ITGA4 (англ. Integrin subunit alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 114 900.
ITGA4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ITGA4, CD49D, IA4, integrin subunit alpha 4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 GeneCards: ITGA4 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 181.46 – 181.54 Mb | Хр. 2: 79.09 – 79.16 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAWEARREPG | PRRAAVRETV | MLLLCLGVPT | GRPYNVDTES | ALLYQGPHNT | ||||
LFGYSVVLHS | HGANRWLLVG | APTANWLANA | SVINPGAIYR | CRIGKNPGQT | ||||
CEQLQLGSPN | GEPCGKTCLE | ERDNQWLGVT | LSRQPGENGS | IVTCGHRWKN | ||||
IFYIKNENKL | PTGGCYGVPP | DLRTELSKRI | APCYQDYVKK | FGENFASCQA | ||||
GISSFYTKDL | IVMGAPGSSY | WTGSLFVYNI | TTNKYKAFLD | KQNQVKFGSY | ||||
LGYSVGAGHF | RSQHTTEVVG | GAPQHEQIGK | AYIFSIDEKE | LNILHEMKGK | ||||
KLGSYFGASV | CAVDLNADGF | SDLLVGAPMQ | STIREEGRVF | VYINSGSGAV | ||||
MNAMETNLVG | SDKYAARFGE | SIVNLGDIDN | DGFEDVAIGA | PQEDDLQGAI | ||||
YIYNGRADGI | SSTFSQRIEG | LQISKSLSMF | GQSISGQIDA | DNNGYVDVAV | ||||
GAFRSDSAVL | LRTRPVVIVD | ASLSHPESVN | RTKFDCVENG | WPSVCIDLTL | ||||
CFSYKGKEVP | GYIVLFYNMS | LDVNRKAESP | PRFYFSSNGT | SDVITGSIQV | ||||
SSREANCRTH | QAFMRKDVRD | ILTPIQIEAA | YHLGPHVISK | RSTEEFPPLQ | ||||
PILQQKKEKD | IMKKTINFAR | FCAHENCSAD | LQVSAKIGFL | KPHENKTYLA | ||||
VGSMKTLMLN | VSLFNAGDDA | YETTLHVKLP | VGLYFIKILE | LEEKQINCEV | ||||
TDNSGVVQLD | CSIGYIYVDH | LSRIDISFLL | DVSSLSRAEE | DLSITVHATC | ||||
ENEEEMDNLK | HSRVTVAIPL | KYEVKLTVHG | FVNPTSFVYG | SNDENEPETC | ||||
MVEKMNLTFH | VINTGNSMAP | NVSVEIMVPN | SFSPQTDKLF | NILDVQTTTG | ||||
ECHFENYQRV | CALEQQKSAM | QTLKGIVRFL | SKTDKRLLYC | IKADPHCLNF | ||||
LCNFGKMESG | KEASVHIQLE | GRPSILEMDE | TSALKFEIRA | TGFPEPNPRV | ||||
IELNKDENVA | HVLLEGLHHQ | RPKRYFTIVI | ISSSLLLGLI | VLLLISYVMW | ||||
KAGFFKRQYK | SILQEENRRD | SWSYINSKSN | DD |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.
Література
- Rubio M., Nueda A., Vara A., Corbi-Lopez A.L. (1992). A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80/70 forms of the alpha subunit of VLA4. Eur. J. Immunol. 22: 1099—1102. PMID 1551405 DOI:10.1002/eji.1830220434
- Szabo M.C., McIntyre B.W. (1995). Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit. Mol. Immunol. 32: 1453—1454. PMID 8643114 DOI:10.1016/0161-5890(96)00001-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rosen G.D., Birkenmeier T.M., Dean D.C. (1991). Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4094—4098. PMID 2034655 DOI:10.1073/pnas.88.10.4094
- Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
- Luissint A.C., Lutz P.G., Calderwood D.A., Couraud P.O., Bourdoulous S. (2008). JAM-L-mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation. J. Cell Biol. 183: 1159—1173. PMID 19064666 DOI:10.1083/jcb.200805061
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6140 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ITGA4 angl Integrin subunit alpha 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 032 aminokislot a molekulyarna masa 114 900 ITGA4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4HKC 3V4P 3V4V 5FPI 5C7ZIdentifikatoriSimvoliITGA4 CD49D IA4 integrin subunit alpha 4Zovnishni ID OMIM 192975 MGI 96603 HomoloGene 37364 GeneCards ITGA4Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding protein antigen binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0003823 GO 0051635 antigen binding fibronectin binding cell adhesion molecule binding coreceptor activity C X3 C chemokine binding protein heterodimerization activityKlitinna komponenta ekzosoma integral component of membrane membrana focal adhesion cell surface integrin alpha4 beta7 complex integrin complex klitinna membrana growth cone neuronal cell body GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces endodermal cell differentiation B cell differentiation positive regulation of T cell migration extracellular matrix organization heterotypic cell cell adhesion substrate adhesion dependent cell spreading cellular response to cytokine stimulus cell matrix adhesion involved in ameboidal cell migration cell matrix adhesion leukocyte tethering or rolling Diapedez regulation of immune response integrin mediated signaling pathway leukocyte migration positive regulation of leukocyte tethering or rolling positive regulation of leukocyte cell cell adhesion positive regulation of leukocyte migration import into cell leukocyte cell cell adhesion negative regulation of protein homodimerization activity clathrin dependent extracellular exosome endocytosis adgeziya klitin receptor clustering cell cell adhesion mediated by integrin axonogenesis involved in innervation cell cell adhesion in response to extracellular stimulus cellular response to amyloid beta positive regulation of vascular endothelial cell proliferation neuron projection extension positive regulation of endothelial cell apoptotic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3676 16401Ensembl ENSG00000115232 ENSMUSG00000027009UniProt P13612 Q00651RefSeq mRNK NM 000885 NM 001316312NM 010576RefSeq bilok NP 000876 NP 001303241NP 034706Lokus UCSC Hr 2 181 46 181 54 MbHr 2 79 09 79 16 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNT LFGYSVVLHSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQT CEQLQLGSPNGEPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKN IFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQA GISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSY LGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAV MNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAI YIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAV GAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTL CFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQV SSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLA VGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEV TDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATC ENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGSNDENEPETC MVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTG ECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRV IELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMW KAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u membrani LiteraturaRubio M Nueda A Vara A Corbi Lopez A L 1992 A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80 70 forms of the alpha subunit of VLA4 Eur J Immunol 22 1099 1102 PMID 1551405 DOI 10 1002 eji 1830220434 Szabo M C McIntyre B W 1995 Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit Mol Immunol 32 1453 1454 PMID 8643114 DOI 10 1016 0161 5890 96 00001 6 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Rosen G D Birkenmeier T M Dean D C 1991 Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter Proc Natl Acad Sci U S A 88 4094 4098 PMID 2034655 DOI 10 1073 pnas 88 10 4094 Takada Y Strominger J L Hemler M E 1987 The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis Proc Natl Acad Sci U S A 84 3239 3243 PMID 3033641 DOI 10 1073 pnas 84 10 3239 Luissint A C Lutz P G Calderwood D A Couraud P O Bourdoulous S 2008 JAM L mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation J Cell Biol 183 1159 1173 PMID 19064666 DOI 10 1083 jcb 200805061PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6140 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 6 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi