Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

EGR1 англ Early growth response 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 5 ї хро

EGR1

EGR1

EGR1 (англ. Early growth response 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 57 507.

EGR1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи EGR1, AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, early growth response 1
Зовнішні ІД OMIM: 128990 MGI: 95295 HomoloGene: 56394 GeneCards: EGR1
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1958
13653
Ensembl
ENSG00000120738
ENSMUSG00000038418
UniProt
P18146
P08046
RefSeq (мРНК)
NM_001964
NM_007913
RefSeq (білок)
NP_001955
NP_031939
Локус (UCSC) Хр. 5: 138.47 – 138.47 Mb Хр. 18: 34.99 – 35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLG
AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHL
TAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLW
PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLSCAVPSNDSS
PIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAYPAAKGGFQVP
MIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG
SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFS
RSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDI
CGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSY
PSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYS
SVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTIEIC

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Suggs S.V., Katzowitz J.L., Tsai-Morris C.-H., Sukhatme V.P. (1990). cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr-1. Nucleic Acids Res. 18: 4283—4283. PMID 2377485 DOI:10.1093/nar/18.14.4283
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cullen E.M., Brazil J.C., O'Connor C.M. (2010). Mature human neutrophils constitutively express the transcription factor EGR-1. Mol. Immunol. 47: 1701—1709. PMID 20363028 DOI:10.1016/j.molimm.2010.03.003
  • Zandarashvili L., White M.A., Esadze A., Iwahara J. (2015). Structural impact of complete CpG methylation within target DNA on specific complex formation of the inducible transcription factor Egr-1. FEBS Lett. 589: 1748—1753. PMID 25999311 DOI:10.1016/j.febslet.2015.05.022

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

EGR1 angl Early growth response 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 543 aminokislot a molekulyarna masa 57 507 EGR1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4R2A 4R2C 4R2D 4X9JIdentifikatoriSimvoliEGR1 AT225 G0S30 KROX 24 NGFI A TIS8 ZIF 268 ZNF225 early growth response 1Zovnishni ID OMIM 128990 MGI 95295 HomoloGene 56394 GeneCards EGR1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0000975 transcription cis regulatory region binding zv yazuvannya z ionom metalu transcription factor activity RNA polymerase II core promoter proximal region sequence specific binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding histone acetyltransferase binding nucleic acid binding hemi methylated DNA binding double stranded methylated DNA binding zinc ion binding promoter specific chromatin binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta nukleoplazma klitinne yadro citoplazmaBiologichnij proces regulation of apoptotic process cellular response to organic substance GO 0009373 regulation of transcription DNA templated glomerular mesangial cell proliferation GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II response to glucose transcription by RNA polymerase II BMP signaling pathway transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated response to insulin interleukin 1 mediated signaling pathway cellular response to mycophenolic acid T cell differentiation type I interferon signaling pathway positive regulation of glomerular metanephric mesangial cell proliferation cellular response to gamma radiation regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia skeletal muscle cell differentiation cellular response to heparin regulation of protein sumoylation negative regulation of canonical Wnt signaling pathway GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to interleukin 8 response to hypoxia response to ischemia estrus positive regulation of hormone biosynthetic process regulation of progesterone biosynthetic process GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 1901313 positive regulation of gene expression circadian regulation of gene expression locomotor rhythm ritmichnij proces circadian temperature homeostasis positive regulation of neuron death positive regulation of tau protein kinase activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1958 13653Ensembl ENSG00000120738 ENSMUSG00000038418UniProt P18146 P08046RefSeq mRNK NM 001964NM 007913RefSeq bilok NP 001955NP 031939Lokus UCSC Hr 5 138 47 138 47 MbHr 18 34 99 35 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAAAKAEMQLMSPLQISDPFGSFPHSPTMDNYPKLEEMMLLSNGAPQFLG AAGAPEGSGSNSSSSSSGGGGGGGGGSNSSSSSSTFNPQADTGEQPYEHL TAESFPDISLNNEKVLVETSYPSQTTRLPPITYTGRFSLEPAPNSGNTLW PEPLFSLVSGLVSMTNPPASSSSAPSPAASSASASQSPPLSCAVPSNDSS PIYSAAPTFPTPNTDIFPEPQSQAFPGSAGTALQYPPPAYPAAKGGFQVP MIPDYLFPQQQGDLGLGTPDQKPFQGLESRTQQPSLTPLSTIKAFATQSG SQDLKALNTSYQSQLIKPSRMRKYPNRPSKTPPHERPYACPVESCDRRFS RSDELTRHIRIHTGQKPFQCRICMRNFSRSDHLTTHIRTHTGEKPFACDI CGRKFARSDERKRHTKIHLRQKDKKADKSVVASSATSSLSSYPSPVATSY PSPVTTSYPSPATTSYPSPVPTSFSSPGSSTYPSPVHSGFPSPSVATTYS SVPPAFPAQVSSFPSSAVTNSFSASTGLSDMTATFSPRTIEIC A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi polimorfizm Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaSuggs S V Katzowitz J L Tsai Morris C H Sukhatme V P 1990 cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr 1 Nucleic Acids Res 18 4283 4283 PMID 2377485 DOI 10 1093 nar 18 14 4283 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Cullen E M Brazil J C O Connor C M 2010 Mature human neutrophils constitutively express the transcription factor EGR 1 Mol Immunol 47 1701 1709 PMID 20363028 DOI 10 1016 j molimm 2010 03 003 Zandarashvili L White M A Esadze A Iwahara J 2015 Structural impact of complete CpG methylation within target DNA on specific complex formation of the inducible transcription factor Egr 1 FEBS Lett 589 1748 1753 PMID 25999311 DOI 10 1016 j febslet 2015 05 022PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 bereznya 2016 Procitovano 31 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 serpnya 2017 Procitovano 31 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ