SP3 (англ. Sp3 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 81 925.
SP3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SP3, SPR2, Sp3 transcription factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601804 MGI: 1277166 HomoloGene: 7952 GeneCards: SP3 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 173.88 – 173.97 Mb | Хр. 2: 72.77 – 72.81 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTAPEKPVKQ | EEMAALDVDS | GGGGGGGGGH | GEYLQQQQQH | GNGAVAAAAA | ||||
AQDTQPSPLA | LLAATCSKIG | PPSPGDDEEE | AAAAAGAPAA | AGATGDLASA | ||||
QLGGAPNRWE | VLSATPTTIK | DEAGNLVQIP | SAATSSGQYV | LPLQNLQNQQ | ||||
IFSVAPGSDS | SNGTVSSVQY | QVIPQIQSAD | GQQVQIGFTG | SSDNGGINQE | ||||
SSQIQIIPGS | NQTLLASGTP | SANIQNLIPQ | TGQVQVQGVA | IGGSSFPGQT | ||||
QVVANVPLGL | PGNITFVPIN | SVDLDSLGLS | GSSQTMTAGI | NADGHLINTG | ||||
QAMDSSDNSE | RTGERVSPDI | NETNTDTDLF | VPTSSSSQLP | VTIDSTGILQ | ||||
QNTNSLTTSS | GQVHSSDLQG | NYIQSPVSEE | TQAQNIQVST | AQPVVQHLQL | ||||
QESQQPTSQA | QIVQGITPQT | IHGVQASGQN | ISQQALQNLQ | LQLNPGTFLI | ||||
QAQTVTPSGQ | VTWQTFQVQG | VQNLQNLQIQ | NTAAQQITLT | PVQTLTLGQV | ||||
AAGGAFTSTP | VSLSTGQLPN | LQTVTVNSID | SAGIQLHPGE | NADSPADIRI | ||||
KEEEPDPEEW | QLSGDSTLNT | NDLTHLRVQV | VDEEGDQQHQ | EGKRLRRVAC | ||||
TCPNCKEGGG | RGTNLGKKKQ | HICHIPGCGK | VYGKTSHLRA | HLRWHSGERP | ||||
FVCNWMYCGK | RFTRSDELQR | HRRTHTGEKK | FVCPECSKRF | MRSDHLAKHI | ||||
KTHQNKKGIH | SSSTVLASVE | AARDDTLITA | GGTTLILANI | QQGSVSGIGT | ||||
VNTSATSNQD | ILTNTEIPLQ | LVTVSGNETM | E |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Hernandez E.M., Johnson A., Notario V., Chen A., Richert J.R. (2002). AUA as a translation initiation site in vitro for the human transcription factor Sp3. J. Biochem. Mol. Biol. 35: 273—282. PMID 12297010 DOI:10.5483/BMBRep.2002.35.3.273
- Moran K.M., Crusio R.H., Chan C.H., Grekova M.C., Richert J.R. (2004). Human transcription factor Sp3: genomic structure, identification of a processed pseudogene, and transcript analysis. Gene. 341: 235—247. PMID 15474306 DOI:10.1016/j.gene.2004.06.055
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Oleksiak M.F., Crawford D.L. (2002). 5' genomic structure of human Sp3. Mol. Biol. Evol. 19: 2026—2029. PMID 12411611 DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004026
- Kingsley C., Winoto A. (1992). Cloning of GT box-binding proteins: a novel Sp1 multigene family regulating T-cell receptor gene expression. Mol. Cell. Biol. 12: 4251—4261. PMID 1341900 DOI:10.1128/MCB.12.10.4251
- Hagen G., Mueller S., Beato M., Suske G. (1992). Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Sp1 related genes. Nucleic Acids Res. 20: 5519—5525. PMID 1454515 DOI:10.1093/nar/20.21.5519
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SP3 angl Sp3 transcription factor bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 781 aminokislot a molekulyarna masa 81 925 SP3IdentifikatoriSimvoliSP3 SPR2 Sp3 transcription factorZovnishni ID OMIM 601804 MGI 1277166 HomoloGene 7952 GeneCards SP3Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding chromatin binding GO 0001158 cis regulatory region sequence specific DNA binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific double stranded DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA bindingKlitinna komponenta PML body transcription repressor complex klitinne yadro nukleoplazma protein DNA complexBiologichnij proces megakaryocyte differentiation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated osifikaciya lung development embryonic placenta development in utero embryonic development GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II monocyte differentiation protein sumoylation transcription DNA templated embryonic skeletal system development GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated embryonic process involved in female pregnancy T cell differentiation granulocyte differentiation embryonic camera type eye morphogenesis trophectodermal cell differentiation enucleate erythrocyte differentiation erythrocyte differentiation definitive hemopoiesis liver development B cell differentiation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II natural killer cell differentiation GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6670 20687Ensembl ENSG00000172845 ENSMUSG00000027109UniProt Q02447 Q86TP0 O70494RefSeq mRNK NM 003111 NM 001017371 NM 001172712NM 001018042 NM 001098425 NM 011450RefSeq bilok NP 001017371 NP 001166183 NP 003102 NP 003102 1NP 001018052 NP 001091895Lokus UCSC Hr 2 173 88 173 97 MbHr 2 72 77 72 81 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MTAPEKPVKQEEMAALDVDSGGGGGGGGGHGEYLQQQQQHGNGAVAAAAAAQDTQPSPLALLAATCSKIGPPSPGDDEEEAAAAAGAPAAAGATGDLASAQLGGAPNRWEVLSATPTTIKDEAGNLVQIPSAATSSGQYVLPLQNLQNQQIFSVAPGSDSSNGTVSSVQYQVIPQIQSADGQQVQIGFTGSSDNGGINQESSQIQIIPGSNQTLLASGTPSANIQNLIPQTGQVQVQGVAIGGSSFPGQTQVVANVPLGLPGNITFVPINSVDLDSLGLSGSSQTMTAGINADGHLINTGQAMDSSDNSERTGERVSPDINETNTDTDLFVPTSSSSQLPVTIDSTGILQQNTNSLTTSSGQVHSSDLQGNYIQSPVSEETQAQNIQVSTAQPVVQHLQLQESQQPTSQAQIVQGITPQTIHGVQASGQNISQQALQNLQLQLNPGTFLIQAQTVTPSGQVTWQTFQVQGVQNLQNLQIQNTAAQQITLTPVQTLTLGQVAAGGAFTSTPVSLSTGQLPNLQTVTVNSIDSAGIQLHPGENADSPADIRIKEEEPDPEEWQLSGDSTLNTNDLTHLRVQVVDEEGDQQHQEGKRLRRVACTCPNCKEGGGRGTNLGKKKQHICHIPGCGKVYGKTSHLRAHLRWHSGERPFVCNWMYCGKRFTRSDELQRHRRTHTGEKKFVCPECSKRFMRSDHLAKHIKTHQNKKGIHSSSTVLASVEAARDDTLITAGGTTLILANIQQGSVSGIGTVNTSATSNQDILTNTEIPLQLVTVSGNETMEA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi polimorfizm acetilyaciya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaHernandez E M Johnson A Notario V Chen A Richert J R 2002 AUA as a translation initiation site in vitro for the human transcription factor Sp3 J Biochem Mol Biol 35 273 282 PMID 12297010 DOI 10 5483 BMBRep 2002 35 3 273 Moran K M Crusio R H Chan C H Grekova M C Richert J R 2004 Human transcription factor Sp3 genomic structure identification of a processed pseudogene and transcript analysis Gene 341 235 247 PMID 15474306 DOI 10 1016 j gene 2004 06 055 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Oleksiak M F Crawford D L 2002 5 genomic structure of human Sp3 Mol Biol Evol 19 2026 2029 PMID 12411611 DOI 10 1093 oxfordjournals molbev a004026 Kingsley C Winoto A 1992 Cloning of GT box binding proteins a novel Sp1 multigene family regulating T cell receptor gene expression Mol Cell Biol 12 4251 4261 PMID 1341900 DOI 10 1128 MCB 12 10 4251 Hagen G Mueller S Beato M Suske G 1992 Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins a family of Sp1 related genes Nucleic Acids Res 20 5519 5525 PMID 1454515 DOI 10 1093 nar 20 21 5519PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 7 kvitnya 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 27 veresnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi