TFAM

TFAM (англ. Transcription factor A, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 246 амінокислот, а молекулярна маса — 29 097.

TFAM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FGH, 3TMM, 3TQ6, 4NNU, 4NOD
Ідентифікатори
Символи	TFAM, MTTF1, MTTFA, TCF6, TCF6L1, TCF6L2, TCF6L3, transcription factor A, mitochondrial, MTDPS15
Зовнішні ІД	OMIM: 600438 MGI: 107810 HomoloGene: 31139 GeneCards: TFAM
Пов'язані генетичні захворювання
mitochondrial DNA depletion syndrome 15 (hepatocerebral type);
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0070361, GO:0070364, GO:0070363, GO:0070362 mitochondrial promoter sequence-specific DNA binding • heat shock protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription coactivator binding • DNA binding, bending • RNA binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • mitochondrial nucleoid • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • DNA-dependent DNA replication • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription by RNA polymerase I • transcription initiation from mitochondrial promoter • mitochondrion organization • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • mitochondrial respiratory chain complex assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • mitochondrial transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7019	21780
Ensembl	ENSG00000108064	ENSMUSG00000003923
UniProt	Q00059	P40630
RefSeq (мРНК)	NM_001270782 NM_003201 NM_012251	NM_009360
RefSeq (білок)	NP_001257711 NP_003192	NP_033386
Локус (UCSC)	Хр. 10: 58.39 – 58.4 Mb	Хр. 10: 71.06 – 71.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAFLRSMWGV		LSALGRSGAE		LCTGCGSRLR		SPFSFVYLPR		WFSSVLASCP
KKPVSSYLRF		SKEQLPIFKA		QNPDAKTTEL		IRRIAQRWRE		LPDSKKKIYQ
DAYRAEWQVY		KEEISRFKEQ		LTPSQIMSLE		KEIMDKHLKR		KAMTKKKELT
LLGKPKRPRS		AYNVYVAERF		QEAKGDSPQE		KLKTVKENWK		NLSDSEKELY
IQHAKEDETR		YHNEMKSWEE		QMIEVGRKDL		LRRTIKKQRK		YGAEEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• Parisi M.A., Clayton D.A. (1991). Similarity of human mitochondrial transcription factor 1 to high mobility group proteins. Science. 252: 965—969. PMID 2035027 DOI:10.1126/science.2035027
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tominaga K., Akiyama S., Kagawa Y., Ohta S. (1992). Upstream region of a genomic gene for human mitochondrial transcription factor 1. Biochim. Biophys. Acta. 1131: 217—219. PMID 1610904 DOI:10.1016/0167-4781(92)90082-B
• McCulloch V., Shadel G.S. (2003). Human mitochondrial transcription factor B1 interacts with the C-terminal activation region of h-mtTFA and stimulates transcription independently of its RNA methyltransferase activity. Mol. Cell. Biol. 23: 5816—5824. PMID 12897151 DOI:10.1128/MCB.23.16.5816-5824.2003
• Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
• Kasashima K., Sumitani M., Endo H. (2012). Maintenance of mitochondrial genome distribution by mitochondrial AAA+ protein ClpX. Exp. Cell Res. 318: 2335—2343. PMID 22841477 DOI:10.1016/j.yexcr.2012.07.012

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TFAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11741 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10