MMP9 (англ. Matrix metallopeptidase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 458.
MMP9 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | MMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
cts-1027 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 46.01 – 46.02 Mb | Хр. 2: 164.78 – 164.8 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSLWQPLVLV | LLVLGCCFAA | PRQRQSTLVL | FPGDLRTNLT | DRQLAEEYLY | ||||
RYGYTRVAEM | RGESKSLGPA | LLLLQKQLSL | PETGELDSAT | LKAMRTPRCG | ||||
VPDLGRFQTF | EGDLKWHHHN | ITYWIQNYSE | DLPRAVIDDA | FARAFALWSA | ||||
VTPLTFTRVY | SRDADIVIQF | GVAEHGDGYP | FDGKDGLLAH | AFPPGPGIQG | ||||
DAHFDDDELW | SLGKGVVVPT | RFGNADGAAC | HFPFIFEGRS | YSACTTDGRS | ||||
DGLPWCSTTA | NYDTDDRFGF | CPSERLYTQD | GNADGKPCQF | PFIFQGQSYS | ||||
ACTTDGRSDG | YRWCATTANY | DRDKLFGFCP | TRADSTVMGG | NSAGELCVFP | ||||
FTFLGKEYST | CTSEGRGDGR | LWCATTSNFD | SDKKWGFCPD | QGYSLFLVAA | ||||
HEFGHALGLD | HSSVPEALMY | PMYRFTEGPP | LHKDDVNGIR | HLYGPRPEPE | ||||
PRPPTTTTPQ | PTAPPTVCPT | GPPTVHPSER | PTAGPTGPPS | AGPTGPPTAG | ||||
PSTATTVPLS | PVDDACNVNI | FDAIAEIGNQ | LYLFKDGKYW | RFSEGRGSRP | ||||
QGPFLIADKW | PALPRKLDSV | FEERLSKKLF | FFSGRQVWVY | TGASVLGPRR | ||||
LDKLGLGADV | AQVTGALRSG | RGKMLLFSGR | RLWRFDVKAQ | MVDPRSASEV | ||||
DRMFPGVPLD | THDVFQYREK | AYFCQDRFYW | RVSSRSELNQ | VDQVGYVTYD | ||||
ILQCPED |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sang Q.X., Birkedal-Hansen H., Van Wart H.E. (1995). Proteolytic and non-proteolytic activation of human neutrophil progelatinase B. Biochim. Biophys. Acta. 1251: 99—108. PMID 7669817 DOI:10.1016/0167-4838(95)00086-A
- Masure S., Proost P., van Damme J., Opdenakker G. (1991). Purification and identification of 91-kDa neutrophil gelatinase. Release by the activating peptide interleukin-8. Eur. J. Biochem. 198: 391—398. PMID 1645657 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16027.x
- Cha H., Kopetzki E., Huber R., Lanzendoerfer M., Brandstetter H. (2002). Structural basis of the adaptive molecular recognition by MMP9. J. Mol. Biol. 320: 1065—1079. PMID 12126625 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00558-2
- Sato H., Seiki M. (1993). Regulatory mechanism of 92 kDa type IV collagenase gene expression which is associated with invasiveness of tumor cells. Oncogene. 8: 395—405. PMID 8426746
- Ogata Y., Enghild J.J., Nagase H. (1992). Matrix metalloproteinase 3 (stromelysin) activates the precursor for the human matrix metalloproteinase 9. J. Biol. Chem. 267: 3581—3584. PMID 1371271
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7176 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
MMP9 angl Matrix metallopeptidase 9 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 707 aminokislot a molekulyarna masa 78 458 MMP9Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1GKC 1GKD 1ITV 1L6J 2OVX 2OVZ 2OW0 2OW1 2OW2 4H1Q 4H2E 4H3X 4H82 4HMA 4JIJ 4JQG 4WZV 4XCT 5CUH 5I12IdentifikatoriSimvoliMMP9 CLG4B GELB MANDP2 MMP 9 92 kDa type IV collagenase 92 kDa gelatinase gelatinase B matrix metallopeptidase 9Zovnishni ID OMIM 120361 MGI 97011 HomoloGene 3659 GeneCards MMP9Reaguye na spolukucts 1027Ontologiya genaMolekulyarna funkciya collagen binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0070122 peptidase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding hydrolase activity metallopeptidase activity endopeptidase activity serine type endopeptidase activity metalloendopeptidase activityKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya ekzosoma mizhklitinnij prostir tertiary granule lumen ficolin 1 rich granule lumen extracellular region collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces skeletal system development negative regulation of cation channel activity positive regulation of protein phosphorylation endodermal cell differentiation negative regulation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway osifikaciya negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway ephrin receptor signaling pathway extracellular matrix disassembly negative regulation of apoptotic process proteoliz macrophage differentiation positive regulation of keratinocyte migration positive regulation of apoptotic process collagen catabolic process positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria positive regulation of receptor binding positive regulation of DNA binding positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway embryo implantation leukocyte migration positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation extracellular matrix organization positive regulation of cell migration neutrophil degranulation GO 0072353 cellular response to reactive oxygen species cellular response to cadmium ion cytokine mediated signaling pathway regulation of neuroinflammatory response negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development response to amyloid betaDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4318 17395Ensembl ENSG00000100985 ENSMUSG00000017737UniProt P14780 P41245RefSeq mRNK NM 004994NM 013599RefSeq bilok NP 004985NP 038627Lokus UCSC Hr 20 46 01 46 02 MbHr 2 164 78 164 8 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRRLDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPEDA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz proteaz metaloproteaz Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Sang Q X Birkedal Hansen H Van Wart H E 1995 Proteolytic and non proteolytic activation of human neutrophil progelatinase B Biochim Biophys Acta 1251 99 108 PMID 7669817 DOI 10 1016 0167 4838 95 00086 A Masure S Proost P van Damme J Opdenakker G 1991 Purification and identification of 91 kDa neutrophil gelatinase Release by the activating peptide interleukin 8 Eur J Biochem 198 391 398 PMID 1645657 DOI 10 1111 j 1432 1033 1991 tb16027 x Cha H Kopetzki E Huber R Lanzendoerfer M Brandstetter H 2002 Structural basis of the adaptive molecular recognition by MMP9 J Mol Biol 320 1065 1079 PMID 12126625 DOI 10 1016 S0022 2836 02 00558 2 Sato H Seiki M 1993 Regulatory mechanism of 92 kDa type IV collagenase gene expression which is associated with invasiveness of tumor cells Oncogene 8 395 405 PMID 8426746 Ogata Y Enghild J J Nagase H 1992 Matrix metalloproteinase 3 stromelysin activates the precursor for the human matrix metalloproteinase 9 J Biol Chem 267 3581 3584 PMID 1371271PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Matrix metallopeptidase 9 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 7176 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 20 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi