POU5F1 (англ. POU class 5 homeobox 1), більш відомий як Oct-4 (octamer-binding transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 38 571.
POU5F1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 GeneCards: POU5F1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
синдром Стівенса — Джонсона | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 31.16 – 31.18 Mb | Хр. 17: 35.82 – 35.82 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAGHLASDFA | FSPPPGGGGD | GPGGPEPGWV | DPRTWLSFQG | PPGGPGIGPG | ||||
VGPGSEVWGI | PPCPPPYEFC | GGMAYCGPQV | GVGLVPQGGL | ETSQPEGEAG | ||||
VGVESNSDGA | SPEPCTVTPG | AVKLEKEKLE | QNPEESQDIK | ALQKELEQFA | ||||
KLLKQKRITL | GYTQADVGLT | LGVLFGKVFS | QTTICRFEAL | QLSFKNMCKL | ||||
RPLLQKWVEE | ADNNENLQEI | CKAETLVQAR | KRKRTSIENR | VRGNLENLFL | ||||
QCPKPTLQQI | SHIAQQLGLE | KDVVRVWFCN | RRQKGKRSSS | DYAQREDFEA | ||||
AGSPFSGGPV | SFPLAPGPHF | GTPGYGSPHF | TALYSSVPFP | EGEAFPPVSV | ||||
TTLGSPMHSN |
Кодований геном білок за функціями належить до , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Takeda J., Seino S., Bell G.I. (1992). Human Oct3 gene family: cDNA sequences, alternative splicing, gene organization, chromosomal location, and expression at low levels in adult tissues. Nucleic Acids Res. 20: 4613—4620. PMID 1408763 DOI:10.1093/nar/20.17.4613
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wey E., Lyons G.E., Schaefer B.W. (1994). A human POU domain gene, mPOU, is expressed in developing brain and specific adult tissues. Eur. J. Biochem. 220: 753—762. PMID 7908264 DOI:10.1111/j.1432-1033.1994.tb18676.x
- Abdel-Rahman B., Fiddler M., Rappolee D., Pergament E. (1995). Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos. Hum. Reprod. 10: 2787—2792. PMID 8567814 DOI:10.1093/oxfordjournals.humrep.a135792
- Lee J., Kim H.K., Han Y.-M., Kim J. (2008). Pyruvate kinase isozyme type M2 (PKM2) interacts and cooperates with Oct-4 in regulating transcription. Int. J. Biochem. Cell Biol. 40: 1043—1054. PMID 18191611 DOI:10.1016/j.biocel.2007.11.009
- Spelat R., Ferro F., Curcio F. (2012). Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation. J. Biol. Chem. 287: 38279—38288. PMID 23024368 DOI:10.1074/jbc.M112.386755
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з POU5F1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 грудня 2014. Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
POU5F1 angl POU class 5 homeobox 1 bilsh vidomij yak Oct 4 octamer binding transcription factor 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 360 aminokislot a molekulyarna masa 38 571 POU5F1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1OCP 3L1PIdentifikatoriSimvoliPOU5F1 OCT3 OCT4 OTF 3 OTF3 OTF4 Oct 3 Oct 4 POU class 5 homeobox 1 Oct3 4Zovnishni ID OMIM 164177 MGI 101893 HomoloGene 8422 GeneCards POU5F1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyasindrom Stivensa Dzhonsona Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding sequence specific DNA binding miRNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity transcription factor binding GO 0000975 transcription cis regulatory region binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific ubiquitin protein ligase binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma transcription regulator complex nukleoplazma klitinne yadro mitohondriyaBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated somatic stem cell population maintenance GO 1905617 negative regulation of gene silencing by miRNA cell fate commitment involved in formation of primary germ layer endodermal cell fate specification anatomical structure morphogenesis mRNA transcription by RNA polymerase II regulation of asymmetric cell division GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated regulation of DNA methylation dependent heterochromatin assembly multicellular organism development cardiac cell fate determination response to wounding BMP signaling pathway involved in heart induction regulyaciya ekspresiyi geniv regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway blastocyst development GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of SMAD protein signal transductionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5460 18999Ensembl ENSG00000230336 ENSG00000206454 ENSG00000204531 ENSG00000237582 ENSG00000229094ENSG00000233911 ENSG00000235068 ENSMUSG00000024406UniProt Q01860 P20263RefSeq mRNK NM 203289 NM 001173531 NM 001285986 NM 001285987 NM 002701NM 001252452 NM 013633RefSeq bilok NP 001167002 NP 001272915 NP 001272916 NP 002692 NP 976034NP 001272915 1NP 001239381 NP 038661Lokus UCSC Hr 6 31 16 31 18 MbHr 17 35 82 35 82 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAGHLASDFAFSPPPGGGGDGPGGPEPGWVDPRTWLSFQGPPGGPGIGPG VGPGSEVWGIPPCPPPYEFCGGMAYCGPQVGVGLVPQGGLETSQPEGEAG VGVESNSDGASPEPCTVTPGAVKLEKEKLEQNPEESQDIKALQKELEQFA KLLKQKRITLGYTQADVGLTLGVLFGKVFSQTTICRFEALQLSFKNMCKL RPLLQKWVEEADNNENLQEICKAETLVQARKRKRTSIENRVRGNLENLFL QCPKPTLQQISHIAQQLGLEKDVVRVWFCNRRQKGKRSSSDYAQREDFEA AGSPFSGGPVSFPLAPGPHFGTPGYGSPHFTALYSSVPFPEGEAFPPVSV TTLGSPMHSN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaTakeda J Seino S Bell G I 1992 Human Oct3 gene family cDNA sequences alternative splicing gene organization chromosomal location and expression at low levels in adult tissues Nucleic Acids Res 20 4613 4620 PMID 1408763 DOI 10 1093 nar 20 17 4613 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Wey E Lyons G E Schaefer B W 1994 A human POU domain gene mPOU is expressed in developing brain and specific adult tissues Eur J Biochem 220 753 762 PMID 7908264 DOI 10 1111 j 1432 1033 1994 tb18676 x Abdel Rahman B Fiddler M Rappolee D Pergament E 1995 Expression of transcription regulating genes in human preimplantation embryos Hum Reprod 10 2787 2792 PMID 8567814 DOI 10 1093 oxfordjournals humrep a135792 Lee J Kim H K Han Y M Kim J 2008 Pyruvate kinase isozyme type M2 PKM2 interacts and cooperates with Oct 4 in regulating transcription Int J Biochem Cell Biol 40 1043 1054 PMID 18191611 DOI 10 1016 j biocel 2007 11 009 Spelat R Ferro F Curcio F 2012 Serine 111 phosphorylation regulates OCT4A protein subcellular distribution and degradation J Biol Chem 287 38279 38288 PMID 23024368 DOI 10 1074 jbc M112 386755PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z POU5F1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 21 grudnya 2014 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 zhovtnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi