Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TRIM5 англ Tripartite motif containing 5 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

TRIM5

TRIM5

TRIM5 (англ. Tripartite motif containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 56 338.

TRIM5
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TRIM5, RNF88, TRIM5alpha, tripartite motif containing 5
Зовнішні ІД OMIM: 608487 MGI: 4821183 HomoloGene: 75345 GeneCards: TRIM5
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
85363
319236
Ensembl
ENSG00000132256
ENSMUSG00000057143
UniProt
Q9C035
D3Z3L3
RefSeq (мРНК)
NM_033034
NM_033092
NM_033093
NM_001146007
NM_175677
RefSeq (білок)
NP_149023
NP_149083
NP_149084
NP_001139479
NP_783608
Локус (UCSC) Хр. 11: 5.66 – 5.94 Mb Хр. 7: 103.99 – 104 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKSMLDK
GESSCPVCRISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSPEGQKVDHCARHGE
KLLLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLR
QKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDKTNVLADFEQLRDILDWEESNEL
QNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHRLQGSVMELLQGV
DGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYWVD
VTVAPNNISCAVISEDKRQVSSPKPQIIYGARGTRYQTFVNFNYCTGILG
SQSITSGKHYWEVDVSKKTAWILGVCAGFQPDAMCNIEKNENYQPKYGYW
VIGLEEGVKCSAFQDSSFHTPSVPFIVPLSVIICPDRVGVFLDYEACTVS
FFNITNHGFLIYKFSHCSFSQPVFPYLNPRKCGVPMTLCSPSS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, автофагія, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Yap M.W., Nisole S., Lynch C., Stoye J.P. (2004). Trim5alpha protein restricts both HIV-1 and murine leukemia virus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10786—10791. PMID 15249690 DOI:10.1073/pnas.0402876101
  • Sawyer S.L., Wu L.I., Akey J.M., Emerman M., Malik H.S. (2006). High-frequency persistence of an impaired allele of the retroviral defense gene TRIM5alpha in humans. Curr. Biol. 16: 95—100. PMID 16401428 DOI:10.1016/j.cub.2005.11.045
  • Yamauchi K., Wada K., Tanji K., Tanaka M., Kamitani T. (2008). Ubiquitination of E3 ubiquitin ligase TRIM5 alpha and its potential role. FEBS J. 275: 1540—1555. PMID 18312418 DOI:10.1111/j.1742-4658.2008.06313.x
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Passerini L.D., Keckesova Z., Towers G.J. (2006). Retroviral restriction factors Fv1 and TRIM5alpha act independently and can compete for incoming virus before reverse transcription. J. Virol. 80: 2100—2105. PMID 16474118 DOI:10.1128/JVI.80.5.2100-2105.2006
  • Li Y., Li X., Stremlau M., Lee M., Sodroski J. (2006). Removal of arginine 332 allows human TRIM5alpha to bind human immunodeficiency virus capsids and to restrict infection. J. Virol. 80: 6738—6744. PMID 16809279 DOI:10.1128/JVI.00270-06

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до .


image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TRIM5 angl Tripartite motif containing 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 493 aminokislot a molekulyarna masa 56 338 TRIM5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2ECV 2YRGIdentifikatoriSimvoliTRIM5 RNF88 TRIM5alpha tripartite motif containing 5Zovnishni ID OMIM 608487 MGI 4821183 HomoloGene 75345 GeneCards TRIM5Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein macromolecule adaptor activity protein homodimerization activity GO 0008329 pattern recognition receptor activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding protein kinase binding transferase activity GO 0050372 ubiquitin protein transferase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma omegasome vnutrishnoklitinnij klitinne yadro P bodyBiologichnij proces regulation of lipopolysaccharide mediated signaling pathway interferon gamma mediated signaling pathway protein K63 linked ubiquitination proces imunnoyi sistemi protein trimerization positive regulation of DNA binding transcription factor activity regulation of protein localization avtofagiya positive regulation of NF kappaB transcription factor activity defense response to virus Ubikvitin zalezhnij proteoliz activation of innate immune response positive regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling vrodzhenij imunitet GO 0022415 viral process positive regulation of MAPK cascade pattern recognition receptor signaling pathway negative regulation of viral entry into host cellDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez85363 319236Ensembl ENSG00000132256 ENSMUSG00000057143UniProt Q9C035 D3Z3L3RefSeq mRNK NM 033034 NM 033092 NM 033093NM 001146007 NM 175677RefSeq bilok NP 149023 NP 149083 NP 149084NP 001139479 NP 783608Lokus UCSC Hr 11 5 66 5 94 MbHr 7 103 99 104 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKSMLDK GESSCPVCRISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSPEGQKVDHCARHGE KLLLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLR QKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDKTNVLADFEQLRDILDWEESNEL QNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHRLQGSVMELLQGV DGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYWVD VTVAPNNISCAVISEDKRQVSSPKPQIIYGARGTRYQTFVNFNYCTGILG SQSITSGKHYWEVDVSKKTAWILGVCAGFQPDAMCNIEKNENYQPKYGYW VIGLEEGVKCSAFQDSSFHTPSVPFIVPLSVIICPDRVGVFLDYEACTVS FFNITNHGFLIYKFSHCSFSQPVFPYLNPRKCGVPMTLCSPSS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet vzayemodiya hazyayin virus ubikvitinuvannya bilkiv avtofagiya protivirusnij zahist acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaYap M W Nisole S Lynch C Stoye J P 2004 Trim5alpha protein restricts both HIV 1 and murine leukemia virus Proc Natl Acad Sci U S A 101 10786 10791 PMID 15249690 DOI 10 1073 pnas 0402876101 Sawyer S L Wu L I Akey J M Emerman M Malik H S 2006 High frequency persistence of an impaired allele of the retroviral defense gene TRIM5alpha in humans Curr Biol 16 95 100 PMID 16401428 DOI 10 1016 j cub 2005 11 045 Yamauchi K Wada K Tanji K Tanaka M Kamitani T 2008 Ubiquitination of E3 ubiquitin ligase TRIM5 alpha and its potential role FEBS J 275 1540 1555 PMID 18312418 DOI 10 1111 j 1742 4658 2008 06313 x The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Passerini L D Keckesova Z Towers G J 2006 Retroviral restriction factors Fv1 and TRIM5alpha act independently and can compete for incoming virus before reverse transcription J Virol 80 2100 2105 PMID 16474118 DOI 10 1128 JVI 80 5 2100 2105 2006 Li Y Li X Stremlau M Lee M Sodroski J 2006 Removal of arginine 332 allows human TRIM5alpha to bind human immunodeficiency virus capsids and to restrict infection J Virol 80 6738 6744 PMID 16809279 DOI 10 1128 JVI 00270 06PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 12 chervnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 11 Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ