Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

PRDM1 англ PR SET domain 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 6 ї хромосоми

PRDM1

PRDM1

PRDM1 (англ. PR/SET domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 825 амінокислот, а молекулярна маса — 91 771.

PRDM1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PRDM1, BLIMP1, PRDI-BF1, PR domain 1, PR/SET domain 1
Зовнішні ІД OMIM: 603423 MGI: 99655 HomoloGene: 925 GeneCards: PRDM1
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
639
12142
Ensembl
ENSG00000057657
ENSMUSG00000038151
UniProt
O75626
Q60636
RefSeq (мРНК)
NM_001198
NM_182907
NM_007548
RefSeq (білок)
NP_001189
NP_878911
Локус (UCSC) Хр. 6: 105.99 – 106.11 Mb Хр. 10: 44.31 – 44.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MLDICLEKRVGTTLAAPKCNSSTVRFQGLAEGTKGTMKMDMEDADMTLWT
EAEFEEKCTYIVNDHPWDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIG
VMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTVPKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDG
FNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWY
CRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSV
KEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYP
IRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSS
SPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPP
AFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNL
LGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPAPHSAFSFTG
AAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLI
KNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGE
RPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHL
RLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLC
SLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDIS
VISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLM
KLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Keller A.D., Maniatis T. (1991). Identification and characterization of a novel repressor of beta-interferon gene expression. Genes Dev. 5: 868—879. PMID 1851123 DOI:10.1101/gad.5.5.868
  • Gyory I., Fejer G., Ghosh N., Seto E., Wright K.L. (2003). Identification of a functionally impaired positive regulatory domain I binding factor 1 transcription repressor in myeloma cell lines. J. Immunol. 170: 3125—3133. PMID 12626569 DOI:10.4049/jimmunol.170.6.3125
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Julaton V.T., Reijo Pera R.A. (2011). NANOS3 function in human germ cell development. Hum. Mol. Genet. 20: 2238—2250. PMID 21421998 DOI:10.1093/hmg/ddr114

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9346 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

PRDM1 angl PR SET domain 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 825 aminokislot a molekulyarna masa 91 771 PRDM1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3DALIdentifikatoriSimvoliPRDM1 BLIMP1 PRDI BF1 PR domain 1 PR SET domain 1Zovnishni ID OMIM 603423 MGI 99655 HomoloGene 925 GeneCards PRDM1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity DNA binding sequence specific DNA binding histone deacetylase binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding promoter specific chromatin binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding chromatin DNA bindingKlitinna komponenta citoplazma klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces germ cell development trophoblast giant cell differentiation cardiac septum development cell fate commitment heart valve development GO 0009373 regulation of transcription DNA templated ventricular septum development intestinal epithelial cell development positive regulation of B cell differentiation embryonic placenta development in utero embryonic development GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II post embryonic development coronary vasculature development negative regulation of gene expression morphogenesis of a branching structure transcription DNA templated negative regulation of lipopolysaccharide mediated signaling pathway aorta development Metilyuvannya GO 1901313 positive regulation of gene expression maternal placenta development regulation of cell population proliferation artery morphogenesis eye photoreceptor cell development sebum secreting cell proliferation negative regulation of B cell proliferation adaptivna imunna vidpovid proces imunnoyi sistemi regulation of natural killer cell differentiation regulation of extrathymic T cell differentiation vrodzhenij imunitet regulation of NK T cell differentiationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez639 12142Ensembl ENSG00000057657 ENSMUSG00000038151UniProt O75626 Q60636RefSeq mRNK NM 001198 NM 182907NM 007548RefSeq bilok NP 001189 NP 878911NP 031574 NP 001392858 NP 001392859 NP 001392860 NP 001392861NP 001392862 NP 001392863 NP 001392864 NP 001392865Lokus UCSC Hr 6 105 99 106 11 MbHr 10 44 31 44 4 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLDICLEKRVGTTLAAPKCNSSTVRFQGLAEGTKGTMKMDMEDADMTLWT EAEFEEKCTYIVNDHPWDSGADGGTSVQAEASLPRNLLFKYATNSEEVIG VMSKEYIPKGTRFGPLIGEIYTNDTVPKNANRKYFWRIYSRGELHHFIDG FNEEKSNWMRYVNPAHSPREQNLAACQNGMNIYFYTIKPIPANQELLVWY CRDFAERLHYPYPGELTMMNLTQTQSSLKQPSTEKNELCPKNVPKREYSV KEILKLDSNPSKGKDLYRSNISPLTSEKDLDDFRRRGSPEMPFYPRVVYP IRAPLPEDFLKASLAYGIERPTYITRSPIPSSTTPSPSARSSPDQSLKSS SPHSSPGNTVSPVGPGSQEHRDSYAYLNASYGTEGLGSYPGYAPLPHLPP AFIPSYNAHYPKFLLPPYGMNCNGLSAVSSMNGINNFGLFPRLCPVYSNL LGGGSLPHPMLNPTSLPSSLPSDGARRLLQPEHPREVLVPAPHSAFSFTG AAASMKDKACSPTSGSPTAGTAATAEHVVQPKATSAAMAAPSSDEAMNLI KNKRNMTGYKTLPYPLKKQNGKIKYECNVCAKTFGQLSNLKVHLRVHSGE RPFKCQTCNKGFTQLAHLQKHYLVHTGEKPHECQVCHKRFSSTSNLKTHL RLHSGEKPYQCKVCPAKFTQFVHLKLHKRLHTRERPHKCSQCHKNYIHLC SLKVHLKGNCAAAPAPGLPLEDLTRINEEIEKFDISDNADRLEDVEDDIS VISVVEKEILAVVRKEKEETGLKVSLQRNMGNGLLSSGCSLYESSDLPLM KLPPSNPLPLVPVKVKQETVEPMDP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz represoriv metiltransferaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak adaptivnij imunitet imunitet vrodzhenij imunitet transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK S adenozil L metioninom Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaKeller A D Maniatis T 1991 Identification and characterization of a novel repressor of beta interferon gene expression Genes Dev 5 868 879 PMID 1851123 DOI 10 1101 gad 5 5 868 Gyory I Fejer G Ghosh N Seto E Wright K L 2003 Identification of a functionally impaired positive regulatory domain I binding factor 1 transcription repressor in myeloma cell lines J Immunol 170 3125 3133 PMID 12626569 DOI 10 4049 jimmunol 170 6 3125 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Julaton V T Reijo Pera R A 2011 NANOS3 function in human germ cell development Hum Mol Genet 20 2238 2250 PMID 21421998 DOI 10 1093 hmg ddr114PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9346 angl Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 1 veresnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij

Дата публікації:
Топ