton J G Mayer S A Tempst P Nadal Ginard B 1991 Characterization and molecular cloning of polypyrimidine tract binding protein a component of a complex necessary for pre mRNA splicing Genes Dev 5 1237 1251 PMID 1906036 DOI 10 1101 gad 5 7 1237 Ghetti A Pinol Roma S Michael W Morandi C Dreyfuss G 1992 hnRNP I the polypyrimidine tract binding protein distinct nuclear localization and association with hnRNAs Nucleic Acids Res 20 3671 3678 PMID 1641332 DOI 10 1093 nar 20 14 3671 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lin J C Tarn W Y 2005 Exon selection in alpha tropomyosin mRNA is regulated by the antagonistic action of RBM4 and PTB Mol Cell Biol 25 10111 10121 PMID 16260624 DOI 10 1128 MCB 25 22 10111 10121 2005 Lin J C Tarn W Y 2011 RBM4 down regulates PTB and antagonizes its activity in muscle cell specific alternative splicing J Cell Biol 193 509 520 PMID 21518792 DOI 10 1083 jcb 201007131PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9583 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 7 lyutogo 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi