ZEB2 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 136 447.
ZEB2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ZEB2, HSPC082, SIP-1, SIP1, SMADIP1, ZFHX1B, zinc finger E-box binding homeobox 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605802 MGI: 1344407 HomoloGene: 8868 GeneCards: ZEB2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
шизофренія, Рак нирки, Mowat-Wilson syndrome | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 144.36 – 144.52 Mb | Хр. 2: 44.87 – 45.01 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKQPIMADGP | RCKRRKQANP | RRKNVVNYDN | VVDTGSETDE | EDKLHIAEDD | ||||
GIANPLDQET | SPASVPNHES | SPHVSQALLP | REEEEDEIRE | GGVEHPWHNN | ||||
EILQASVDGP | EEMKEDYDTM | GPEATIQTAI | NNGTVKNANC | TSDFEEYFAK | ||||
RKLEERDGHA | VSIEEYLQRS | DTAIIYPEAP | EELSRLGTPE | ANGQEENDLP | ||||
PGTPDAFAQL | LTCPYCDRGY | KRLTSLKEHI | KYRHEKNEEN | FSCPLCSYTF | ||||
AYRTQLERHM | VTHKPGTDQH | QMLTQGAGNR | KFKCTECGKA | FKYKHHLKEH | ||||
LRIHSGEKPY | ECPNCKKRFS | HSGSYSSHIS | SKKCIGLISV | NGRMRNNIKT | ||||
GSSPNSVSSS | PTNSAITQLR | NKLENGKPLS | MSEQTGLLKI | KTEPLDFNDY | ||||
KVLMATHGFS | GTSPFMNGGL | GATSPLGVHP | SAQSPMQHLG | VGMEAPLLGF | ||||
PTMNSNLSEV | QKVLQIVDNT | VSRQKMDCKA | EEISKLKGYH | MKDPCSQPEE | ||||
QGVTSPNIPP | VGLPVVSHNG | ATKSIIDYTL | EKVNEAKACL | QSLTTDSRRQ | ||||
ISNIKKEKLR | TLIDLVTDDK | MIENHNISTP | FSCQFCKESF | PGPIPLHQHE | ||||
RYLCKMNEEI | KAVLQPHENI | VPNKAGVFVD | NKALLLSSVL | SEKGMTSPIN | ||||
PYKDHMSVLK | AYYAMNMEPN | SDELLKISIA | VGLPQEFVKE | WFEQRKVYQY | ||||
SNSRSPSLER | SSKPLAPNSN | PPTKDSLLPR | SPVKPMDSIT | SPSIAELHNS | ||||
VTNCDPPLRL | TKPSHFTNIK | PVEKLDHSRS | NTPSPLNLSS | TSSKNSHSSS | ||||
YTPNSFSSEE | LQAEPLDLSL | PKQMKEPKSI | IATKNKTKAS | SISLDHNSVS | ||||
SSSENSDEPL | NLTFIKKEFS | NSNNLDNKST | NPVFSMNPFS | AKPLYTALPP | ||||
QSAFPPATFM | PPVQTSIPGL | RPYPGLDQMS | FLPHMAYTYP | TGAATFADMQ | ||||
QRRKYQRKQG | FQGELLDGAQ | DYMSGLDDMT | DSDSCLSRKK | IKKTESGMYA | ||||
CDLCDKTFQK | SSSLLRHKYE | HTGKRPHQCQ | ICKKAFKHKH | HLIEHSRLHS | ||||
GEKPYQCDKC | GKRFSHSGSY | SQHMNHRYSY | CKREAEEREA | AEREAREKGH | ||||
LEPTELLMNR | AYLQSITPQG | YSDSEERESM | PRDGESEKEH | EKEGEDGYGK | ||||
LGRQDGDEEF | EEEEEESENK | SMDTDPETIR | DEEETGDHSM | DDSSEDGKME | ||||
TKSDHEEDNM | EDGM |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з ZEB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ZEB2 angl Zinc finger E box binding homeobox 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 214 aminokislot a molekulyarna masa 136 447 ZEB2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2DA7IdentifikatoriSimvoliZEB2 HSPC082 SIP 1 SIP1 SMADIP1 ZFHX1B zinc finger E box binding homeobox 2Zovnishni ID OMIM 605802 MGI 1344407 HomoloGene 8868 GeneCards ZEB2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyashizofreniya Rak nirki Mowat Wilson syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding phosphatase regulator activity zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific R SMAD binding sequence specific DNA binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta klitinne yadro yaderce gialoplazmaBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated nejrobiologiya rozvitku transcription DNA templated positive regulation of melanin biosynthetic process GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II neural crest cell migration somitogenesis neural tube closure transcription by RNA polymerase II central nervous system development corpus callosum morphogenesis hippocampus development cell proliferation in forebrain corticospinal tract morphogenesis positive regulation of Wnt signaling pathway positive regulation of JUN kinase activity positive regulation of melanocyte differentiation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II developmental pigmentation embryonic morphogenesis collateral sprouting positive regulation of axonogenesis mammillary axonal complex development melanocyte migration positive regulation of lens fiber cell differentiation regulation of melanosome organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9839 24136Ensembl ENSG00000169554 ENSMUSG00000026872UniProt O60315 Q9R0G7RefSeq mRNK NM 001171653 NM 014795NM 015753 NM 001289521 NM 001355288 NM 001355289 NM 001355290NM 001355291RefSeq bilok NP 001165124 NP 055610NP 001276450 NP 056568 NP 001342217 NP 001342218 NP 001342219NP 001342220Lokus UCSC Hr 2 144 36 144 52 MbHr 2 44 87 45 01 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKQPIMADGPRCKRRKQANPRRKNVVNYDNVVDTGSETDEEDKLHIAEDD GIANPLDQETSPASVPNHESSPHVSQALLPREEEEDEIREGGVEHPWHNN EILQASVDGPEEMKEDYDTMGPEATIQTAINNGTVKNANCTSDFEEYFAK RKLEERDGHAVSIEEYLQRSDTAIIYPEAPEELSRLGTPEANGQEENDLP PGTPDAFAQLLTCPYCDRGYKRLTSLKEHIKYRHEKNEENFSCPLCSYTF AYRTQLERHMVTHKPGTDQHQMLTQGAGNRKFKCTECGKAFKYKHHLKEH LRIHSGEKPYECPNCKKRFSHSGSYSSHISSKKCIGLISVNGRMRNNIKT GSSPNSVSSSPTNSAITQLRNKLENGKPLSMSEQTGLLKIKTEPLDFNDY KVLMATHGFSGTSPFMNGGLGATSPLGVHPSAQSPMQHLGVGMEAPLLGF PTMNSNLSEVQKVLQIVDNTVSRQKMDCKAEEISKLKGYHMKDPCSQPEE QGVTSPNIPPVGLPVVSHNGATKSIIDYTLEKVNEAKACLQSLTTDSRRQ ISNIKKEKLRTLIDLVTDDKMIENHNISTPFSCQFCKESFPGPIPLHQHE RYLCKMNEEIKAVLQPHENIVPNKAGVFVDNKALLLSSVLSEKGMTSPIN PYKDHMSVLKAYYAMNMEPNSDELLKISIAVGLPQEFVKEWFEQRKVYQY SNSRSPSLERSSKPLAPNSNPPTKDSLLPRSPVKPMDSITSPSIAELHNS VTNCDPPLRLTKPSHFTNIKPVEKLDHSRSNTPSPLNLSSTSSKNSHSSS YTPNSFSSEELQAEPLDLSLPKQMKEPKSIIATKNKTKASSISLDHNSVS SSSENSDEPLNLTFIKKEFSNSNNLDNKSTNPVFSMNPFSAKPLYTALPP QSAFPPATFMPPVQTSIPGLRPYPGLDQMSFLPHMAYTYPTGAATFADMQ QRRKYQRKQGFQGELLDGAQDYMSGLDDMTDSDSCLSRKKIKKTESGMYA CDLCDKTFQKSSSLLRHKYEHTGKRPHQCQICKKAFKHKHHLIEHSRLHS GEKPYQCDKCGKRFSHSGSYSQHMNHRYSYCKREAEEREAAEREAREKGH LEPTELLMNRAYLQSITPQGYSDSEERESMPRDGESEKEHEKEGEDGYGK LGRQDGDEEFEEEEEESENKSMDTDPETIRDEEETGDHSMDDSSEDGKME TKSDHEEDNMEDGM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi polimorfizm acetilyaciya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Long J Zuo D Park M 2005 Pc2 mediated sumoylation of Smad interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E cadherin J Biol Chem 280 35477 35489 PMID 16061479 DOI 10 1074 jbc M504477200 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ZEB2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 listopada 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 13 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi